{“status”:“ok”,“message type”:“work”,“message version”:“1.0.0”,“message”:{“indexed”:{“date parts”:[[2023,8,19]],“date-time”:“2023-08-19T11:54:30Z”,“timestamp”:1692446070248},“reference count”:60,“publisher”:“Georg Thieme Verlag KG”,“issue”:“02”,“funder”:[{“DOI”:“10.13039\/1000000092”,“name”:“National Library of Medicine”,“DOI asserted by”:“交叉引用”,“奖项”:[“R01LM011370”]}],“内容域”:{“域”:[],“交叉标记-限制”:false},“短容器-时间”:[”应用临床信息“],“发布-打印”:{“日期-部分”:[[2017,4]]},”摘要“:”摘要<\/jats:title>目的:本研究评估了自然语言处理(NLP)工具的准确性和可移植性,该工具用于从两个大型医疗系统的临床笔记中提取流感的临床发现。NLP支持下游流感病例检测用于疾病监测的效果评估<\/锯齿:p>方法:我们独立开发了两个NLP解析器,一个位于犹他州Intermountain Healthcare(IH),另一个位于匹兹堡大学医学中心(UPMC),使用来自急诊部(ED)流感病例的本地临床笔记。我们测量了NLP解析器的性能,以确定是否存在70个指示流感的临床发现。然后,我们从NLP处理的报告中开发了贝叶斯网络模型,并测试了它们区分(1)流感、(2)非流感样疾病(NI-ILI)和(3)u2018其他u2019诊断病例的能力<\/锯齿:p>结果:在Intermountain Healthcare报告中,IH-NLP解析器的召回率和准确度分别为0.71和0.75,UPMC-NLP解析器为0.67和0.79。根据匹兹堡大学医学中心的报告,UPMC NLP解析器的召回率和准确度分别为0.73和0.80,IH NLP解释器的召回和准确度为0.53和0.80。AUROC对Intermountain Healthcare病例中流感和非流感的贝叶斯病例检测性能分别为0.93(使用IH NLP解析器)和0.93(用UPMC NLP解释器)。匹兹堡大学医学中心的病例检测结果为0.95(使用UPMC NLP解析器)和0.83(使用IH NLP解释器)。在Intermountain Healthcare案例中,流感与NI-ILI的性能分别为0.70(使用IH NLP解析器)和0.76(使用UPMC NLP解释器)。在皮斯堡大学医学中心的案例中,0.76(使用UPMC NLP解析器)和0.65(使用IH NLP解释器)<\/锯齿:p>结论:除了一个例子外(使用IH病例的流感和NI-ILI),尽管非局部解析器的性能合理,但局部解析仪在支持病例检测方面更有效<\/锯齿:p>引文:Ferraro JP、Ye Y、Gesteland PH、Haug PJ、Tsui F(R)、Cooper GF、Van Bree R、Ginter T、Nowalk AJ、Wagner M。自然语言处理对疾病监测流感病例检测的跨机构可移植性的影响。2017年应用临床信息;8:560\u2013580 https:\/\/doi.org\/10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211<\/jats:p>“,”doi“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2017,5,31]],”date-time“:”2017-05-31T11:28:04Z“,”timestamp“:1496230084000},”page“:“560-580”,“source”:“Crossref”,“is-referenced-”by-count“:5,”title“:[”自然语言处理对疾病监测流感病例检测跨机构可移植性的影响family“:”Gesteland“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[]},{“given”:“Peter”,“family”:“Haug”,“sequence”:“additional”,“affiliationation”:[]{“给定”:“Fuchiang”,”family:“Tsui”,“sequence”:“additionable”,“abfiliation”:[]},}“giving”:“Gregory”,“家族”:“Cooper”,“序列”:“additional”、“affidiation”:【】},“givent”:“Rudy Van”,“family“:”Bree“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[]},{“given”:“Thomas”,“family”:“Ginter”,“sequence”:“additional”,“affiliationation”:[]{“fixed”:“Andrew”,“家庭”:“Nowalk”,“序列”:“附加”,“从属关系”:[]},}“giving”:“Michael”,“家族”:“Wagner”,“sequence”:“additionable”,“abfiliation”:[[]}],“member”:“194”,”“published on line”:{“date-parts”:[[2001 7,12,21]]},“参考”:[{“key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-1“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Shaikh AT、Ferland L、Hood-Cree R、Shaffer L、McNabb SJ。颠覆性创新可以预防下一次疫情。2015年公共卫生前沿;3“,”DOI“:”10.3389\/fpubh.2015.0215“},”{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-2”,”DOI-asserted-by“:”publisher“,”DOI“:“10.1016\/j.jbi.2006.09.003”},“key ACI-2016-12-RA-0211-4“,”DOI-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Veenema T,T\u00f5ke J.生物制剂和新发传染病的早期检测和监测。护理学在线期刊2006;11(1)“,”DOI“:”10.3912“OJIN。Vol11No01Man02“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-5”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1089\/bsp.2011.0088”},}“keys”:“104338\/ACI-2016-12-RA-011-6”,“doi-asserted-by”:“publishers”,“DI:”10.1136\/bmj.j280“}”,{第“:”373“,”卷“:”64“,”作者“:”克莱蒙斯“,”年份“:”2015“,”journal-title“:”MMWR Morb Mortal Wkly Rep“},{”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-8“,”doi-asserted-by“:”publisher“,“doi”:“10.1186\/1471-2334-14-381”},“issue”:“41”,“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-9”,“首页”:“1421”,“卷”:“60”,“author”:“Control”,“年份”:“2011”,“journal-title”:“MMWR:Morbidid ty和死亡率周报“},{”关键“:”10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-10“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Dixon BE,Siegel JA,Oemig TV,Grannis SJ。公共卫生监测的互操作性:两个州的经验。2013年公共卫生信息学在线杂志;5(1)“,”DOI“:”10.5210\/ojphi.v5i1.4395“},{”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-11“,”非结构化“:”Gesteland PH、Wagner MM、Chapman WW、Espino JU、Tsui F-C、Gardner RM、Rolfs RT、Dato V、James BC、Haug PJ。在犹他州为2002年冬季奥运会快速部署电子疾病监测系统。Proc AMIA Symp2002:285-289“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-12”,“unstructured”:“国家综合征监测计划(NSSP)疾病控制和预防中心-BioSense Platform 2003[2016年3月31日更新,2016年4月访问]。可从http://www.cdc.gov\/NSSP\/BioSense\/index.html”}获取,{”issue“:”1“,”key“:”10.4338“,ACI-2016-12-RA-0211-13”,“首页”:“i32”,“卷”:“80”,“作者”:“伦巴多”,“年份”:“2013”,“新闻标题”:“J Urban Health”},{“key”:“10.4338”,“ACI-2016-2-RA-0211-14”,“第一页”:”A5136“,”卷“185”,”作者“:”Ferraro“,”年份“2012”,“日记标题”:”Am J Respir Crit Care Med“},”{“密钥”:“10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-15“,”doi-asserted-by“:”publisher”,“DOI”:“10.1001\/jamainmed.2013.3299”},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-16”,“DOI断言”:“crossref”,“非结构化”:“Moore CR,Farrag A,Ashkin E.使用自然语言处理从癌症筛查报告中提取异常结果。J Patient Saf 2014”,“DOI”:“10.1097\/PTS0000000000000127”},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-17“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”doi“:”10.1136\/amiajnl-2013-001934“},{”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-18“,“doi-assert-by”:“publisher”,“doi”:“10.1136\/bmj.h1885”},“key”:“10.4338\\ACI-2016-12-RA-019-19”,“doi-asserted-by”:”publister“,”doi“:“10.1176\/appi.ajp.2014.14030423“},{“键”:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-20“,”doi由“:”crossref“断言,”非结构化“:”Pathak J,Kho AN,Denny JC。电子健康记录驱动的表型:挑战、最新进展和展望。牛津大学出版社;2013”,“DOI”:“10.1136\/amiajnl-2013-004228”},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-21”,“非结构化”:“Chapman WW、Dowling JN、Ivanov O、Gesteland PH、Olszewski R、Espino JU、Wagner MM,编辑。评估自然语言处理在疫情和疾病监测中的应用。第36届界面研讨会论文集:计算科学与统计。2004; Citeser“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-22”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Chapman WW,Gundlapalli AV,South BR,Dowling JN.生物监测的自然语言处理。In:Castillo-Chavez C,Chen H,Lober WB,Thurmond M,Zeng D,编辑。传染病信息学与生物监测:Springer;2011。第279-310页“,”DOI“:”10.1007\/9781-4419-6892-0_13“},”{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-23”,”DOI-asserted-by“:”publisher“,”DOI“:“10.1002\/pds.3418”},“key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-24“,”非结构化“:”Gundlapalli AV,Carter ME,Palmer M,Ginter T,Redd A,Pickard S,Shen S,South B,Divita G,Duval l S.公司。使用自然语言处理临床文档的自由文本,筛选美国退伍军人无家可归的证据。2013年AMIA年度交响乐程序;2013年11月16日:537-546“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-25”,“doi-asserted-by”:“publisher”,”doi“:“10.1016\/j.jbi.2009.08.007”},“key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-26“,”doi-assert-by“:”publisher“,”doi:“10.7326\/0003-4819-156-1-201201030-00003”}A-0211-27“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”doi“:”10.1186\/1471-2105-12-212“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-28”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1136\/amijnl-2011-000465”},}“issue”:“1”,“key“:”10.4338\/ACI-2016-2-RA-0211-29“,”首页“:”256“,”卷“:”45“author”:“Daum\u00e9”,“year”:“2007”,“journal-title”:“Proc 454”第十届美国大学语言学协会年会“},{”key“:”10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-30“,“非结构化”:“Dredze M,Blitzer J,Talukdar PP,Ganchev K,Graca J,Pereira FC。依赖解析的令人沮丧的硬域适应。自然语言处理经验方法会议2007:1051-1055“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-31”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1136\/amijnl-2012-001453”},}“key:”10.4338\/ACI-2016-2-RA-0211-32“,”doi-assert-by“:”crossref“,”unstructured“:”Teixera PL、Wei W-Q、Cronin RM、Mo H、Van Houten JP、Carroll RJ、LaRose E、Bastarache LA、Rosenbloom ST、Edwards TL。评估电子健康记录数据源和算法方法以识别高血压患者。美国医学信息学协会杂志2016:ocw071“,”DOI“:”10.1093\/jamia\/ocw071”},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-33”,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“DOI”:“10.1136\/amiajnl-2011-000583”}、{“key”:”10.4338\\ACI-2016-12-RA-014-34“,”DOI-assert-by“:”crossref“,”unstructured“:”Tsui F、Wagner M、Cooper G、Que J、Harkema H、Dowling J、Sriburadej T、Li Q、Espino J、Voorhees R。使用电子病历中的数据进行疾病监测的概率病例检测。2011年在线公共卫生信息杂志;3(3)“,”DOI“:”10.5210\/ojphi.v3i3.3793“},{”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-35“,”非结构化“:”Russell S,Norvig P.《人工智能:现代方法》,普伦蒂斯·霍尔出版社,2009年。p.272-319“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-36”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1093\/nar\/gkh061”},“key“:”10.4338\/ACI-2016-2-RA-0211-37“,“unstructured”:“Samore MH.自然语言处理:它能帮助检测病例并表征疫情吗?《疾病监测进展》2008;5(59)“}”,{10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-38“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Pineda AL,Tsui F-C,Visweswaran S,Cooper GF.使用从急诊报告中学习的机器学习模型检测流感综合征患者。在线J公共卫生信息2013;5(1)“,”DOI“:”10.5210\/ojphi.v5i1.4446“},{”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-39“,”首页“:”160“,”卷“:”2016“,”author“:”Mehrabi“,”年份“:“2016”,”journal-title“:”AMIA Summits on Translational Science Proceedings“}”,{“key”:“10.4338\\ACI-2016-12-RA-011-40”,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“DOI”:“10.1016 \/j.jaci.2016.12.327“},{“键”:”10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-41“,“非结构化”:“Liu H,Bielinski SJ,Sohn S,Murphy S,Kavishwar BW,Jonnalagadda SR,Ravikumar KE,Wu ST,Kullo IJ,Chute CG。使用电子健康记录进行队列识别的信息提取框架。AMIA Jt Summits Transl Sci Proc 2013:149-153“},{“key”:“10.4338”,“ACI-2016-12-RA-0211-42”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1136”,jamia.2009.001560“}”,{”key“:”10.4338“/ACI-2016-12-RA-014-43“,”doi-assert-by“:”publisher-RA-0211-44“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”doi“:”10.1197贾米亚。M3037“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-45”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Darwiche A.用贝叶斯网络建模和推理:剑桥大学出版社;2009”,“doi”:“10.1017\/CBO9780511811357”},}“key”:“104338\/ACI-2016-12-RA-011-46”,“非结构化”:“Ferraro JP、Allen TL、Briggs B、Haug P、Post H编辑。针对急诊部隐性感染性休克患者的实时网络筛查系统的开发和功能。2008年学术急救医学协会年会;2008; 华盛顿特区“},{“key”:“10.4338”,“ACI-2016-12-RA-0211-47”,“unstructured”:“J Leng,S Shen,A Gundlapalli,South B,editors.The Extensible Human Oracle Suite of Tools(eHOST)for Annotation of Clinical Narratives”,AMIA Spring Congress;2010;Phoenix,AZ“}”,{10.1037\/h0031619“},{”issue“:”4“,”key“:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-49“,”first page“:“309”,“volume”:“9”,”author“:”Cooper“,”year“:”1992“,”journal-title“:”Machine learning“}”,{“key”:”10.338\/ACI2016-12-RA-011-50“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Benjamini Y,Hochberg Y。控制错误发现率:一种实用而强大的多重测试方法。J R Stat Soc系列B Stat Methodol 1995:289-300“,“DOI”:“10.1111\/J.2517-6161.1995.tb02031.x”},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-51”,“unstructured”:“Press WH,Teukolsky SA,Vetterling WT,Flannery BP。C中的数字配方:科学计算的艺术。第三版,纽约:剑桥大学出版社;2007”}、{“key”:10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-52“,”doi由“:”crossref“断言,”非结构化“:”DeLong ER,DeLong DM,Clarke Pearson DL。比较两个或多个相关接收器工作特性曲线下的面积:非参数方法。生物计量学1988:837-845“,”DOI“:”10.2307\/2531595“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-53”,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“DOI”:“10.1136\/jamia.2009.002733”},“{”key“:”10.4338\\ACI-2016-12-RA-011-54“,”非结构化“:”Patterson O,Hurdle JF,编辑。临床叙述的文献聚类:临床亚语言的系统研究。AMIA年度交响乐程序;2011; Citeser“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-55”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1136\/amiajnl-2012-001453”},“key“:”10.4338\/ACI-2016-2-RA-0211-56“,”doi-assert-by“:”publisher“,”doi“:”10.1016\/j.jbi.2014.08.011 by“:”publisher“,”doi“:”10.1016\/j.jbi.2015.08.019“},{”key“:”10.4338 \/ACI-2016-12-RA-0211-58“,“非结构化”:“Shi Y,Sha F.非监督领域适应的区分性集群的信息理论学习。2012年国际机器学习会议论文集:1079-1086“},{“key”:“10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-59”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“doi”:“10.1007\/s10994-009-5152-4”},}“key:”10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211-60“,“unstructured”:“Blitzer J,Kakade S,Foster DP,编辑。耦合子空间的域自适应。国际人工智能和统计会议;2011年“}”,“container-title”:[“Applied Clinical Informatics”],“original-title“:[],“language”:“en”,“link”:[{“URL”:“http://www.thieme-connect.de\/products\/ejournals\/pdf\/10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211.pdf”,《内容类型》:“unspecified”,“content-version”:“vor”,“intended-application”:“similarity-checking”}],“存放”:{“date-parts”:[2022,]7,29]],“date-time“:”2022-07-29T00:18:53Z“,”timestamp“:1659053933000},”score“:1,”resource“:{主要”:{“URL”:“http://www.thieme-connect.de\/DOI\/DOI?10.4338\/ACI-2016-12-RA-0211”}},“副标题”:[],“短标题”:[],“已发布”:{“日期-部分”:[[2017,4]]},‘references-count’:60,‘日志发布’:{‘发布’:“02”,“在线发布”:{“日期部分”:[[2017,12,21]]},“published-print“:{”date-parts“:[[2017,4]]}},”URL“:”http://\/dx.doi.org\/10.4338\/aci-2016-12-ra-0211“,”relation“:{},“ISSN”:[“1869-0327”],“ISSN-type”:[{“value”:“1869-0527”,“type”:“electronic”}],“subject”:【】,“published”:{“date-parts”:【2017,4]]{}}}}