{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{“日期-部分”:[[2024,6,6]],“日期-时间”:“2024-06-06T18:42:58Z”,“时间戳”:1717699378047},“引用-计数”:23,“发布者”:“牛津大学出版社(OUP)”,“问题”:“3”,“内容-域”:{-“域”:[],“交叉标记限制”:false},”short集装箱舱位“:[],“published-print”:{“date-parts”:[[2012,2,1]]},“abstract”:“摘要<\/jats:title>\n动机:果蝇的神经科学数据来源多种多样,使得综合搜索和检索变得困难。这方面的一个主要障碍是缺乏全面和逻辑结构的解剖框架和直观的界面<\/jats:p>\n结果:我们提供了一个在线资源,为研究和查询苍蝇大脑解剖、表达和遗传数据提供了方便的方法。我们将新开发的成年苍蝇大脑BrainName命名法扩展为一个逻辑结构本体,该本体将一系列已发布的神经元类与它们所支配的大脑区域联系起来。虚拟飞行大脑界面允许用户通过浏览大脑的3D图像来探索果蝇大脑的结构,子区域显示为彩色叠加。集成的查询机制允许从社区数据库中复杂地搜索基础解剖、细胞、表达和其他数据<\/jats:p>\n可用性:Virtual Fly Brain在www.virtualflybrain.org上免费提供联系人:\u00a0jda@inf.ed.ac.uk“,”DOI“:”10.1093\/生物信息学“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2011,12,18]],”date-time“:”2011-12-18T01:44:35Z“,”timestamp“:1324172675000},”page“:“411-415”,“source”:“Crossref”,“is-referenced-by-count”:96,“title”:[“The Virtual Fly Brain browser and query interface”],“前缀”:“10.1093”,“卷”:“28”,“作者”:[{”given“:”Nestor“,”family“:”Milyaev“,“sequence”:“first”,“affiliation”:[{“name”:“1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,3MRC人类遗传学单位和英国爱丁伯格大学遗传与分子医学研究所”}]},{“given”:“David”family“:”Osumi-Sutherland“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,以及3MRC人类遗传学股和英国爱丁伯格大学遗传与分子医学研究所“}]},{”given“:”Simon“,”family“:”Reeve“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{“name”:“1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,以及3MRC人类遗传学单位和英国爱丁伯格大学遗传与分子医学研究所”}]},{“given”:“Nicholas”,“family”:“伯顿“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,英国爱丁伯格大学3MRC人类遗传学单位和遗传与分子医学研究所“}]},{”given“:”Richard A.“,”family“:”Baldock“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{“name”:“1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,英国爱丁伯格大学3MRC人类遗传学组和遗传与分子医学研究所”}]},{“given”:“J.Douglas”,“family”:“Armstrong”,“sequence“:”additional“,”affiliation“:[{“name”:“1英国爱丁堡大学信息学院,2英国剑桥大学遗传学系,英国爱丁伯格大学3MRC人类遗传学组和遗传与分子医学研究所”}]}],“member”:“286”,“published on”:{“date-parts“:[[2011,12,16]]},”reference“:[{”key“:”2023012512165650800_B1“,”first page“:“36”,”article-title“:”ImageJ“的图像处理”,“volume”:“11”,“author”:“Abramoff”,“year”:“2004”,“journal-title”:“Bioptonics Int.”},{”key“:内政部“:”10.1109\/TVCG.2009.121“,”article-title“:”BrainGazer\u2013神经生物学研究可视化查询“,”卷“:”15“,”作者“:”布鲁克纳“,”年份“:”2009“,”期刊标题“:”IEEE Trans。视觉。计算。Graph“},{”key“:”2023012512165650800_B3“,”doi-asserted-by“:”crossref“,“first page”:“1”,“doi”:“10.1016\/j.cub.2010.11.056”,“article-title”:“以单细胞分辨率重建果蝇脑侧布线网络”,“volume”:”21“,”author“:”Chiang“,”year“:”2010“,”journal-title“:”Curr.Biol.“}”,{“key”:2023012512165650800_B4“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”D118“,”doi“:”10.1093\/nar\/gkq999“,”article-title“:”REDfly v3.0:朝向果蝇转录调控元件的综合数据库“,”volume“:“39”,“author”:“Gallo”,“year”:“2011”,“journal-title”:“核酸研究”},{“key”:“202301251121656508000_B5”,“article-title“:”OWL API:使用OWL 2本体的Java API”,“volume-title”:“第六届OWL国际研讨会论文集:经验和方向(OWLED 2009),美国弗吉尼亚州尚蒂利”,“作者”:“霍里奇”,“年份”:“2009”},{“key”:“2023012512165650800_B6”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“924”,“doi”:“10.1007\/978-3-642-10331-5_86“,“article-title”:“Woolz IIP:三维立体地图集的平铺式实时切片服务器”,“volume”:“5875”,“author”:“Husz”,“year”:“2009”,“journal-title“:Adv.Vis。计算。“},{”key“:”2023012512165650800_B7“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“761”,”doi“:”10.1242\/dev.124.4.761“,”article-title“:”果蝇蘑菇体是克隆单位的四重结构,每个克隆单位都包含一组几乎相同的神经元和胶质细胞“,”volume“:124”,“author”:“Ito”,“year”:“1997”,“journal-title”:“”开发“},{“key”:“2023012512165650800_B8”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”D418“,“doi”:“10.1093\/nar\/gkh014”,“article-title”:“Flytrap,一个记录黑腹果蝇GFP蛋白陷阱插入屏幕的数据库”,“volume”:“32”,“author”:“Kelso”,“year”:“2004”,“journal-title“:”核酸研究“}2023012512165650800_B9”,“doi断言者”:“crossref”,“首页”:“baq005”,“doi”:“10.1093\/database\/baq005”,“文章标题”:“BrainTrap:果蝇大脑中3D蛋白表达模式的数据库”,“卷”:“2010”,“作者”:“Knowles Barley”,“年份”:“2010”,“期刊标题”:“数据库”},{“键”:“2023012512165650800_B10”,“doi断言者”:“crossref”,“第一页”:“243”,“DOI”:“10.1016/S0092-8674(02)00700-6”,“文章标题”:“果蝇大脑中肾小球嗅觉图的表示”,“卷”:“109”,“作者”:“Marin”,“年”:“2002”,“期刊标题”:“Cell”},{“key”:“2023012512165650800_B11”,“DOI断言者”:“crossref”,“第一页”:“i337”,“DOI”:“10.1093\/生物信息学\/btm189”,“article-title“:“Chado案例研究:一个基于本体论的模块化模式,用于表示基因组相关生物信息”,“卷”:“23”,“作者”:“Mungall”,“年份”:“2007年”,“期刊标题”:“生物信息学”},{“键”:“2023012512165650800_B12”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“348”,“doi”:“10.1038”V3D支持大规模生物图像数据集的实时三维可视化和定量分析”,“卷”:“28”,“作者”:“彭”,“年份”:“2010”,“期刊标题”:“自然生物技术”。“},{”key“:”2023012512165650800_B13“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“493”,”doi“:”10.1038\/nmeth.1602“,”article-title“:”BrainAligner:果蝇大脑3D注册图谱“,”volume“::”8“,”author“:”Peng“,”year“:”2011“,”journal-title ted-by“:”crossref“,”首页“:”1605“,”DOI“:”10.1002\/jcc.20084“,”article-title“:”UCSF Chimera\u2013a探索性研究和分析可视化系统“,”volume“:”25“,”author“:”Pettersen“,”year“:”2004“,”journal-title”:“J.Compute。化学。“},{”key“:”2023012512165650800_B15“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“119”,”doi“:”10.1016\/0167-8655(85 _B16“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”5534“,”doi“:”10.1523\/JNEUROSCI.4708-05.2006“,”article-title“:”果蝇大脑的神经谱系:幼虫晚期谱系位置和投射模式的三维数字地图集“,”volume“:“26”,”author“:”Pereanu“,“year”:“2006”,“journal-title”:“J.Neurosci”。“},{”key“:”2023012512165650800_B17“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-pages“:”93“,”doi“:”10.1016\/S0960-9822(99)80021-9“,“article-title”:“果蝇视叶定量三维模型”,“volume”:“9”,“author”:“Rein”,“year”:“1999”,“journal-title“:”Curr.Biol.“}”,{“key”:”202302301251216508000_B18“,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页“:”227“,”DOI“:”10.1016\/S0960-9822(02)00656-5“,”文章标题“:”果蝇标准大脑“,”卷“:”12“,”作者“:”Rein“,”年份“:”2002“,”期刊标题“:“Curr”。Biol.“},{“key”:“2023012512165650800_B19”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:”807“,“doi”:“10.1002 \/cne.22540”,“article-title”:“Flybrain neuron database:a complex database system of the Drosophila brain neurons”,“volume”:《519》,“author”:“Shinomya”,“year”:“2011”,“journal title”:”J.Comp.Neurol.“0800_B20“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”749“,”doi“:”10.1016\/B978-012387582-2\/50040-X“,”article-title“:”Amira:一个高度交互的可视化数据分析系统“,”volume-title”:“可视化手册。“,”author“:”Stalling“,”year“:”2005“},{”key“:”2023012512165650800_B21“,”首页“:”292“,”文章标题“:”FaCT++描述逻辑推理器:系统描述“,”volume“:”4130“,”author“:”Tsarkov“,”year“:”2006“,”期刊标题“:”Lect.Notes Artifact.Intell.“},{”key“:”2023012512165650800_B22“,”doi asserted by“:”crossref“,”首页“:”D555“,“内政部”:“10.1093\/nar\/gkn788“,”article-title“:“FlyBase:增强果蝇基因本体注释”,“volume”:“37”,“author”:“Tweedie”,“year”:“2009”,“journal-title”:“核酸研究”},{“key”:”2023012512165650800_B23“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”45“,”doi“:”10.1016\/0896-6273(95)90063-2“,”article-titel“:”果蝇蘑菇体的增强子陷阱表达模式细分”,“卷”:“15”,“作者”:“杨”,“年份”:“1995”,“日志标题”:“神经元”}],“容器标题”:[“生物信息学”],“原始标题”:[],“语言”:“en”,“链接”:[{“URL”:“https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article-pdf\/28\/3\/411\/48875965\/bioinformatics_28_3_411.pdf“,”content-type“:”application\/pdf“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”syndication“},{”URL“:”https:\//ademiciate.oup.com\/bionformatics \/articele-pdf \/28\/3\/411-/488759965\/boiinformations_28_411。pdf“,”content-type“:”未指定“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”similarity-checking“}],”deposed“:{”date-parts“:[2023,1,25]],”date-time“:”2023-01-25T14:46:51Z“,”timestamp“:1674658011000},”score“:1,”resource“:{primary”:{“URL”:“https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article\/28\/3\/411\/189584”}},“副标题”:[],“短标题“:[],”已发布“:{”date-parts“:[[2011,12,16]]},“references-count”:23,“journal-issue”:{“issue”:“3”,“published-print”:{“date-parts:[[2012,2,1]]}},”URL“:”http://\/dx.doi.org\/10.1093\/bioinformatics\/btr677“,”relationship“:{}”,“ISSN”:[“1367-4811”,“1367-4803”],“ISSN-type”:[{“value”:“1367-48”“,”type“:”electronic“},{”value“:“1367-4803”,“type”:“print”}],“subject”:[],“published-other“:{”date-parts“:[[2012,2,1]]},“published”:{“date-part”:[[2011,12,16]]}}