{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{-“日期-部分”:[[2024,5,17]],“日期-时间”:“2024-05-17T13:30:44Z”,“时间戳”:1715952644092},“引用-计数”:8,“出版商”:“牛津大学出版社(OUP)”,“问题”:“13”,“内容-域”:{“域”:[],“交叉标记限制”:false},”short-container title“:[],“published-print”:{“日期部分”:[[2016,7,1]]},“摘要”:“摘要<\/jats:title>\n动机:大量的冗余测序基因组阻碍了分析和功能注释蛋白质的工作。由于病毒的分类没有统一的定义,病毒蛋白质组在这方面提出了特殊的挑战。根据其蛋白质在蛋白质组尺度上的相似性对病毒进行分组,可以针对潜在的分类命名异常进行标准化<\/jats:p>\n结果:我们提出了病毒参考蛋白质组(Viral RP),它是根据UniProtKB中的完整病毒蛋白质组计算得出的。提供了基于蛋白质组相似性簇中95、75、55、35和15%共同成员的病毒RP。我们的计算病毒RP与UniProt\u2019馆长选择的参考蛋白质组的比较表明,这两组是一致的和互补的。此外,每个病毒RP代表一组与病毒或宿主分类学一致的病毒蛋白质组。我们提供病毒RP蛋白序列的BLASTP搜索和FTP下载,以及一个浏览器,以便于可视化病毒RP<\/jats:p>\n可用性和实现:\u00a0http:\/\/proteininformationresource.org\/rps\/viruses\/<\/jats:p>\n联系人:\u00a0chenc@udel.edu<\/jats:p>\n补充信息:\u00a0生物信息学在线提供补充数据<\/jats:p>“,”DOI“:”10.1093\/生物信息学\/btw110“,”type“:”期刊文章“,”created“:{”日期部分“:[[2016,2,27],”日期时间“:”2016-02-27T02:10:41Z“,”时间戳“:1456539041000},”page“:”2041-2043“,”source“:”Crossref“,”被计数引用“:3,”title“:[”病毒参考蛋白质组的计算聚类“],”prefix“:”10.1093“,”volume“:”32“,”author“:[{”given“:”Chuming“,”family“:”Chen“,”sequence“:”first“,”affiliation“:”[{“name”:“1美国特拉华大学生物信息学和计算生物学中心,纽瓦克,DE 19711”}]},{“given”:“Hongzhan”,“family”:“Huang”,“sequence”:“additional”,“affiliance”:1特拉华大学生物信息学和计算生物学中心,纽瓦克,DE 19711,美国“}]},{”given“:”Raja“,”family“:”Mazumder“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”2美国华盛顿特区乔治华盛顿大学生物化学和分子医学系,20037“}]neneneep,{“given”:“Darren 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