查看Zenodo上的幻灯片

摘要

GROMACS 2024具有新功能,例如与COLVARS(1)的接口、改进的变形选项以及对加速重量直方图(AWH)实现的一些改进。

本次网络研讨会将简要介绍这些主题,重点介绍AWH方法和基于AWH摩擦度量缩放采样目标分布的可能性,以及如何加快自由能计算。

还将描述2023版和2024版中的性能改进,包括GPU加速。

(1) 即将举行的BioExcel网络研讨会(2024年3月19日)将专门针对COLVARS

节目主持人

“Magnus领导着斯德哥尔摩的GROMACS开发团队。自2012年起,他开始在Erik Lindahl实验室担任博士后,一直参与开发工作。2015-2023年,他在一家名为ERCO Pharma的公司工作,使用MD模拟计算皮肤渗透性。Magnus拥有乌普萨拉大学药学硕士学位。他于2011年在斯德哥尔摩大学获得有机化学博士学位,之后在剑桥大学生物化学系做了一年的博士后。”