{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{-“日期-部分”:[[2024,6,23]],“日期-时间”:“2024-06-23T00:18:36Z”,“时间戳”:1719101916825},“引用-计数”:37,“发布者”:“Springer Science and Business Media LLC”,“问题”:“S2”,“内容-域”:{:“域”:[“link.Springer.com”],“交叉标记限制”:错误},“short-container-title”:[“BMC Syst Biol”],“published-print”:{“date-parts”:[[2017,3]]},“DOI”:“10.1186\/s12918-017-0388-2”,“type”:“journal-article”,“created”:{“date-parts”:[[2017,3,14],“date-time”:“2017-03-14T09:05:21Z”,“timestamp”:1489482321000},”update-policy“http://\/dx.DOI.org\/10.1007\/springer_crossmark_policy“,”source“:”Crossref“,“按计数引用”:11,“标题”:[“先验知识指导的主动模块识别:综合多目标方法”],“前缀”:“10.1186”,“卷”:“11”,“作者”:[{“给定”:“围棋”,“家族”:“陈”,“序列”:“第一”,“从属”:[]},{“已知”:“静”,“家庭”:“刘”,“顺序”:“附加”,“隶属”:[]},“给定”:“山”,“家人”:“何”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[]}],“member”:“297”,“published-online”:{“date-parts”:[[2017,3,14]]}“:”Allison DB,Cui X,page GP,Sabripour M。微阵列数据分析:从混乱到整合和共识。Nat Rev基因。2006; 7(1):55\u201365.“,”journal-title“:”Nat Rev Genet“},{”issue“:”2“,”key“:”388_CR2“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“101”,“doi”:“10.1038\/nrg1272”,“volume”:“5”,“author”:“AL Barabasi”,“year”:“2004”,“unstructured”:“Barabasis AL,Oltvai ZN.网络生物学:理解细胞\u2019的功能组织。Nat Rev.Genet.2004;5(2):101\u201313.“,”journal-title“:”Nat Rev Genet“},{“issue”:“1”,“key”:“388_CR3”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-pages”:“56”,“doi”:“10.1038\/nrg2918”,“volume”:”12“,“author”:“AL Barab\u00e1si”,“year”:“2011”,“unstructured”:“Barab\u 00e1si-AL,Gulbahce N,Loscalzo J.网络医学:基于网络的方法《人类疾病》,《Nat Rev Genet.2011;12(1):56\u201368.“,”journal-title“:”Nat Rev Genet“},{“issue”:“7”,“key”:“388_CR4”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”720“,”doi“:”10.1038\/nbt.3283“,”volume“:”33“,”author“:”AM Gross“,”year“:”2015“,”unstructured“:”Gross AM,Ideker T.Molecular networks in context.Nat Biotechol.2015;33(7):720\u20131.“,”journal-title“:”Nat Biotechtol“},{”issue“:”2“,”key“:“388_CR5”,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”86693“,”doi“:”10.1371“\/journal.pone.0086693”,“volume”:“9”,“author”:“Y Liu”,“year”:“2014”,“unstructured”:“Liu Y,Tennant DA,Zhu Z,Heath JK,Yao X,He S.Dime:一种可扩展疾病模块识别算法,应用于胶质瘤进展。公共服务一号。2014; 9(2):86693.“,”journal-title“:”PloS ONE“},{”issue“:”16“,”key“:”388_CR6“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”2121“,”doi“:”10.1093\/bioinformatics\/btm294“,”volume“:“23”,”author“:”Z Guo“,”year“:”2007“,”unstructured“:”Guo Z,Li Y,Gong X,Yao C,Ma W,Wang D,Li Y,Zhu J,Zhang M,Yang D,et al.鉴定条件反应蛋白的基于知识的评分和搜索方法\u2013蛋白质相互作用子网络。生物信息学。2007; 23(16):2121\u2013128.“,”journal-title“:“生物信息学”},{“issue”:“1”,“key”:“388_CR7”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”1“,”doi“:”10.1186\/1752-0509-4-S2-S1“,”volume“:”4“,”author“:”YC Wang“,”year“:”2010“,”unstructured“:”Wang YC,Chen BS。转录调控和蛋白质相互作用的集成细胞网络。BMC系统生物。2010; 4(1):1.“,”journal-title“:”BMC Syst Biol“},{”issue“:”1“,”key“:”388_CR8“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page:“1”,”doi“:”10.1186\/s12859-016-0886-z“,”volume“:“17”,”author“:”D Muraro“,”year“:”2016“,”unstructured“:”Muraro D,Simmons A。对基因表达和分子相互作用数据进行综合分析,以确定炎症性肠病中失调的子网络。BMC生物信息。2016; 17(1):1.“,”journal-title“:”BMC Bioinforma“},{”issue“:”9“,”key“:”388_CR9“,“doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”1290“,”doi“:”10.1093\/bioinformatics\/btr136“,“volume”:“27”,“author”:“H Ma”,“year”:“2011”,“unstructured”:“Ma H,Schadt EE,Kaplan LM,Zhao H。余弦:使用全局优化方法的条件特定子网络识别。生物信息学。2011; 27(9):1290\u20138.“,”journal-title“:”Bioinformatics“},{”issue“:”9“,”key“:”388_CR10“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”1003“,”doi“:”10.1038\/nbt.1487“,”volume“:00d8,鲁宾E。基于网络的人类组织特异性代谢预测。国家生物技术。2008; 26(9):1003\u201310.“,”journal-title“:”Nat Biotechsol“},{”issue“:”5439“,”key“:”388_CR11“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”509“,”doi“:”10.1126\/science.286.5439.509“,”volume“:“286”,”author“:”AL Barab\u00e1si“,”year“1999”,”unstructured“:”Barab\u 00e1si AL,Albert R.随机网络缩放的出现《科学》1999;286(5439):509\u201312.“,”journal-title“:”Science“},{”issue“:”23“,”key“:”388_CR12“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”8577“,”doi“:”10.1073\/pnas.0601602103“,”volume“:u2013582.“,”新闻标题“:”Proc Natl Acad Sci“},{”issue“:”6794“,”key“:”388_CR13“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“378”,“doi”:“10.1038\/35019019”,“volume”:“406”,“author”:“R Albert”,“year”:“2000”,“unstructured”:“Albert R,Jeong H,Barab\u00e1si AL.复杂网络的错误和攻击容限。Nature.2000;406(6794):378\u201382.”,“journal-title”:“Nature”},{“key”:“388_CR14“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”c47“,”doi“:”10.1038\/35011540“,”volume“:”402“,”author“:”L Hartwell“,”year“:”1999“,”unstructured“:”Hartwell-L,Hopfield J,Leibler S,Murray A.从分子到模块化细胞生物学。自然。1999; 402:c47\u2013c52。这篇基础文章定义了细胞生物学中模块化的概念。CAS ISI PubMed文章。”,“期刊标题”:“Nature”},{“key”:“388_CR15”,“doi断言者”:“crossref”,“首页”:“71”,“doi”:“10.1007\/978-3-642-34413-8_6”,“卷”:“71”,“作者”:“G Jia”,“年份”:“2012”,“非结构化”:“Jia G,Cai Z,Musolesi M,Wang Y,Tennant DA,Weber RJ,Heath JK,He S。使用差异进化在社会和生物网络中进行社区检测。学习Intell Optim。2012; 71:71\u201385.“,“journal-title”:“学习智能优化。“},{”key“:”388_CR16“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Huang Q,White T,Jia G,Musolesi M,Turan N,Tang K,He S,Heath JK,Yao X.使用协同进化差分进化进行社区检测。In:国际自然并行问题解决大会。Springer:2012。p.235\u201344.“,”DOI“:”10.1007\/978-3642-32964-7_24“},{”issue“:”10“,”key“:”388_CR17“,”DOI-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“719”,“DOI”:“10.1038\/nrg3552”,“volume”:“14”,“author”:“K Mitra”,“year”:“2013”,“unstructured”:“Mitra K,Carvunis AR,Ramesh SK,Ideker T。寻找生物网络模块结构的综合方法。Nat Rev基因。2013; 14(10):719\u201332.“,“journal-title”:“Nat Rev Genet”},{“key”:“388_CR18”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“He S,Zhu Z,Jia G,Tennant D,Huang Q,Tang K,Heath J,Musolesi M,Yao X.协同进化模块识别及其在癌症疾病模块发现中的应用。IEEE进化计算汇刊。2016;1\u20131.“,”DOI“:”10.1109\/TEVC.2016.2530311“},{“问题”:”suppl 1“,”key“:”388_CR19“,”DOI-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“233”,“DOI”:”10.1093\/生物信息学\/18.suppl_1.S233“,”volument“:”18“,”author“:”T Ideker“,”year“:”2002“,”unstructured“:”Ideker T,Ozier O,Schwikowski B,Sie凝胶AF。发现分子相互作用网络中的调节和信号电路。生物信息学。2002; 18(suppl 1):233\u201340.“,”期刊标题“:”生物信息学“},{”期刊“:”1“,”密钥“:”388_CR20“,”doi断言“:”交叉引用“,”第一页“:”1“,”doi“:”10.1186\/147-1105-10-S7-A1“,”卷“:”10“,”作者“:”T Hwang“,”年份“:”2009“,”非结构化“:”Hwang T,Park T。基于多元方差分析的差异表达子网络识别。BMC生物信息。2009; 10(1):1.“,”journal-title“:”BMC Bioinforma“},{”issue“:”1“,”key“:”388_CR21“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“1”,”doi“:”10.1186\/1471-2105-11-351“,“volume”:“11”,“author”:“M Klammer”,“year”:“2010”,“unstructured”:“KlammerM,Godl K,Tebbe A,Schaab C。从磷酸蛋白质组数据中识别差异调节的子网络。BMC生物信息。2010; 11(1):1.“,”journal-title“:”BMC Bioinforma“},{”issue“:”13“,”key“:”388_CR22“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page“:”223“,”doi“:”10.1093\/bioinformatics\/btn161“,“volume”:“24”,“author”:“MT Dittrich”,“year”:“2008”,“unstructured”:“Dittrich-MT,Klau GW,Rosenwald A,Dandekar T,M\u00fcller T。识别蛋白质\u2013蛋白质相互作用网络中的功能模块:一种综合精确方法。生物信息学。2008; 24(13):223\u201331.“,”journal-title“:“生物信息学”},{“issue”:“10”,“key”:“388_CR23”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-page”:“1236”,“doi”:“10.1093\/生物信息学磅S,莫里斯SW。通过近似和划分p值的经验分布,估计微阵列研究中假阳性和假阴性的发生率。生物信息学。2003; 19(10):1236\u201342.“,”journal-title“:”Bioinformatics“},{”key“:”388_CR24“,”doi-asserted-by“:”crossref“,“first page”:“289”,”doi“:”10.1111\/j.2517-6161.1995.tb02031.x“,”volume“:“57”,“author”:“Y Benjamini”,“year”:“1995”,“unstructured”:“Benjaminy Y,Hochberg Y。控制错误发现率:一种实用且强大的多重测试方法。J R Stat Soc Ser B方法。1995; 57:289\u2013300.“,”journal-title“:”J R Stat Soc Ser B Methodol“},{”issue“:”1“,”key“:”388_CR25“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“27”,”doi“:”10.1093\/nar“28.1.27”,“volume”:“28”,“author”:“M Kanehisa”,“year”:“2000”,“unstructured”:“KanehisaM,Goto S.Kegg:京都百科全书基因和基因组。核酸研究,2000;28(1):27\u201330。“,”期刊标题“:“Nucleic Acids Res”},{“key”:“388_CR26”,“nonstructured”:“酿酒酵母KEGG REST风格条目。http:\/\/REST.KEGG.jp\/link\/sce\/pathway。访问日期:2016年3月。”},{“issue”:“2”,“key”:“388_CR27”,“doi asserted by”:“crossref”,“首页”:“182”,“doi”:“10.1109\/4239.996017”,“volume”:“6”,“author”:“K Deb”,“年份”:“2002”,“非结构化”:“Deb K,Pratap A,Agarwal S,Meyarivan T。一种快速的精英多目标遗传算法:Nsga-ii。IEEE Trans-Evol计算。2002; 6(2):182\u201397.“,“journal-title”:“IEEE Trans-Evol Compute”},{“key”:“388_CR28”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“P\u00e9trowski A.作为遗传算法小生境方法的清理程序。In:Evolutionary Computes,1996。IEEE国际会议论文集。IEEE:1996。p.798\u2013803.“,”DOI“:”10.1109\/ICEC.1996.542703“},{“问题”:“11”,“键”:“388_CR29”,“DOI-asserted-by”:“交叉引用”,“首页”:“2498”,“DOI”:“10.1101\/gr.1239303”,“卷”:“13”,“作者”:“p Shannon”,“年份”:“2003”,“非结构化”:“Shannon p,Markiel A,Ozier O,Baliga NS,Wang JT,Rama ge D、Amin N、Schwikowski B、Ideker T。Cytoscape:生物分子相互作用网络集成模型的软件环境。基因组研究2003;13(11):2498\u2013504.“,”journal-title“:”Genome Res“},{”key“:”388_CR30“,”unstructured“:”Cytoscape应用程序商店中的jActiveModules。http:\/\/apps.cytscape.org\/apps\/jActiveModules.访问日期:2015年10月。“}”,{“key”:“388_CR 31”,“unstructure”:“NCBI Gene Exprsion Omnibus-GSE29331。http://www.ncbi.nlm.nih.gov\/geo\/query\/acc.cgi?acc=GSE29331。2016年4月访问。“},{”issue“:”17“,”key“:”388_CR32“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“5973”,“doi”:“10.1128\/AEM.00253-11”,“volume”:“77”,“author”:“JS van Leeuwen”,“year”:“2011”,“unstructured”:“van Leeuwen JS、Vermeulen NP、Vos JC。多效性耐药性反应、蛋白激酶c信号转导和锌稳态改变参与酿酒酵母对双氯芬酸的耐药性。应用环境微生物。2011; 77(17):5973\u2013980.“,”journal-title“:“Appl Environ Microbiol”},{“key”:“388_CR33”,“unstructured”:“GEO,2R.http://www.ncbi.nlm.nih.gov\/GEO\/geo2r \/.访问日期:2016年5月。”}“,{”key“:”388_CR 34“,”unstructure“:”BioGRID(生物交互数据集通用存储库)。http://thebiorid.org\/.2016年5月份访问。“},{“问题”:“8”,“密钥”:“388_CR35”,“doi asserted by”:“crossref”,“first page”:“1129”,“doi”:“10.1093\/生物信息学\/btq089”,“volume”:“26”,“author”:“D Beisser”,“year”:“2010”,“nonstructured”:“Beisser D,Klau GW,Dandekar T,M\u00fcller T,Dittrich MT。Bionet:用于生物网络功能分析的r包。生物信息学。2010; 26(8):1129\u201330.“,”journal-title“:“生物信息学”},{“issue”:“D1”,“key”:“388_CR36”,“doi-asserted-by”:“crossref”,”first page“:”1049“,”doi“:”10.1093\/nar\/gku1179“,“volume”:”43“,”author“:”GO Consortium“,”year“2015”,“unstructured”:“Consortium-GO,et al.Gene-ontology Consortium:going forward.Nucleic Acids Res.2015;43(D1):1049\u201356.“,”journal-title“:”核酸研究“},{“key”:“388_CR37”,“volume-title”:“生物化学”,“author”:“JM Berg”,“year”:“2002”,“unstructured”:“Berg JM,Tymoczko JL,Stryer L.生物化学。纽约:W H Freeman;2002.”}],“container-title(容器-时间):[“BMC系统生物学”],“original-title:[],“language”:“en”,“link”:[{“URL”:“http://\/link.springer.com/content\/pdf\/10.1186\/s12918-017-0388-2.pdf“,“content-type”:“application\/pdf”,“content-version”:“vor”,“intended-application”:“similarity-checking”}],“deposed”:{“date-parts”:[[2024,6,22]],“date-time”:”2024-06-22T23:33:41Z“timestamp”:1719099221000},“score”:1,“resource”:{“primary”:{:“URL”:“”http://\/bmcsystbiol.biomedcentral.com/articles\/10.1186\/s12918-017-0388-2“}},”副标题“:[],”短标题“:[],”已发布“:{”日期部分“:[[2017,3]]},“引用计数”:37,”日志发布“::\/\/dx.doi.org\/10.1186\/s12918-017-0388-2“,”关系“:{},”ISSN“:[”1752-0509“],”issn-type“:[{”value“:”1752-0509',”type“:”electronic“}],”subject“:[],”published“:{”date-parts“:[[2017,3]]},”article-number“:“8”}}