{“状态”：“确定”，“消息类型”：“工作”，“信息版本”：“1.0.0”，“邮件”：{“索引”：{-“日期-部件”：[[2024,5,20]]，“日期-时间”：“2024-05-20T14:29:04Z”，“时间戳”：1716215344785}，“参考-计数”：9，“出版商”：“牛津大学出版社（OUP）”，“发行”：“17”，“许可证”：[{“开始”：{-date-parts“：[2016,10,2]]，“时间”：“2016-10-02T00:00:00Z”，“时间戳”：1475366400000}，“content-version”：“vor”，“delay-in-days”：1902，“URL”：“http://\/creativecommons.org\/licenses\/by-nc\/2.5”}]，“content-domain”：{“domain”:[]，“crossmark-restriction”：false}，”short-container-title“：[]，”published-print“：{”date-parts“：[[2011,9,1]]}”，“abstract”：“”摘要<\/jats:title>\n小结：在这里，我们描述了在Galaxy平台中实现的一组工具，旨在使生物学家真正能够分析多个基因组比对。这些工具可通过基于web的图形用户界面和命令行界面使用<\/jats:p>\n可用性和实现：这个开源工具集是用Python实现的，已经集成到在线数据分析平台Galaxy中（公共网络访问：http://\/usegalaxy.org；下载：http://\/getgalaxy.org）。其他帮助可从http://\/useglaxy.org\/u\/dan\/p\/maf获得<\/jats:p>\n联系人：\u00a0james.taylor@emory.edu; anton@bx.psu.edu<\/jats:p>\n补充信息：\u00a0生物信息学在线提供补充数据<\/jats:p>“，”DOI“：”10.1093\/生物信息学\/btr398“，”type“：”journal-article“，”created“：{”date-parts“：[[2011,7,21]]，”date-time“：”2011-07-21T00:15:34Z“，”timestamp“：1311207334000}，”page“：，“卷”：“27”，“作者“：[{”given“：”Daniel“，”family“：”Blankenberg“，”sequence“：”first“，”affiliation“：”1The Huck Institutes for The Life Sciences and Department of Biochemicology and Molecular Biology，Penn State University，University Park，PA and 2Department of Biology and Departmentment of Mathematics and Computer Science，Emory Universion，Atlanta，GA，USA“}]}，{“given”：“James”，“family”：“Taylor”，“sequence”：“additional”，“affiliation”：[{“name”：“宾州州立大学哈克生命科学研究院和生物化学与分子生物学系，宾夕法尼亚大学帕克分校，美国佐治亚州亚特兰大埃默里大学生物系和数学与计算机科学系”}]}，{“given”：“Anton”，“family”：“Nekrutenko”，“sequence”：“additional”，“affiliation”：[{“name”：“1宾夕法尼亚州立大学哈克生命科学研究院和生物化学与分子生物学系，宾夕法尼亚大学帕克分校，2美国佐治亚州亚特兰大埃默里大学生物系和数学与计算机系”}]}，{“name”：“The Galaxy Team”，“sequence”：“additional”，“affiliation”：[]}]，“member”：“286”，“published-online”：{“date-parts”：[[2011,7,19]]}，“reference”：[{“issue”：“Suppl.12”，“key”：“2023012511530050000_B1”，“doi-asserted-by”：“crossref”，“first page”：“Galaxy CloudMan:交付云计算集群”，“volume”：“11”，“author”：“Afgan”，“year”：“2010”，“journal-title”：“BMC生物信息学”}，{“key”：”2023012511530050000_B2“，”doi-asserted-by“：”crossref“，“doi”：“10.1002\/047114272.mb1910s89”，“article-title“：”Galaxy:一个面向实验学家的基于网络的基因组分析工具“，”author“：”Blankenberg“，”year“：”2010“，”journal-title“:”Curr.Protoc.Mol.Biol.“}，{”键“：“2023012511530050000_B3”，“doi asserted by”：“crossref”，“首页”：“960”，“doi”：“10.1101\/gr..5578007”，“文章标题”：“ENCODE数据协作分析框架：使大规模分析对生物学家友好”，“卷”：“17”，“作者”：“Blankenberg”，“年份”：“2007”，“期刊标题”：“基因组研究”}，{“密钥”：“2023012511530050000_B4”，“doi-asserted-by”：“crossref”，“first page”：“D876”，“doi”：“10.1093\/nar\/gkq963”，“article-title”：“The UCSC Genome Browser database:update 2011”，“volume”：”39“，”author“：”Fujita“，”year“：”2011“，”journal-title“：”Nucleic Acids Res.“}，{“key”：“doi”：“10.1186\/gb-2010-11-8-R86”，“article-title”：“Galaxy:支持生命科学中可访问、可复制和透明计算研究的综合方法”，“volume”：“11”，“author”：“Goecks”，“year”：“2010”，“journal-title“：“Genome Biol.”}，{“key”：”2023012511530050000_B6“，”doi-asserted-by“：”crossref“，”first page“：”D493“，”doi“：”10.1093\/nar\/gkh103“，“article-title”：“The UCSC Table Browser data retrieval tool”，“volume”：“32”，“author”：“Karolchik”，“year”：“2004”，“journal-title）：“Nucleic Acids Res.”}，{“key”：”2023012511530050000_B7“，”doi-serted-by“：”crossref“，”first page“：”996“，“doi”：“10.1101\/gr.229102”，“artice-title“：”UCSC的人类基因组浏览器“，”volume“：“12”，“author”“Kent”：”“，”年份“：”2002“，“journal-title”：“Genome Res.”}，{“key”：“2023012511530050000_B8”，“doi-asserted-by”：“crossref”，“first page”：”1797“，”doi“：”10.1101\/gr.6761107“，”article-title“：”UCSC Genome Browser中28天脊椎动物排列和保护轨迹“，”volume“：”17“，”author“：”Miller“，”year“：”2007“，”journal-title“:”Genome Res.“}，”{“密钥”：“204301251153000 50000_B9英寸，“doi-asserted-by”：“crossref”，“first page”：“10.5.1”，“doi”：“10.1002\/0471250953.bi1005s19”，“article-title”：“Using galaxy to perform massical interactive data analysis”，“volume”：”19“，“author”：“Taylor”，“year”：“2007”，“journal-title“：”Curr.Protoc.Bioninform.“}]，“container-title“URL”：“https:\/\/cademicial.oup.com/bioninformatics\/article-pdf\/27\/17\/2426\/48863592\/bioinformatics_27_17_2426.pdf”，“content-type”：“application\/pdf”，“内容版本”：“vor”，“intended-application”：“syndication”}，{“URL”：“http:\/\/tademiciational.oup.com\/bioinformatics\-article-pdf\/27 \/17\/2426\/4886358292\/boinformatics _27_17”_2426.pdf“，”内容类型“：“unspecified”，“content-version”：“vor”，“intended-application”：“similarity-checking”}]，“deposed”：{“date-parts”：[[2023,1,25]]，“date-time”：“2023-01-25T11:57:42Z”，“timestamp”：1674647862000}，“score”：1，“resource”：{“primary”：“URL”：“https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article\/27\/2426\/223983”}}，副标题“：[]，”短标题“：[]，”已发布“：{“date-parts”：[[2011,7,19]]}，“references-count”：9，“journal-issue”：{问题：“17”，“published-print”：{-“date-ports”：[2011,9,1]]}}，”URL“：”http://\/dx.doi.org\/10.1093\/生物信息学\/btr398“，”关系“：{}”，“ISSN”：[“1367-4811”，“1367-4803”]，“ISSN-type”：[{“value”：“1367-4811”，“类型”：“电子”}，{“值”：“1367-4803”，“种类”：“打印”}]，“主题”：[]，“已发布的其他”：｛“日期部分”：[[2011,9,1]]｝，“已发布”：｛“日期部分”：[[2011,7,19]]｝｝