{“状态”：“确定”，“消息类型”：“工作”，“信息版本”：“1.0.0”，“邮件”：{“索引”：{“日期-部分”：[[2024,6,6]]，“日期-时间”：“2024-06-06T21:17:46Z”，“时间戳”：171770866140}，“引用-计数”：38，“出版商”：“牛津大学出版社（OUP）”，“问题”：“3”，“内容-域”：{-“域”：[]，“交叉标记限制”：false}，”short-container title“：[]，“published-print”：{“date-parts”：[[2005,2,1]]}，“abstract”：“摘要<\/jats:title>动机：代谢途径和结构的存在或缺失为蛋白质注释提供了更可靠的背景。跨微生物基因组编译此类信息可以改进蛋白质的功能分类，并为比较基因组学提供宝贵的资源<\/jats:p>结果：我们创建了一个基因组属性系统，使用标准化计算方法和受控词汇表展示原核生物的关键方面。属性反映了基因含量、表型、系统发育和计算分析。使用隐马尔可夫模型的搜索结果允许自动推断许多属性，特别是对于自上一个共同祖先以来在功能上保守的蛋白质家族（等价物）。其他属性来自策展、发布的报告和其他形式的证据。基因组属性系统应用于156个完整的原核基因组，很容易挖掘出物种之间的差异、代谢特征与未标记蛋白质家族之间的相关性或属性之间的关系<\/jats:p>可用性：基因组属性可在http://www.tigr.org\/Genome_Properties上找到联系人：\u00a0selengut@tigr.org<\/jats:p>补充信息：\u00a0http://www.tigr.org\/tigr-scripts\/CMR2\/genemo_properties_references.spl<\/jats:p>“，”DOI“：”10.1093\/bioinformations\/bti015“，”type“：”journal-article“，”created“：{”date-parts“：[[2004,9,7]]，”date-time“：”2004-09-07T07:33:02Z“，”timestamp“：1094542382000}，”page“：“293-306”，“source”：“Crossref“，”is-referenced-by-count“：59，”title“：[“基因组属性：微生物学、基因组注释和比较基因组学原核遗传内容调查系统”]，“前缀”：“10.1093”，“卷”：“21”，“作者”：[{“给定”：“Daniel H.”，“家族”：“Haft”，“序列”：“第一”，“从属关系”：[}“名称”：“基因组研究所9712 Medical Center Drive，Rockville，MD 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endosymbiont）包含组氨酸生物合成酶编码基因。Curr.Microbiol.37356\u2013358”，“DOI:”10.1007\/s002849900392“}，}”：“2023051305563483400_B6“，“非结构化”：“Delcher，A.L.，Harmon，D.，Kasif，S.，White，O.，Salzberg，S.L.1999使用GLIMMER改进微生物基因鉴定。核酸研究274636\u20134641“}，{“key”：“2023051305563483400_B7”，“doi-asserted-by”：“crossref”，“unstructured”：“Farabaugh，P.J.2000翻译移码：翻译框架维持机制的含义。Prog.Nucleic Acid Res.Mol.Biol.64131\u2013170”，“doi”：“10.1016\/S0079-6603（00）64004-7”}，}“key:”2023051305563483400_B8“，“doi-asserted-by”：“crossref”，“unstructured”：“Finkel，S.E.和Kolter，R.2001DNA作为营养素：细菌能力基因同源物的新作用。细菌学杂志.1836288\u20136293“，”DOI“：”10.1128\/JB.183.21.6288-6293.2001“}，{”key“：”2023051305563483400_B9“，”unstructured“：”Fitch，W.M.1970“区分同源蛋白与类似蛋白。系统Zool.1999\u2013113“}”，{“key”：“20230513055063483400 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