通过去噪grablet分布比较有向网络

@第{Silva2022条比较DN,title={通过去噪graphlet分布比较有向网络},author={米格尔·E.P.席尔瓦(Miguel E.P.Silva)、罗伯特·冈特(Robert E.Gaunt)、路易斯·奥斯皮纳·福雷罗(Luis Ospina-Forero)、卡罗琳·杰伊(Caroline Jay)和托马斯·豪斯(Thomas A.Ho,journal={J.复杂网络},年份={2022},体积={11},网址={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:250698897}}
这项工作提出了NetEmd到定向网络的扩展,并通过线性投影去噪处理定向情况下graphlet结构复杂性的显著增加,结果表明,该框架能够提高无向netEmd算法到有向情况的简单转换的性能。

有向加权图的最优传输距离:以蜂窝通信网络为例

提出了基于最优运输变量(OT)的最优运输变量的有向图比较的两个距离度量:推土机距离(Wasserstein)和Gromov-Wassersten距离(GW)。

跟踪Mumsnet上疫苗接种讨论的结构和情绪

这项工作研究了如何在Mumsnet(一个以家长为目标的英国网站)的讨论论坛上进行疫苗接种讨论,并显示了Mumsnet上疫苗接种讨论的拓扑结构如何随时间而变化,特别是在新冠肺炎前后。

扩展Graphlets对有向网络的适用性

这项工作通过考虑有向网络的边缘方向,将graphlet的适用性扩展到有向网络,从而为有向生物网络的分析提供了有力的基础,并将该工具与其他最先进的方法进行了比较,验证了它是最快的通用graphlet计数工具。

基于图的有向网络特征

扩展了典型相关分析框架,允许对定向网络的拓扑进行特定域的解释,并从网络布线模式而非序列数据中获得了对酶功能保存的见解。

一种组合的石墨线计数方法

提出了一种新的组合方法,该方法建立了一个方程组,将Graphlet的轨道计数与最多五个节点连接起来,允许通过枚举一个节点来计算所有轨道计数。

通过彩色图形从同构到异构网络对齐

这项工作将同质graphlet扩展到异构graphlet,用于开发一种新的异构节点相似性度量,并将同质NA边缘守恒的最新度量S3扩展到异构Graphlet。

正确评估无对准网络比较方法

结果表明,GCD仍然是最准确、抗噪和计算效率最高的无对齐方法,而NetDis并不像最初声称的那样优于其他方法,同时它的计算成本也更高。

比较网络的比较方法

这项工作审查和分类了一系列网络比较方法,强调了它们所依据的标准及其优缺点,并将这些方法应用于两个现实世界的数据集,即欧洲航空运输网络和粮农组织贸易网络,以讨论从这类分析中得出的结果。

将几何图形拟合到蛋白质相互作用网络

开发了一种算法,该算法采用PPI相互作用数据,并将蛋白质嵌入到低维欧几里德空间,前提是连通性信息对应于touclidean邻近性,如几何-随机图,结果支持PPI网络具有几何结构的假设。

Graphlet分解:框架、算法和应用

本文提供了迄今为止最大的graphlet计算,并利用了许多理论组合参数,使我们能够显著改进graphlet计数的可扩展性。

进化和设计网络的超族

一种系统地研究网络局部结构相似性的方法,基于网络中与随机网络相比的小个子图的显著性轮廓(SP),找到了几个具有非常相似SP的以前不相关网络的超家族。

图形演变:致密化和收缩直径

基于森林火灾蔓延过程,提供了一种新的图形生成器,它具有简单、直观的理由,只需要很少的参数,并生成了显示先前工作和当前研究中观察到的所有特性的图形。
...