{“状态”：“确定”，“消息类型”：“工作”，“信息版本”：“1.0.0”，“邮件”：{“索引”：{“日期-部分”：[[2024,6,6]]，“日期-时间”：“2024-06-06T05:58:54Z”，“时间戳”：17176534490}，“引用-计数”：0，“出版商”：“牛津大学出版社（OUP）”，“问题”：“14”，“内容-域”：{-“域”：[]，“交叉标记限制”：false}，”short集装箱舱位“：[]，“published-print”：{“date-parts”：[[2006,7,15]]}，“抽象”：“摘要<\/jats:title>\n动机：蛋白质相互作用在生物过程中起着关键作用，许多生物学家试图发现或预测与这些相互作用有关的关键信息。在验证生物实验室工作中的相互作用之前，有必要从以前的研究中验证它们。尽管已经做出了很多努力来创建数据库，以结构化的形式存储验证过的信息，但许多交互信息仍然是非结构化的文本。随着新出版物数量的迅速增加，大量研究试图从文本中自动提取交互作用。然而，在将自动生成的结果应用于手动标注的数据库的过程中，仍然存在各种困难。对于手动存储的数据库中没有的交互，研究人员试图搜索摘要或全文<\/jats:p>\n结果：由于搜索了两种蛋白质，PubMed经常返回数百个摘要。本文介绍了一种验证PubMed摘要中蛋白质-蛋白质相互作用的方法。自动从两个给定的蛋白质生成查询，然后从PubMed中收集摘要。然后，识别目标蛋白质及其同义词，并从集合中提取其交互信息。研究发现，DIP-PPI语料库中67.37%的交互作用来自PubMed摘要，87.37%的相互作用来自给定的全文<\/jats:p>\n可用性：联系作者<\/jats:p>\n联系人：\u00a0janghc@etri.re.kr“，”DOI“：”10.1093\/生物信息学“，”type“：”journal-article“，”created“：{”date-parts“：[[2006,7,27]]，”date-time“：”2006-07-27T15:38:03Z“，”timestamp“：1154014683000}，”page“：“e220-e226”，“source”：“Crossref”，“is-referenced-by-count”：47，“title”：[“从PubMed摘要中寻找蛋白质相互作用的证据”]，“前缀“：”10.1093“，“卷”：“22”，“作者”：[{“给定”：“现代”，“家族”：“张”，“序列”：“第一”，“从属关系”：[}“名称”：“电子与电信研究所（ETRI）生物信息团队1\u00a0 1\u000a0\u00a0-Gajeong-Dong，Yuseong-Gu，Daejeon，305-350，Korea”}]}，{“已知”：“Jaeso”，“家庭”：“Lim”，“顺序”：“附加”，“附属关系”：[{“name“：”电子与电信研究所（ETRI）生物信息学团队1\u00a0 1\u00 a0\u00 a0 Gajeong-Dong，Yuseong-Gu，Daejeon，305-350，Korea“}]}，{“given”：“Joon-Ho”，“family”：“Lim”，“sequence”：“additional”，“affiliation”：[{“name”：“电子与电信研究所（ETR）生物信息团队1\u00a0 1\u00a0\u00a 0 Gajeong-Dong，Yuseong-Gu，Daejeon，305-350，Korea“}]}，{“given”：“Soo-Jun”，“family”：“Park”，“sequence”：“additional”，“affiliation”：[{“name”：“电子与电信研究所生物信息团队（ETRI）1\u00 a0 1\_00A0\u00 a0-Gajeong-Dong，Yuseong-Gu，Daejion，305~350，Koera“}”，{l“，”family“：”Lee“，”sequence“：”additional“，”affiliation“：[{”name“：”中南国立大学计算机工程系2\u00a0 2\u000a0\u00a0Gung-Dong，Yuseong-Gu，Daejeon，305-764，Korea“}]}，{”given“：”Seon-Hee“，”family”：“Park”，“sequence”：“additional”，“affiliance”：电子与电信研究所（ETRI）生物信息学团队1_00a0 1\u00a0\u00a0-0 Gajeong-Dong，Yuseong-Gu，Daejeon，305-350，Korea“}]}]，“成员”：“286”，“在线发布”：{“日期-部件”：[[2006,7,15]]}，“容器-标签”：[“生物信息学”]，“原始标题”：[]，“语言”：“en”，“链接”：[{“URL”：“https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article-pdf\/22\/14\/e220\/48839297\/bioinformatics_22_14_e220.pdf“，”content-type“：”application\/pdf“、”content-version“：”vor“，”intended-application“：”syndication“}，{”URL“：”https:\//ademiciational.oup.com\/bio-informatics \/articele-pdf \/22_/14\e220\/4839297\/bionformatic_22_14 _e220。pdf“，”内容类型“：”unspecified“，”content-version“：”vor“，”intended-application“：”similarity-checking“}]，”deposed“：{”date-parts“：[2023,1,24]]，”date-time“：”2023-01-24T09:03:26Z“，”timestamp“：1674551006000}，”score“：1，”resource“：”{“primary”：{“URL”：“https:\//ademicial.oup.com/bioinformatics\/article\/22\/14\/e220\/227798”}}，“副标题”：[]，“短标题”：[]，“已发布”：{“date-parts“：[[2006,7,15]]}，“references-count”：0，“journal-issue”：{“issue”：“14”，“published-print”：{“date-part”：[[2006，7,15]]}}，”URL“：”http://\/dx.doi.org\/10.1093\/btl203“，”relationship“：{}”ISSN“：[”1367-4811“，”1367-4803“]，”ISSN-type“：[{“value”：“1367-483”11“，”类型“：”电子“}，{”值“：”1367-4803“，”型号“：”打印“}]，”主题“：[]，“published-other“：{“date-parts”：[[2006,7,15]]}，“published”：{（日期部分）：[[2006，7,15]]}}}