{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{“日期部分”:[[2022,4,5]],“日期时间”:“2022-04-05T10:19:53Z”,“时间戳”:1649153993373},“出版商位置”:“美国纽约州纽约市”,“参考计数”:28,“出版者”:“ACM出版社”,“许可证”:[{“开始”:{'日期部分”:[[2015,7,26]],“日期时间”:“2015-07-26T00:00:00Z”,“timestamp”:1437868800000},“content-version”:“vor”,“delay-in-days”:206,“URL”:“http://www.acm.org\/publications\/policys\/corpyright_policy#Background”}],“funder”:[{“DOI”:“10.13039\/1000000001”,“name”:“国家科学基金会”,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“award”:[“1062432”]},{“DOI”:”10.13039\\100005825“,”name”:“国家食品和农业研究所”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“award”:[“2011-67009-30030”]}],“content-domain”:{“domain”:[],“crossmark-restriction”:false},“short-container-title”:[],”published-print“:{”date-parts“:[[2015]]},”doi“:”10.1145\/2792795.2792748“,”type“:”proceedings-article“,”created“:”{“date-part”:[[2015,7,27]],“日期-时间”:“2015-07-27T14:35:23Z”,“timestamp”:1438007723000},“source”:“Crossref”,“is-referenced-by-count”:0,“title”:[“Cyberinfrastructure resources enabled creation of the loblyly pine reference transcriptome”],“prefix”:“10.1145”,”author“:[{”given“:”Le-Shin“,”family“Wu”,“sequence”:“first”,“affiliation”:[]},{“given”:”Carrie L.“,“family”:“Ganote,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[]},{“given”:“Thomas G.”,“family”:“Doak”,”sequence“:”additional t“,”sequence“:”附加“,“affiliation”:[]}],“member”:“320”,“reference”:[{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-1”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Birol,I.,et al.,从全基因组鸟枪测序数据中组装20 Gb白云杉(Picea glauca)基因组。生物信息学,2013.29(12):p.1492--1497。”,“doi”:“10.1093\/生物信息学\/btt178”},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-2”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Nystedt,B.等人,挪威云杉基因组序列和针叶植物基因组进化。自然,2013.497(7451):p.579--584。”,“doi”:“10.1038\/nature12211”},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-3”,“非结构化”:“Nix,S.美国十大最常见的树木。About.com Forestry。[引用日期:2015年4月4日];可从以下网址获得:http://\/forest.About.com/b\/2012\/07\/21\/Ten-Most-Common-Trees-inthe-United-States.htm.”},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-4”,“unstructured”:“University,N.C.S.Tree Improvement Center.2015[引用日期2015年4日]”;可从以下网址获得:http://www.treeimprovement.org\/public\/about\/species-interest\/loblolly-pine\/lobolly-pine。“},{”key“:”key-10.1145\/2792745.2792748-5“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Neale,D.B.等人,《利用单倍体DNA和新的组装策略解码火炬松大规模基因组》,《基因组生物学》,2014.15(3):p.R59。DOI:10.1186\/gb-2014-15-3-r59.“,”DOI“:”10.1186\/gb-2014-15-3-r59“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-6”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Wegrzyn,J.L.,et al.,通过序列注释揭示的火炬松(Pinus taeda L.)巨基因组的独特特征。遗传学,2014.196(3):p.891-909。DOI:10.1534\/遗传学.113.1599996.“,”DOI“:”10.1534\/genetics.113.159996“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-7”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,”unstructured“:”Stewart,C.A.等人,《什么是网络基础设施》,载于第38届ACM SIGUCS秋季会议论文集:导航与发现2010,ACM:美国弗吉尼亚州诺福克,第37-44页。DOI:10.1145\/1878335.1878347.“,”DOI“:”10.1145\/1888335.1878.347“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-8”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,”unstructured“:”Grabherr,M.G.,et al.,无参考基因组的RNA-Seq数据的全长转录组组装。Nat.Biotechtol.,2011.29(7):p.644--652.“,“DOI”:“10.1038\/nbt.1883”},{“密钥”:“key-10.1145\/2792745.2792748-9“,”doi-asserted-by“:”crossref“,“unstructured”:“Schulz,M.H.,et al.,Oases:在表达水平的动态范围内进行稳健的从头RNA-seq组装。生物信息学,2012.28(8):p.1086--1092。”,“DOI”:“10.1093\/生物信息学\/bts094”},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-10”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Robertson,G.等人,《RNA-seq数据的从头组装和分析》。《方法》,2010.7-10.1145 \/2792745.2792748-11“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Li,R.,et al.,SOAP2:一种改进的超快短读对齐工具。生物信息学,2009.25(15):p.1966--1967。“,“DOI”:“10.1093\/生物信息学\/btp336”},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-12”,“unstructured”:“印第安纳大学梅森集群。[2015年4月4日引用];可从https:\/\/kb.iu.edu\/d\/bbhhh\/.”}获得,{”key“:”key-10.1145 \/279745.2792748-13“,”unstructure“:”极端科学与工程发现环境。【2015年4月4日引用】;可从以下网址获得:https:\/\/http:\/\/www.xsede.org.“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-14”,“unstructured”:“Getting started on Mason.[引用日期:2015年4月4日];可从以下网站获得:http:\/\/kb.iu.edu\/d\/beyh.”},}“key:”key-10.1145 \/279745.2792748-15“,”unstructure“:”PSC Blacklight User Guide.xsede.[引用日期为2015年4日];可从以下网址获取:https:\/\/portal.xsede.org/psc-blacklight。“},{”key“:”key-10.1145\/2792745.2792748-16“,”doi-asserted-by“:”crossref“,“unstructured”:“Fischer,J.等人,《创建XSEDE兼容集群的方法》,收录于2014年极端科学与工程发现环境年会论文集,ACM:美国佐治亚州亚特兰大,第1-5页。DOI:10.1145\/2616498.2616578.“,”DOI“:”10.1145\/2610498.2616578“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-17”,“unstructured”:“国家基因组分析支持中心。可从http://www.ncgas.org\/.“}获取,{”key“:”key-10.1145 \/279745.2792748-18“,”unstructure“:”德克萨斯州高级计算中心。[引用日期:2015年4月4日];网址:http://www.tacc.utexas.edu\/。“},{”key“:”key-10.1145\/2792745.2792748-19“,”unstructured“:”圣地亚哥超级计算机中心。[引用2015年4月4日];可从以下网址获得:http://\/www.sdsc.edu\/.“}2748-21英寸doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”LeDuc,R.D.等,国家基因组分析支持中心利用XSEDE支持生命科学研究,摘自《极端科学与工程发现环境会议论文集:发现之门》2013,美国医学会:美国加利福尼亚州圣地亚哥,第1-7页。DOI:10.1145,“DOI”:“10.1145”,“2484762.2484790”},{“key”:“key-10.1145”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,”非结构化“:”Henschel,R.等人,《Trinity RNA-Seq汇编程序性能优化》,收录于《极限科学与工程发现环境第一届会议论文集:从极限到校园和更远的桥梁》。2012年,ACM:美国纽约州纽约市,第45:1-45:8页。DOI:10.1145\/2335755.2335842.“,”DOI“:”10.1145\/235755.2335842“},{“key”:”key-10.1145\/2792745.2792748-23“,“DOI-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Wang,Z.,M.Gerstein,and M.Snyder,RNA-Seq:转录组学的革命性工具.Nat.Rev.Genet.,2009.10(1):p.57-63.”,“DOI”:“10.1038\/nrg2484”},”{“密钥”:“键-10.1145 \/2792745.2792748-24”,“非结构化”:“Illumina Hi-Seq测序器。【2015年4月4日引用】;网址:http://www.illumina.com/systems\/hiseq_2500_1500.html。“},{”key“:”key-10.1145\/2792745.2792748-25“,”unstructured“:”Andrews,S.,FastQC A Quality Control tool for High Throughput Sequence Data(高通量序列数据质量控制工具)。http://www.bioinformations.babraham.ac.uk\/projects\/FastQC\/,2015。http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk\/projects\/fastqc\/。},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-26”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Bolger,A.M.,M.Lohse,and B.Usadel,Trimmomatic:Illumina序列数据的灵活修剪器。生物信息学,2014.30(15):第2114-2120页。DOI:10.1093\/生物信息学\/btu170.“,”DOI“:”10.1093\/bioinformation\/btu170“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-27”,“unstructured”:“Brown,C.T.,et al.,A Reference-Free Algorithm for Computational Normalization of Shotgun Sequenting Data.2012。http://\/arxiv.org\/abs\/1203.4802.“},{“key”:“key-10.1145\/2792745.2792748-28”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“unstructured”:“Zimin,A.等人,22-gb火炬松基因组的测序和组装。遗传学,2014.196(3):p.875--890。DOI:10.1534\/遗传学.113.159715.”,“DOI”:“10.1534\/遗传学.11.159715.”}],“event”:{“name”:“2015年XSEDE大会”,“主题”:“增强型网络基础设施带来的科学进步”,“location”:“St.Louis,Missouri”,“首字母缩写”:“XSEDE’15”,“number”:“2015”,“赞助商”:[“CORSA,CORSA Technology”,“CASC,学术科学计算联盟“,”RENCI,文艺复兴计算研究所“,”HPCWire“,”SGI“,”圣地亚哥超级计算中心“,”Cray“,”印第安纳大学“,”Intel“],”start“:{”date-parts“:[[2015,7,26]]},”end”:{“date-part”:[[2015-7,30]}},“container-title”:[“2015年XSEDE增强型网络基础设施促进科学进步会议论文集-XSEDE'15“],“original-title”:[],“link”:[{“URL”:“http://\\dl.acm.org//ft_gateway.cfm?id=2792748&ftid=1608571&dwn=1”,“content-type”:“unspecified”,“content-version”:“vor”,“intended-application”:“similarity-checking”}],“deposed”:{date-parts“:[[2017,6,23]],“date-time”:“2017-06-23T16:28:38Z”,“timestamp”:1498235318000},“score”:1,“resource”:{“primary”:{“URL”:“http://\dl.acm.org\/citation.cfm?doid=2792745.2792748”},”subtitle“:[],”shorttitle“:[],”issued“:{”date-part“:[2015]]},‘references-count’:28,”URL“:“http://\/dx.doi.org\/10.1145\/2792745.2792748”,“关系”:{},“主题“:[],”已发布“:{“日期-部分”:[[2015]]}}}