{“状态”:“好”,“消息类型”:“工作”,“消息版本”:“1.0.0”,“消息”:{“索引”:{“日期部分”:[[2024,6,10],“日期时间”:“2024-06-10T15:12:38Z”,“时间戳”:1718032358158},“引用计数”:20,“出版商”:“牛津大学出版社(OUP)”,“许可证”:[{“开始”:{“日期部分”:[[2019,10,23]],“日期时间”:“2019-10-23T00:00:00Z”,“时间戳”:1571788800000}中,“content-version”:“vor”,“delay-in-days”:0,“URL”:“http://\/creativecommons.org\/licenses\/by\/4.0\/”}],“资助者”:[{“DOI”:“10.13039\/1000000051”,“名称”:“国家人类基因组研究所”,“DOI-asserted-by”:“出版商”,“奖项”:[“U24 HG002223”]}由“:”出版商“,”奖项“:[“MR\/S000453\/1”]},{“DOI”:“10.13039\/5010000268”,“name”:“Biotechnology and Biological Sciences Research Council”,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“award”:[“BB\/P024602\/1”]}],“content-domain”:{“domain”:[],“crossmark-restriction”:false},“short-container-title”:[],“abstract”:“摘要<\/jats:title>\nWormBase(https:\/\/WormBase.org\/)是一个成熟的模型生物信息资源,支持研究人员使用线虫秀丽隐杆线虫作为模型系统,进行广泛的基本生物过程研究。为了完成这项任务,WormBase的工作安排在三个主要方面:管理、用户界面和体系结构。在本次更新中,我们描述了这三个领域的进展。特别是,我们讨论了文献管理和最近添加的数据的现状,详细介绍了web界面的新功能和希望进行数据挖掘工作流程的用户的选项,并讨论了我们通过利用商业云产品构建强大和可扩展架构的努力。最后,我们描述了WormBase作为新生的基因组资源联盟的创始成员的作用<\/jats:p>“,”DOI“:”10.1093\/nar\/gkz920“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2019,10,8]],”date-time“:”2019-10-08T08:17:03Z“,”timestamp“:1570522623000},”source“:“Crossref”,“is-referenced-by-count”:105,”title“:[”WormBase:a modern Model Organism Information Resource“],”prefix“:”101093“,”author“:[{”OR]CID“:”http:\/\/orcid.org\/00000-0003-3406-163X“,”authenticated-orcid“:false,”given“:”Todd W“,”family“:”Harris“,”sequence“:”first“,”affiliation“:[{”name“:”Informatics and Bio-computing Platform,Ontario Institute for Canada,Toronto,ON M5G0A3,加拿大多伦多安大略癌症研究所信息与生物计算平台“}]},{“given”:“Valerio”,“family”:“Arnaboldi”,“sequence”:“additional”,“affiliance”:生物与生物工程部156\u201329,美国加利福尼亚州帕萨迪纳加利福尼亚理工学院“}]},{“given”:“Scott”,“family”:“Cain”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Informatics and Bio-computing Platform,Ontario Institute for Cancer Research,Toronto,ON M5G0A3,Canada”}]},}“gived”:“Juancarlos”,“家族”:“Chan“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA“}]},{”given“:”Wen J“,”family“:”Chen“,”sequence“:”additionable“,”feliation“:[{“name”:“美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程系156\u201329family“:”Davis“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”European Molecular Biology Laboratory,Europeans Bioinformatics Institute,Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SD,UK“}]},{”given“:”Sibyl“,”family”:“Gao”,“sequence”:“additional”,“affiliance”:安大略省癌症研究所信息学和生物计算平台,多伦多,安大略省M5G0A3,加拿大“}]},{“给定”:“Christian A”,“家族”:“Grove”,“序列”:“附加”,“隶属关系”:[{“名称”:“生物和生物工程部156\u201329,加利福尼亚理工学院,加利福尼亚州帕萨迪纳,邮编91125”}},{“给定”:“Ranjana”family“:”Kishore“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA“}]},{”given“:”Raymond Y N“,”family美国加州帕萨迪纳加州理工学院生物与生物工程部156\u201329Cecilia“,“family”:“Nakamura”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA”}]},{“given”:“Paulo”,“faily”:加拿大安大略省癌症研究所信息学和生物计算平台,多伦多,ON M5G0A3“}]},{”given“:”Michael“,”family“:”Paulini“,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{”name“:”欧洲分子生物学实验室,欧洲生物信息学研究所,Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SD,UK“}]{”fixed“:”Daniela”,“family”:“Raciti”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA”}]},{“given”:“Faye H”,“家族”:“Rodgers”,“序列”:“additional”、“affidiation”:Wellcome Trust Sanger Institute,Wellcome-Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SA,UK“}]},{“ORCID”:“http://\/ORCID.org\/0000-0001-6140-6723”,“authenticated-ORCID”:false,“given”:”Matthew“,“family”:“Russell”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“欧洲分子生物学实验室,欧洲生物信息学研究所,Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SD,UK“}]},{“given”:“Gary”,“family”:“Schindelman”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadenance,CA 91125,USA”}]},{“given”:“Kimberly V”,“family”:“Auken”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Division of Biology and Biology Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA”}]},{”given“:”清华“,”family“:”王“,”sequence“:”additional“,”affiliance“:[{”name“:“生物与生物工程部156\u201329,美国加州帕萨迪纳加利福尼亚理工学院”}]},{“given”:“Gary”,“family”:“Williams”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“欧洲分子生物学实验室,欧洲生物信息学研究所,Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SD,UK”}]{,{“given”:“Adam J”,“family”:“Wright”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Informatics and Bio-computing Platform,Ontario Institute for Canada,Toronto,ON M5G0A3,Canada”}]},{“fixed”:“Karen”,“家人”:“Yook”,“序列”:“附加”,“从属关系”:[[{”name“:“生物与生物工程部156\u201329,美国加州帕萨迪纳加州理工学院,邮编:91125”}]},{“给定”:“Kevin L”,“家族”:“Howe”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“欧洲分子生物学实验室,欧洲生物信息研究所,Wellcome Trust Genome Campus,Hinxton,Cambridge CB10 1SD,UK”}]{,{“given”:“Tim”,“family”:“Schedl”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“The Department of Genetics,Washington University School of Medicine,St Louis,MO 63110,USA”}]},{“fixed”:“Lincoln”:“加拿大安大略省癌症研究所信息与生物计算平台,多伦多,ON M5G0A3”}]},{“given”:“Paul W”,“family”:“Sternberg”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“Division of Biology and Biological Engineering 156\u201329,California Institute of Technology,Pasadena,CA 91125,USA”}]],“member”:“286”,“published-online”:{“date-parts”:[[2019,10,23]]},“reference”:[{“key”:“2019102305091735000_B1”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-page:”82“,“doi”:“10.1093\/nar\/29.1.82”,“article-title”:“WormBase:网络访问秀丽隐杆线虫基因组和生物学”,“volume”:”29“,“author”:“Stein”,“year”:“2001”,“journ”al-title“:”核酸研究“},{“key”:“2019102305091735000_B2”,“doi-asserted-by”:“crossref”,”first page“:”133“,”doi“:”10.1093\/nar\/gkg053“,”article-title“:”WormBase:a cross-species database for compative genomics“,”volume“:“31”,“author”:“哈里斯”,“year”:“2003”,“journal-title”:“Nucleic Acids Res.”},{”key“:‘201910235091735000_B3’,”doi-assert-by“:”crossref“,”首页“:“D789”,“DOI”:“10.1093\/nar\/gkt1063”,“article-title”:“WormBase 2014:策展生物学的新观点”,“volume”:“42”,“author”:“Harris”,“year”:“2014”,“journal-title“:核酸研究”},{“key”:”201910230591735000_B4“,”DOI-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”16“,”DOI“:”10.1186\/1471-2105-13-16“,”文章标题“:“生物科学文献中各种实验信息的自动分类”,“卷”:“13”,“作者”:“方”,“年份”:“2012”,“期刊标题”:“BMC生物信息学”},{“关键词”:“2019102305091735000_B5”,“文章标题”:《WormBase中蛋白质相互作用数据的更新》,“卷“:“2018”,“作家”:“Cho”,“年度”:“2018年”,“杂志标题”:“microPublication Biology”},{“key”:“2019102305091735000_B6”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”121“,“doi”:“10.1002\/cfg.248”,“article-title”:“构建秀丽隐杆线虫的细胞和解剖本体论”,“volume”:“4”,“author”:“Lee”,“year”:“2003”,“journal-title“:”Comp.Funct.Genomics“},“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:“32”,“DOI”:“10.1186\/1471-2105-12-32”,《article-title》:“蠕虫表型本体:整合秀丽线虫群落内外的表型数据”,“volume”:《12》,“author”:“Schindelman”,“year”:“2011”,“journal-title”:“BMC生物信息学”},{“key”:”201910230591735000_B8“article-title”:“跨越所有生物体的表型本体论(POTATO)研讨会旨在协调跨物种的逻辑定义”,“卷-时间”:“NIH会议:”综合现象学论坛“”,“作者”:“Matentzoglu”,“年份”:“2018”},{“key”:“2019102305091735000_B9”,“doi-asserted-by”:“crossref”,”第一页“D1018”,“doi”:“10.1093”,“article-title”:“人类表型本体(HPO)知识库和资源的扩展”,“volume”:“47”,“author”:“K\u00f6hler”,“year”:“2019”,“journal-title“:”核酸研究“},{“key”:”2019102305091735000_B10“,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-page”:“390”,“doi”:“10.1002”//wsbm.44“,”article-title“:“哺乳动物表型本体论:启用稳健注释和比较分析”,“卷”:“1”,“作者”:“史密斯”,“年份”:“2009年”,“期刊标题”:“威利Interdiscip.Rev.Syst.Biol.Med.”},{“键”:“2019102305091735000_B11”,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”25“,”doi“:”10.1038\/75556“,”article-title“:“基因本体论:生物学统一的工具”,“卷”:“25”,“作者”:“Ashburner”,“年”:“2000”,“期刊标题”:“自然遗传学”},{“键”:“2019102305091735000_B12”,“doi断言”:“crossref”,“首页”:“D774”,“doi”:“10.1093\/nar\/gkv1217”,“文章标题”:“WormBase2016:扩展以实现蠕虫基因组研究”,“卷”:“44”,“作者”:“Howe”,“year”:“2016”,“journal-title”:“核酸研究”},{“key”:“2019102305091735000_B13”,“doi-asserted-by”:“crossref”,”first page“:”1034“,”doi“:”10.1101\/gr.3715005“,”article-title“:”脊椎动物、昆虫、蠕虫和酵母基因组中进化保守元素“,”volume“:“15”,”author“:”Siepel“,”year“:”2005“,”journal-title“基因组研究“},{“key”:“2019102305091735000_B14”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”D650“,“doi”:“10.1093\/nar\/gkw893”,“article-title”:“CeNDR,秀丽隐杆线虫自然多样性资源”,“volume”::“45”,“author”:“Cook”,“year”:“2017”,“journal-title“:”核酸研究“},{“key”:蒂尔”:“Cram-JS:节点和浏览器中基于引用的解压缩”,“卷”:“2019”,“作者”:“Buels”,“年份”:“199”,《期刊标题》:“生物信息学”},{“密钥”:“201 91023050 91735000_B16”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“1775”,“doi”:“10.1126\/science.1196914”,“article-title”:“通过modENCODE项目对秀丽隐杆线虫基因组进行综合分析”,“卷”:“330”,“作者”:“Gerstein”,“年份”:“2010年”,“期刊标题”:“科学”},{“关键”:“2019102305091735000_B17”,“doi-asserted-by”:“crossref”,《首页》:“W468”,“doi”:“10.1093”,“volume”:“42”,“author”:“Kalderimis”,“year”:“2014”,“journal-title”:“Nucleic Acids Res.”},{“key”:”2019102305091735000_B18“,“doi-asserted-by”:“crossref”,”first page“:”2692“,”doi“:”10.1093\/生物信息学,“author”:“Hibbs”,“year”:“2007”,“journal-title”:“Bioinformatics”},{“key”:“2019102305091735000_B19”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-pages”:“44”,“doi”:“10.1109\/5992.764215”,“article-title“:”AceDB:A genome database management system“,”volume“1”,“auther”:“Stein”,“年份”:“1999”,“日记标题”:“Compute.Sci.Eng.”},{“key”:“2019102305091735000_B20”,“doi断言由”:“crossref”,“doi”:“10.1093\/database\/bay013”,“文章标题”:“微出版:激励社区策展并将未发表的数据放入公共领域”,“卷”:“2018”,“作者”:“Raciti”,“年”:“2018”,“期刊标题”:“数据库”}],“容器标题”:[“核酸研究”],“原标题”:[],“语言”:“en”,“链接”:[{“URL”:“http://\/actical.oup.com/nar\/advance-article-pdf \/doi \/10.1093 \/nar \/gkz920 \/30264162 \/gkz 920.pdf”,“内容类型”:“application\/pdf”,“content-version”:“vor”,“intended-application”:“syndication”},{“URL”:“http://www.advance.article.pdf \/odoi \/10.1093\/nar \/gkz920 \/30264162 \/gkz920.pdf“,”内容类型“:”未指定“,“content-version”:“vor”,“intended-application”:“similarity-checking”}],“deposed”:{“date-parts”:[[2019,10,23]],“date-time”:“2019-10-23T09:09:38Z”,“timestamp”:1571821778000},“score”:1,“resource”:{primary“URL”:“https:\/\/cademicial.oup.com/nar\/advance-article\/doi\/10.1093\/nar\/gkz920\/5603222”}},“副标题”:[],“短标题”:[],“已发布”:{“date-parts”:[[2019,10,23]]},“references-count”:20,“URL”:“http://\/dx.doi.org\/10.1093\/nar\/gkz920”,“relation”:{},”ISSN“:[”0305-1048“,”1362-4962“],“ISSN-type”:[{“value”:“0305-048”,“type”:“print”},{“value”:“1362-4992”,“类型”:“electronic”}],“subject”:[],“已发布”:{“日期部分”:[[2019,10,23]]}}