辣味R
原位细胞术数据的空间分析
生物导体版本：释放（3.19）
spicyR包为细胞分辨率空间组学技术提供了一个框架，用于对细胞类型对之间的空间关系变化进行推断。spicyR由三个主要步骤组成：（i）总结每个图像的细胞类型对之间的空间定位程度；（ii）将定位汇总统计中的可变性建模为细胞计数的函数，以及（iii）测试与响应变量相关的空间定位变化。
作者：尼古拉斯·卡内特[aut]、埃利斯·帕特里克[aut，cre]、尼古拉斯·罗伯逊[ctb]
维护人员：埃利斯·帕特里克（Ellis Patrick at sydney.edu.au）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“spicyR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“spicyR”）
细节
| 生物视图 |
基于细胞的分析,单个单元格,软件,空间 |
| 版本 |
1.16.1 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.11（R-4.0）（4年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
ggplot2,凹地人,生物并行,spastat.explore软件,spastat.geom公司,lmer测试,S4载体、方法、，情势图,爱尔兰航空公司，gr设备，统计，数据表,数字播放器,第三年,骗局,单细胞实验,空间实验,摘要实验,重力,类别R,易怒的,马格里特,克莱 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://ellispatrick.github.io/spicyR网址/ https://github.com/Sydney生物科技/spicyR |
| 错误报告 |
https://github.com/SydneyBioX/spicyR/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
