根系统发育网络显示集的超立方体和Hamilton圈

@第{Dcker2022HypercubesAH条，title={根系统发育网络显示集的超立方体和哈密尔顿圈}，author={Janosch D{\“o}cker和Simone Linz以及Charles Semple}，日志={高级应用数学}，年份={2022}，体积={152}，页数={102595}，url={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:253510376}}
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2引文

正常网络何时显示一组系统发育树？

提出了一种多项式时间算法，用于重建唯一的二叉正态网络，该网络显示的二叉树集为$\mathcal{P}$，如果存在这样的网络，并且证明了任何两个根的系统发育树都可以由一个正态网络显示，并且该结果不会扩展到两个以上的树。

系统发育网络软连线简约分数的界定

研究表明，半定向网络的软连线简约性分数可以得到一个类似的界，而在父级简约性下，这个界不成立。

37参考文献

树-子系统发育网络的比较

提供了这些网络作为自然数向量的多集合的内射表示，以及它们的路径多重性向量，该表示用于定义此类上的距离，该距离扩展了系统发育树的著名Robinson-Foulds距离，并给出了此类中网络对的对齐方法。

在系统发育网络中定位树

某些系统发育网络上的树平均距离具有唯一确定的权重

提出了一种比树更一般的网络的树平均距离，并证明了在给定网络和树叶之间的树平均间距的情况下，可以计算每个混合顶点的权重和概率。

显性系统发育网络的分类及其生物学和数学意义

对文献中介绍的根系统发育网络的几个亚类（以某些结构约束为特征）进行了彻底审查，以模拟特定的生物现象或进行易于处理的数学和计算分析。

系统发育网络中的非本质弧

构建一个最小细化的五倍体系统发育网络

提出了两种新的从任意度的基因树推断系统发育网络的有效算法RGNet和RGNet，结果表明，这些方法优于现有的邻接、NeighborNet和SpNet方法。

进化树上的子树转移操作及其诱导度量

    本杰明·朗·艾伦M.钢材
    生物学、数学
  • 2001
计算将一棵树转换为另一棵树所需的最小TBR操作数的问题可以简化为一个大小只是树之间距离的函数的问题，从而确定该问题是固定参数可处理的。

基于树的系统发育网络研究

给出了一个简单的充要条件，并证明了任意数量的分类群都存在一个通用的基于树的网络，该网络包含同一分类群上的每个系统发育树作为其基。

不完全谱系排序下最大伪似然系统发育网络的推断

本文提出了一种统计方法，在伪似然框架下从多基因座遗传数据推断系统发育网络，并将其应用于重建剑尾鱼和海蜇之间的进化关系，其特点是广泛的杂交。

快速计算系统发育网络之间的罗宾逊-福兹距离