统计推断的测试模型：显示极限环分岔和双稳态的二维反应系统

@第{Plesa2016TestMF条，title={统计推断的测试模型：显示极限环分岔和双稳态的二维反应系统}，author={Tomislav Plesa和Tom的Vejchodsk和Radek Erban，期刊＝{arXiv:分子网络}，年份={2016年}，页数={3-27}，网址={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:6301666}}
摘要总结了具有二次多项式右手边的二维常微分方程的理论结果，重点介绍了极限环、极限环…
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16引文

用理想抽象解对常微分方程进行化学积分

这项工作提供了对确定性混沌吸引子的模拟，这些吸引子新发现的反应网络与文献中现有的任何化学解释都不等价，并提供了示例性数字，这些数字可能会形成ODE系统集成的成功生化实现路线图。

具有代数和非代数极限环的平面化学反应系统

希尔伯特数$H（n）$被定义为平面自治常微分方程组（ODEs）的极限环的最大数目，该常微分方程组的右手边包含…

反应网络中的噪声诱导混合和多模态

分析了一类具有多时间尺度的质量作用动力学下的化学反应网络，其确定性模型和随机模型显示出质的差异，表明此类网络的长期动力学可以由确定性水平上的唯一吸引子（不稳定性）和多最大值（多峰性）组成.

将动力系统映射为化学反应

准化学映射将适当的状态依赖扰动引入到任何给定的多项式动力系统中，然后在适当的变量大平移下，该系统变为化学系统，并且证明了该映射保留了鲁棒的动力特征，如一般平衡点和极限环，以及时间特性，比如振荡周期。

生化反应网络推理模型与方法综述

研究结果表明，模型、任务和方法的许多组合仍然相对未被探索，并且有许多新的研究机会来探索尚未考虑的组合——也许有充分的理由。

FitzHugh-Nagumo系统的极限环和非同宿轨道研究

本文研究了0I的完备FitzHugh-Nagumo系统。基于1,2的结果，我们讨论了系统同宿轨道的不存在性。此外，我们证明…

近似任意动力学的递归神经化学反应网络

事实证明，RNCRN具有足够多的辅助化学物种和适当的快速反应，可以进行系统训练以实现任何动力学。

基于随机变形的生化反应网络准整数控制

合成生物学的主要目标之一是开发分子控制器，该控制器可以操纵最多部分已知的给定生化网络的动力学。什么时候？…

分子计算中的噪声控制

开发了用于设计生化网络的噪声控制算法，该算法在质量作用动力学下对任何给定的反应网络进行结构修改，从而将可控状态相关噪声引入随机动力学，同时保留确定性动力学。

DNA计算中的噪声控制

开发了用于设计生物化学网络的噪声控制算法，该算法在质量作用动力学下对任何给定的反应网络进行结构修改，以将可控的状态相关噪声引入随机动力学，同时（ii）保留确定性动力学。

54参考文献

一个接近平均场模型SNIPER分支的随机化学系统的分析

结果表明，即使对于平均场模型不振荡的参数值，随机系统也具有振荡解，并研究了这些振荡的平均周期与模型参数和系统大小的依赖性。

化学反应体系中极限环附近的涨落

我们用主方程方法研究了均匀化学反应体系在极限环附近的涨落性质。我们的解决方法基于WKB扩展…

化学反应系统中无滞后的双稳态：共存稳态的非连通分支的情况

两个稳定稳态之间的共存，称为双稳态，通常与系统在两个分支之间来回跳跃的滞后现象有关…

开放二元二次质量作用系统模型中几个极限环的分歧与共存

具有精确可评价极限环振荡的化学反应系统模型

研究了浓度空间中具有两个变量x，y和椭圆极限环的开放化学反应系统模型。从而得出等温和均匀条件及其有效性…

化学反应系统中无滞后的双稳态：多稳态之间不可逆跃迁的理论分析

两个稳定稳态之间的共存，称为双稳态，通常与系统在两个分支之间来回跳跃的滞后现象有关…

平面二次质量作用系统的双hopf分岔

极限环和准循环在含有本征噪声的系统中是如何关联的

这项工作形成了对周期轨道波动的描述，从而可以阐明定点相位的随机振荡和极限环相位的振荡之间的关系。

随机化学反应的准平稳分析：Keizer悖论

结果表明，随机模型在合理的时间尺度上预测了确定性行为，这可以从两个模型中一致地获得，并表明交换无限系统大小和无限时间的极限是有问题的。

Hopf分岔附近介观化学系统中的内噪声效应

在靠近确定性Hopf分岔的参数区域内，对介观化学振荡系统中的内噪声效应进行了解析研究。从化学品开始…
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