{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{“日期-部分”:[[2024,6,6]],“日期-时间”:“2024-06-06T22:01:28Z”,“时间戳”:1717711288694},“引用-计数”:0,“出版商”:“牛津大学出版社(OUP)”,“问题”:“1”,“内容-域“:{”域“:[],“交叉标记限制”:false},”short集装箱舱位“:[],“已发表的印刷品”:{“日期部分”:[[2002,1,1]]},“摘要”:“摘要<\/jats:title>\n动机:突变表型生长实验是功能基因组数据的一个重要新来源,在生物信息学中很少受到关注。我们将监督机器学习应用于利用表型数据预测酿酒酵母开放阅读框(ORF)功能类别的问题。使用了三个数据来源:翻译插入表型、酵母定位和表达(TRIPLES)、欧洲功能分析网络(EUROFAN)和慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)。对数据的分析给机器学习带来了许多挑战:多类标签、大量稀疏的类、需要学习一组准确的规则(不是完整的分类)以及大量的缺失值。我们修改了C4.5算法来处理这些问题<\/jats:p>\n结果:学习到的规则准确且具有生物学意义。这些规则预测了83个未知函数的ORF的函数,估计精度为80%<\/jats:p>\n可用性:数据和完整结果可在http://\/users.aber.ac.uk\/ajc99\/phempication\/上获得<\/jats:p>\n联系人:ajc99@aber.ac.uk“,”DOI“:”10.1093\/生物信息学“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[[2002,7,26]],”date-time“:”2002-07-26T22:37:51Z“,”timestamp“:1027723071000},”page“:“160-166”,“source”:“Crossref”,“is-referenced-by-count”:48,“title”:[“从表型数据中机器学习功能类”],“前缀”:“10.1093”,“卷”:“18”,“作者“:[{“given”:“Amanda”,“family”:“Clare”,“sequence”:“first”,“affiliation”:[{name”:“威尔士大学计算机科学系,Aberystwyth SY23 3DB,UK”}]},{given:“Ross D.”,“家庭”:“King”,“序列”:“additional”286“,”published-online“:{“date-parts”:[[2002,1,1]]},“container-title”:[“生物信息学”],“原始标题”:[],“language”:“en”,“link”:[{“URL”:“https:\/\/cademicial.oup.com/Bioinformatics\/article-pdf\/18\/160\/48850403\/Bioinformatics_18_160.pdf”,“content-type”:“application\/pdf”、“content-version”:“vor”,“意向应用程序”:“联合”},{URL“:”https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article-pdf\/18\/160\/48850403\/bioinformatics_18_160.pdf“,”content-type“:”unspecified“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”similarity-checking“}”,“deposed”:{“date-parts”:[2023,1,25]],“date-time”:“2023-01-25T07:24:04Z”,“timestamp”:1674631444000},“score”:1,“资源”:{“主资源”:}URL“:”https:\/\/cademicial.oup.com/bioinformatics\/article\/18\/160\/244051“}},”subtitle“:[],”shorttitle“:[],”issued“:{”date-parts“:[[2002,1,1]]},“references-count”:0,“journal-issue”:{“issue”:“1”,“published-print”:{”date-ports“:[2002,1]]{,”URL“:“http://\/dx.doi.org \/10.1093 \/生物信息学\/18.1160“,”关系“:{},”ISSN“:[”1367-4811“,”1367-4803“],“issn-type”:[{“value”:“1367-4811”,“type”:“electronic”},{“value”:“367-4803”,“type”:“print”}],“subject”:[],“published-other”:{“date-parts”:[2002,1]]},“publish”:{-“date-ports”:[2002,1]]}}}}