{“状态”：“确定”，“消息类型”：“工作”，“信息版本”：“1.0.0”，“邮件”：{“索引”：{-“日期-部分”：[[2024,6,27]]，“日期-时间”：“2024-06-27T02:56:27Z”，“时间戳”：1719456987276}，“参考-计数”：36，“发布者”：“Springer Science and Business Media LLC”，“问题”：“1”，“内容-域”:{“域”：[“link.Springer.com”]，“交叉标记限制“：false}，“short-container-title”：[“BMC生物信息学”]，“published-print”：{“date-parts”：[[2007,12]]}，“abstract”：“摘要<\/jats:title>\n\n个背景<\/jats:title>\n每个主要的蛋白质数据库在分配蛋白质标识符时都使用自己的约定。解决涉及相同蛋白质的各种可能不稳定的标识符是一项重大挑战。当试图统一使用来自多个数据源的蛋白质进行注释的数据集时，或者当源数据库使用另一种蛋白质标识符时，使用一种味道的蛋白质标识符查询数据提供者时，这是一个常见的问题。蛋白质标识符映射的部分解决方案存在，但它们仅限于特定物种或技术以及极少数数据库。因此，我们还没有找到一个在映射范围上足够通用和广泛的解决方案来满足我们的需求<\/jats:p>\n<\/jats:sec>\n\n个结果<\/jats:title>\n我们创建了蛋白质标识符交叉引用（PICR）服务，这是一个web应用程序，提供对使用UniProt Archive（UniParc）的映射算法的交互式编程（SOAP和REST）访问作为一个数据仓库，为加载到UniParc中的70多个不同源数据库中的蛋白质提供基于100%序列身份的蛋白质交叉引用。映射可以受到源数据库、分类ID和源数据库中活动状态的限制。用户可以复制/粘贴或上传包含FASTA格式蛋白质标识符或序列的文件，以使用交互式界面获取映射。可以在简单或详细的HTML表中查看搜索结果，也可以下载为适合在本地数据库或电子表格中使用的逗号分隔值（CSV）或Microsoft Excel（XLS）文件。或者，可以使用SOAP接口在其他应用程序中集成PICR功能，就像轻量级REST接口一样<\/jats:p>\n<\/jats:sec>\n\n个结论<\/jats:title>\n我们提供一种公开的服务，可以将蛋白质标识符和蛋白质序列交互式映射到大多数常用的蛋白质数据库。可通过符合标准的SOAP接口或轻量级REST接口进行编程访问。PICR接口、文档和代码示例可在http://www.ebi.ac.uk\/Tools\/picr<\/jats:ext-link><\/jats:p>\n“，”DOI“：”10.1186\/1471-2105-8-401“，”type“：”journal-article“，”created“：{”date-parts“：[[2007,10,18]]，”date-time“：”2007-10-18T18:14:03Z“，”timestamp“：1192731243000}，”update-policy“：count“：106，”标题“：[”蛋白质标识符交叉引用（PICR）服务：协调多个来源数据库中的蛋白质标识符“]，”前缀“：”10.1186“，”卷“：”8“，”作者“：[｛”给定“：”Richard 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