NK健身景观交互结构的普适类

@第{条Hwang2017UniversalityCO,title={NK健身景观交互结构的普遍类别},author={黄松明(Sungmin Hwang)、本杰明·施密盖特(Benjamin Schmiegelt)、卢卡·费雷蒂(Luca Ferretti)和约阿希姆·H·A·克鲁格(Joachim H.A.Krug)},journal={统计物理杂志},年份={2017年},体积={172},页码={226-278},url={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:3647952}}
建立了一个统一的框架,用于计算作为L函数的局部适应值最大值的期望数的指数增长率,并识别了两种不同的普适性交互结构类,它们对大k具有不同的渐近性。

随机和结构化健身景观的进化可达性

讨论了适应度景观的概率模型,重点讨论了它们的进化可达性,其中,如果沿着路径遇到的适应度值单调增加,则称适应度景观中的路径是可访问的。

根据距离相关统计数据,在高维健身景观和海景上进行适应性步行

这项工作引入了一大类高维随机适应度景观,其中基因组适应度之间的相关性是遗传距离的一般函数,并研究了这些景观的特性,重点关注最简单的进化过程:随机自适应行走。

健身景观中的进化约束

本文提出了一些基于可及路径之间的相似性和强制性突变“链”的丰富性和特征的进化约束度量方法,即通过具有单个更合适邻居的基因型的路径,并展示了它们如何揭示实验解析景观中的进化约束和可预测性。

字母基数与自适应进化

这项工作发现,增加字母基数的主要效果是引入了一个新的全球适应度峰值,它促进了对不相关适应度景观的适应,但阻碍了对相关适应度场景的适应。

Fisher几何模型中适应值最大值的个数分布

确定了在有限n处取极限L→∞时最大值的数量分布,有助于阐明各种自旋玻璃问题中亚稳态的涨落结构。

健身景观的上位性与适应性

综述了适应度景观理论和实验,讨论了它们对上位性在适应中的作用的影响,并讨论了基于经验适应度景观的理论期望。

笛卡尔幂图上的可达性渗流

这项工作导出了一般$a$的$\beta^\ast$上的一个下界,并推测这一下界对于一大类等位基因图来说是紧的,并且与已发表的多等位基因Hamming图的数值结果相比是有利的。

计算复杂性是进化的终极约束

本文介绍了传统理论中容易出现局部适应度峰值的情况,以及需要花费大量时间才能找到局部最优值的困难情况。

随机健身景观中的可达性渗透3

本章回顾了可及性渗透的研究,这些研究使用概率适应度景观模型来探索路径的出现,如初始适应度函数、景观参数或基因型图结构,并讨论了它们对进化过程可预测性的影响。

崎岖健身环境中人口规模对早期适应的影响

结果表明,不同适应度峰值的可及性是决定这一总体高度是否随种群大小而增加或减少的关键,对于相对较小的种群规模而言,在崎岖的适应环境中的早期适应可能比在大型限制中更为有效和可预测。

NK健身景观的一些特征估计

NK适应度景观的一些渐近特征被简化为关于特征值和Lyapunov指数的问题。

不同交互方案下NK健身景观的自适应步行分析

本文研究了适合度景观的NK模型,其中可以明确定义基因之间的交互模式,并发现景观上局部最大值的分布对交互模式的选择特别敏感。

模块化健身景观的进化可达性

A.A.Perelson和C.S.Macken提出的块模型可视为考夫曼NK模型的特例,可以将可访问路径的数量写为块内路径数的乘积,这为路径统计提供了详细的分析描述。

可调节坚固健身景观的进化可达性

一些可达性度量作为K的函数表现出非单调性,这表明了最稀疏连接的非平凡情况K=1和2的特殊作用,并讨论了健身景观模型和旋转眼镜模型之间的关系。

Fisher几何模型的基因型复杂性

分析表明,表型维度(通常称为表型复杂性)通常与适应环境的复杂性无关,甚至具有单一表型特征的生物体也可能具有复杂的环境。

随机适宜性景观的特性及其对进化动力学的影响。超立方体之旅

基于个体的Wright-Fisher模型用于研究基因型的重组、个体之间的相互作用以及潜在适应环境对这些机制的影响。

适应可调节的坚固健身环境:粗糙的富士山模型

基于Aita等人最初在蛋白质进化背景下引入的粗糙富士山(RMF)模型,提出了一种具有可调粗糙度的简单适应度景观模型,并与MLM模型中的已知行为进行了比较。
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