{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{-“日期-部件”:[[2024,4,17]],“日期-时间”:“2024-04-17T11:58:28Z”,“时间戳”:1713355108793},“参考-计数”:18,“出版商”:“牛津大学出版社(OUP)”,“问题”:“2”,“许可证”:[{“开始”:{:“日期-零件”:[2016,10,2]],“时间”:“2016-10-02T00:00:00Z”,“时间戳”:1475366400000},“content-version”:“vor”,“delay-in-days”:1055,“URL”:“http://\/creativecommons.org\/licenses\/by-nc\/3.0\/”}],“content-domain”:{“domain”:[],“crossmark-restriction”:false},”short-container-title“:[],”published-print“:{”date-parts“:[[2014,15]]}”,“abstract”:“”摘要<\/jats:title>\n摘要:高通量技术导致了可用于自动分析的基因组数据的爆炸式增长。因此,沿着基因表达流同时采集多个变异层的可能性需要计算方法整合来自不同\u2018-omics\u2019的原始信息。最近的研究表明,翻译控制是一种普遍存在的现象,具有深刻且仍被低估的调节能力。尽管检测总信使RNA(mRNAs;转录组)、多体加载的mRNAs(翻译组)和蛋白质(蛋白质组)水平的变化在实验上是可行的,但这些水平的整合还远未得到有力的实现。在这里,我们介绍了tRanslotome,这是一个新的R\/Bioconductor软件包,它是同时对转录组、翻译组和蛋白质组数据进行成对分析的完整平台。该软件包包括为分析高通量数据而开发的大多数可用统计方法,允许对差异表达的基因和相应的差异丰富的生物主题进行平行比较。值得注意的是,它还可以预测mRNA序列上的翻译调控元件。通过两个案例研究证明了该工具的实用性<\/jats:p>\n可用性和实施:tRanslotome在Bioconductor中可用<\/jats:p>\n联系人:t.tebaldi@unitn.it<\/jats:p>\n补充信息:\u00a0生物信息学在线提供补充数据<\/jats:p>“,”DOI“:”10.1093\/生物信息学\/btt634“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2013,11,13]],”date-time“:”2013-11-13T02:59:11Z“,”timestamp“:1384311551000},”page“:“289-291”,“source”:“Crossref”,“is-referenced-by-count”:18,“title”:[“tRanslatome:an 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