ggtree公司
树和注释数据可视化的R包
生物导体版本:释放(3.19)
“ggtree”扩展了实现图形语法的“ggplot2”绘图系统ggtree’是为系统发育树和其他树状结构及其注释数据的可视化和注释而设计的。
作者:余光创[aut,cre,cph]
、Tommy Tsan-Yuk Lam[aut,ths]、Shuangbin Xu[aut]
、林莉、布拉德利·琼斯、贾斯汀·西尔弗曼、瓦塔尔·岩崎、夏永和、黄瑞珠
维护人员:Guanghuang Yu(广创语)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ggtree”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“ggtree”)
细节
生物视图 |
对齐,注释,群集,数据导入,多序列对齐,系统发育学,可复制研究,软件,可视化 |
版本 |
3.12.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.1(R-3.2)(9年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
猿,大量,数字播放器,ggplot2(>3.3.6),网格,马格里特、方法、,呜呜声,爱尔兰航空公司,ggfun公司(>= 0.0.9),尤拉布·乌利斯,第三年,潮树(>= 0.4.5),树(treeio)(>=1.8.0),实用程序,规模,统计,克莱 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://www.amazon.com/Integration-Moperation-Visualization-Phylgenetic-Computational-ebook/dp/B0B5NLZR1Z/(书) http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.111/2041-210X.12628(纸) |
错误报告 |
https://github.com/YuLab-SMU/ggtree/issues |
查看更多
建议 |
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链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
ggtreeDendro公司,纠缠 |
导入我 |
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