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博科生物

这是发展Biobase版本;有关稳定发布版本,请参阅博科生物.

生物基:生物导体的基本功能


生物导体版本:发展(3.20)

许多其他软件包需要的功能或替代R功能的功能。

作者:R.Gentleman[aut]、V.Carey[aut]、M.Morgan[aut)、S.Falcon[aut'、Haleema Khan[ctb](从Sweave到Rmarkdown/HTML的“应用”和“生物基开发”小插曲翻译)、生物导体包维护器[cre]

维护人员:生物导体包维护者<Bioconductor.org上的维护者>

引文(从R中输入引文(“Biobase”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)#以下是Bioc-devel的初始化用法BiocManager::安装(版本=“级别”)BiocManager::安装(“Biobase”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“Biobase”)
Biobase和ExpressionSets简介 PDF格式 R脚本
esApply简介 HTML格式 R脚本
eSet开发人员注意事项 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,软件
版本 2.65.0
在生物导体中 BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=2.10),生物遗传学(>=0.27.1),实用程序
进口 方法
系统要求
统一资源定位地址 https://bioconductor.org/packages/Biobase网站
错误报告 https://github.com/Bioconductor/Biobase/issues网站
查看更多
建议 工具,tk小工具,所有,RUnit(运行单位),golubE集,仿生风格,针织物,利马
链接到
增强功能
取决于我 ACME公司,阿菲,临时公司,affy康塔姆,附加核心工具,affyPLM公司,AGDEX公司,目标,阿替克芬,安娜菲,注释Dbi,注释锻造,阵列Express,阵列Mvout,袋子,带子,beadarray公司,巴热,比卡雷,大甜瓜,BioMVC类,生物质量控制,BLMA公司,北极光,摄像机,癌症等级,卡斯珀,类别,类别比较,CCPROMISE公司,CGH基础,CGH呼叫,CGH地区,剪贴画,簇刺,CMA公司,中国农场,代码链接,转换,科帕,冠状病毒,冠状病毒RNA,DEXSeq公司,DFP公司,数字(diggit),doppelgangR型,决策支持系统,染色偏染,电子束阵列,EDASeq公司,边缘,EGSEA公司,表观基因组混合,epvizrData公司,ExiMiR公司,ExpressionAtlas公司,法比亚,事实设计,fastseg公司,流珠,联邦铁路管理局,嘎嘎,基因Meta,基因绘图仪,基因推荐器,基因区域扫描,基因选择MMD,geNet分类器,地理差异,地理浏览器,Geomx工具,地理查询,GOexpress公司,go配置文件,GOstats公司,GSEA基地,GSEA基准,GSEAlm公司,GWA工具,哈法比亚,帮助,啤酒花,HybridM测试,i检查,IdeoViz公司,惯用语,监督,等压线,迭代BMA,IVAS系统,卢米,制作4,地块,膳食,宏基因组序列,MethPed公司,甲基脲,Mfuzz公司,MiChip公司,微生物资源管理器,模仿者,MineICA公司,MiRaGE公司,miR组件,ML接口,MMDiff2(最大差值2),单片眼镜,M数据库,穆尔科姆,多数据集,multtest公司,NanoStringDiff(纳米字符串差异),NanoStringNC工具,纳米管,NOISeq公司,标准化450K,标准PCR,八度音阶,寡聚物,omicRexposome体,有序列表,OTU酶,潘达R,摇晃,pca方法,pdInfoBuilder,百事统计,现象测试,聚对苯二甲酸乙二醇酯,POWSC公司,PREDA公司,pRolocGUI,承诺,qpcr标准,qPLEX分析仪,R453Plus 1工具箱,RbcBook1(笔记本1),罗布苏夫,rcellminer公司,读qPCR,再膨胀体,人民币,单位,R托珀,RUVSeq公司,安全的,扫描。通用产品代码,SeqGSEA公司,SigCheck(信号检查),西格涅斯,单细胞TK,SpeCond(拼写条件),SPEM公司,spk工具,样条线计时器,总结性实验,老虎,平铺阵列,topGO(顶GO),火力发电厂,t跑步机,暮光,撤消,素食主义者,毒蛇,vsn(vsn),瓦特瓜,韦比奥克,XDE公司,纱线,欧洲路径数据库,affycompData公司,所有,bcellViper公司,beadarray示例数据,膀胱批次,布尔格达,癌症数据,CCl4号机组,CLL公司,上校CA,CRCL18公司,管理的乳房数据,管理的卵巢数据,davidTiling公司,数字数据,DLBCL(DLBCL),服装检查,等16秒,fabia数据,纤维Eset,气体YHS,golubEsets公司,GSE103322标准,GSE13015标准,GSE62944型,GSVA数据,哈勃ChIP,Hiiragi 2013年,人性化数据,人类干细胞,伊耶尔517,小背包,leeBam视图,白血病Eset,卢米巴恩斯,lung表达式,MAQ子集,MetaGx乳房,MetaGx卵巢,miRNA目标,msd16秒,mvoutData(mvout数据),Neve2006年,PREDA样本,ProData公司,前列腺癌Camcap,前列腺癌Grasso,前列腺癌斯德哥尔摩,前列腺癌Taylor,前列腺癌Varambally,pumadata公司,rcellminer数据,RUV规范化数据,插入子集,TCGAcrcmiRNA,TCGAcrcmRNA,tweeDEseq计数数据,酵母CC,maEnd到End,count变压器,铬锰合金,dG销售ID,eLNN配对Cov,GWAS(按集群),热敏柔性,国际复兴开发银行,lmQCM公司,MM2数据,MMD差异,prop重叠,统计可视化,TOmicsVis公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物基_2.65.0.tar.gz
Windows二进制 生物基_2.65.0.zip
macOS二进制(x86_64) 生物基_2.65.0.tgz
macOS二进制(arm64) 生物基_2.65.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Biobase网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/生物基
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Biobase网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Biobase网站/
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