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Suite)是一个软件包,用于根据DNA序列匹配位置权重矩阵。MOODS实现了最先进的在线匹配算法,与简单的强制搜索相比,扫描速度要快得多。MOODS是用C++编写的,带有流行的BioPerl和Biopython工具包的绑定。它可以很容易地适应不同的目的,并集成到现有的工作流中。它也可以用作C++库<\/jats:p>\n可用性:包含文档和使用示例的软件包可在http://www.cs.helsinki.fi\/group\/pssmfind上获得。源代码也可以根据GNU通用公共许可证(GPL)的条款获得<\/jats:p>\n联系人:\u00a0janne.h.korhonen@helsinki.fi“,”DOI“:”10.1093\/生物信息学“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2009,9,23]],”date-time“:”2009-09-23T01:21:44Z“,”timestamp“:1253668904000},”page“:“3181-3182”,“source”:“Crossref”,”is-referenced-by-count“:151,”title“:[”MOODS:快速搜索DNA序列中的位置权重矩阵匹配“],”prefix“:“10.1093”,“volume“:”25“,”author“:[{“given”:“Janne”,“family”:“Korhonen”,“sequence”:“first”,“affiliation”:“{“name”:“1芬兰赫尔辛基大学赫尔辛基信息技术研究所计算机科学系和2意大利帕多瓦大学信息工程系”}]},{“given”Martinm\u00e4ki“,”sequence“:”additional“,”affiliation“:[{”name“:”1芬兰赫尔辛基大学计算机科学和赫尔辛基信息技术研究所系和2意大利帕多瓦大学信息工程系“}]},{”given“:”Cinzia“,”family“:”Pizzi“,”sequence“:”additionable“,”affiliation“:[{“name”:“1芬兰赫尔辛基大学计算机科学和赫尔辛基信息技术研究所系,2意大利帕多瓦大学信息工程系”}]},{“given”:“Pasi”,“family”:“Rastas”,“sequence”:“additional”,“affiliance”:[{name”:1芬兰赫尔辛基大学计算机科学和赫尔辛基信息技术研究所系和2意大利帕多瓦大学信息工程系“}]},{“given”:“Esko”,“family”:“Ukkonen”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[{“name”:“1芬兰赫尔辛基大学计算机科学和赫尔辛基信息技术研究所系和2意大利帕多瓦大学信息工程系“}]}],“成员”:“286”,“在线发布”:{“日期-部件”:[[2009,9,22]]},“引用”:[{“密钥”:“2023013112174936600_B1”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页“:”389“,”DOI“:”10.1186\/1471-2105-7-389“;”article-title“:”匹配位置特定评分矩阵的快速基于索引的算法“,”volume“:”7“,”author“:”Beckstette“,”year“:”2006“,”journal-title”:“BMC生物信息学”},{“key”:“2023013112174936600_B2”,“DOI-asserted-by”:“crossref”,”first 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