{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{-“日期-部件”:[[2024,3,19]],“日期-时间”:“2024-03-19T23:17:41Z”,“时间戳”:1710890261386},“引用-计数”:46,“发布者”:“爱思唯尔BV”,“许可证”:[{“开始”:{-date-parts”:[2016,12]],“时间”:”2016-12-01T00:00:00 Z“,”timestamp“:148055040000},”content-version“:“tdm”,“延迟天数”:0,“URL”:“https:\/\/weelsevier.com\/tdm\/userlicense\/1.0\/”}],“资助者”:[{“DOI”:“10.13039\/501100003329”,“name”:“MINECO”,“DOI由”断言:“publisher”,“award”:[“MTM2013-46553-C3-1-P”]},{“DOI”:“10.13039\/50100008530”,“name”:“ERDF”,“DOI由”断言:“crossref”},{“DOI”:“10.13039\/50110000782”,“name”:“ESF”,“DOI断言者”:“publisher”},{“DOI”:“10.13039\/501000003329”,“name”:“经济和竞争力部”,“DOI-asserted-by”:“publish”,“award”:[“BES-2014-068640”]},}“DOI:”10.13039\/501100003086“,”name“:”巴斯克政府“,”DOI-assert-by“:”publisher“,”award“:[”BERC 2014-2017“]}:“经济与竞争力部”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“award”:[“SEV-2013-0323”]}],“content-domain”:{“domain”:[“elsevier.com”,“sciencedirect.com”],“crossmark-restriction”:true},“short-container-title”:[《计算物理杂志》],“published-print”:{“date-parts”:[[2016,12]]},”doi“10.1016\/jcp.2016.09.035”,“类型”:“journal-article”,“created”:{“date-parts”:[[2016,9,20]],“date-time”:“2016-09-2T23:30:24Z”,“timestamp”:1474414224000},“page”:“434-449”,“update-policy”:”http://\/dx.doi.org\/10.1016\/elsevier_cm_policy“,”source“:”Crossref“,“is-referenced-by-count”:19,“title”:[“分子模拟中优化能量守恒的自适应多级积分器”],“前缀”:“10.1016”,“卷”:“327”,“作者”:[{“给定”:“马里奥”,“家族”:“Fern\u00e1ndez-Pend\u00e 1s”,“序列”:“第一”,“从属”:[]},{“已知”:“Elena”,“族”:“Akhmatskaya”,“顺序”:“附加”,“附属”:[]},}“ORCID”:“http:\/\/orcid.org/0000-0001-7284-0971”,“authenticated orcid”:false,“given”:“J.M.”,“family”:“Sanz Serna”,“sequence”:“additional”,“affiliation”:[]}],“member”:“78”,“reference”:[{”issue“:“4”,“key”:“10.1016\/J.jcp.2016.09035_br0010”,“doi asserted by”:“crossref”,“first page”:“A1556”,“doi”:“10.1137\/1303932740”,“文章标题”:“混合蒙特卡罗方法的数值积分器”,“volume”:“36”,“author”:“Blanes”,“year”:“2014”,“journal-title”:“SIAM J.Sci.Compute.”},{“key”:”10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0020“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”216“,”doi“10.1016\/0370-2693(87)91197-X“,”article-title“:”Hybrid Monte Carlo“,”volume“:“195“,“作者”:“Duane”,“年份”:“1987”,“journal-title”:“Phys.Lett.B”},{“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0030”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“247”,“doi”:“101016\/0370-2693(91)90812-5”,“文章标题”:“广义引导蒙特卡罗算法”,“卷”:“268”,“作者”:“Horowitz”,“年份”:“1991”,“日记标题”:.Lett.B“},{”键“:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0040”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first page”:“456”,“doi”:“10.106\/S0550-3213(01)00129-8”,《article-title》:“自由场理论广义混合蒙特卡罗算法的代价”,“volume”:《607》,“author”:“Kennedy”,“year”:“2001”,“journal-title”:“Nucl.Phys.B”},{“key”:jcp.2016.09.035_br0050“,“series-title”:“数值微分方程稳定性问题的当前挑战”,“首页”:“39”,“article-title”:“马尔可夫链蒙特卡罗和数值微分方程”,“卷”:“第2082卷”,“作者”:“Sanz-Serna”,“年份”:“2014”},{“键”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0060”,“第一页”::“关于用对称合成法对常微分方程进行数值积分”,“卷”:“16”,“作者”:“麦克拉克伦”,“年份”:“1995”,“期刊标题”:“科学计算杂志”},{“键”:“10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0070”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“43”,“doi”:“101016\/0010-4655(95)00042-E”,《文章标题》:“GROMACS:a message-passing parallel molecular dynamics implementation”,“volume”:“91”,“author”:“Berendsen”,“year”:“1995”,“journal-title”:“Compute.Phys.Commun.”},{“issue”:“3”,“key”:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0080“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“435”,“doi”:“10.1021\/ct700301q”,“article-title“:“GROMACS 4:高效、负载平衡和可扩展的分子模拟算法”,“卷”:“4”,“作者”:“Hess”,“年份”:“2008”,“期刊标题”:“J.Chem.Theory Compute.”},{“问题”:“四”,“关键”:“10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0090”,“首页”:“787”,“文章标题”:“在高效分子模拟中结合随机和确定性方法”,“卷”:“11”,“作者”:“Escribano”,“年份”:“2013年”,“日志标题”:“中欧数学”},{“键”:“10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0100”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“2487”,“doi”:“101007\/s00894-014-2487-y”,“文章标题”:“GROMACS中的恒压混合蒙特卡罗模拟”,“volume”:“20”,“author”:“Fern\u00e1ndez-Pend\u00e”,“year”:“2014”,“journal-title”:“J.Mol.Model.”},{“key”:”10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0270“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”967“,”doi“:”10.1080\/00268976.2012.681311“,”article-title“:“具有改进采样精度的计算效率分子动力学积分器”,“卷”:“110”,“作者”:“Predescu”,“年份”:“2012”,“期刊标题”:“Mol.Phys.”},{“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0110”,“article-title”:“数值哈密顿问题”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0120”,“series-title”:“分子建模与模拟:跨学科指南”,“author”:“Schlick”,“year”:“2002”},{“key”:“10.116\/j.jcp.2016.00.9035_br0130”,“series-title”:《98年研究生数值分析指南》,“首页”:“119”,“article-title“:“分子动力学和相关应用的集成方案”,“卷”:“第26卷”,“作者”:“Skeel”,“年份”:“1999”},{“问题”:“1”,“关键”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0140”,“首页”:“203”,“文章标题”:“辛积分器家族:稳定性、准确性和分子动力学应用”:“1997”,“journal-title”:“J.Sci.Compute.”},{“key”:“10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0150”,“series-title”:《数值分析进展》,第一卷,“首页”:“147”,“文章标题”:“非线性稳定性的两个主题”,“作者”:“Sanz-Serna”,“年份”:“1991”}“,”首页“:”525“,”doi“:“10.1016\/0009-2614(95)00316-V”,“article-title”:“隐式中点方案模拟的化学系统动力学中的共振”,“volume”:“237”,“author”:“Mandziuk”,“year”:“1995”,“journal-title“:”Chem.Phys.Lett.“},{”key“:”10.1016\/jcp.2016.09.035_br0170“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first-page:“1”,“doi”:“10.1006\/jcph.1998.5879“,“article-title”:“分子动力学模拟中的非线性共振伪影”,“volume”:“140”,“author”:“Schlick”,“year”:“1998”,“journal-title“:”J.Compute.Phys.“},{“issue”:“2”,“key”:”10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0180“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”354“,”doi“:”10.1006\/jcph.1997.5740“,”article-title“:“重温常见分子动力学算法:St\u00f6rmer\u2013Leapfrog积分器的精度和最佳时间步长”,“volume”:“136”,“author”:“Mazure”,“year”:“1997”,“journal-title”:“J.Compute.Phys.”},{“key”:”10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0190“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“327”,“doi”:“10.1016\/0021-9991(77)90098-5”,“article-title”:“带约束系统笛卡尔运动方程的数值积分:正构烷烃分子动力学”,“体积”:“23”,“作者”:“Ryckaert”,“年份”:“1977年”,“期刊标题”:“J.Compute.Phys.”},{“key”:“10.1016\/J.jcp.2016.09.035_br0200”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“24”,“doi”:“10.016\/0021-9991(83)90014-1“,”article-title“:”Rattle:分子动力学计算的震动算法的“速度”版本“,”volume:“52”,“author”:“Andersen”,“year”:“1983”,“journal-title”:“J.Compute”。物理学。“},{”issue“:”1“,”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0210“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“117”,“doi”:“10.1006\/jcph.1994.1085”,“article-title”:“约束哈密顿系统中的辛数值积分器”,“volume”:“112”,“author”:“Leimkuhler”,“year”:“1994”,“journal-title“:”j.Compute.Phys.“}”,{“问题“:”4“,”密钥“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0220“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”687“,”doi“:”10.1007\/s10955-007-9470-2“,”article-title“:”约束哈密顿系统的遍历采样方案及其在分子动力学中的应用“,”volume“:“130”,”author“:”Hartmann“,”year“:”2008“,”journal-title”:“j.Stat.Phys。“},{”issue“:”7“,”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0230“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“845”,”doi“:”101093\/bioinformatics\/btt055“,”article-title“:”GROMACS 4.5:一个高通量、高度并行的开放源代码分子模拟工具包“,”volume“:”29“,”author“:”Pronk“,“year”:“2013”,”journal title“:“生物信息学”},键“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0240”,“系列标题”:“为Exascale解决软件挑战”,“第一页”:“3”,“文章标题”:“用GROMACS解决分子动力学模拟中的Exascale软件挑战”,“作者”:“P\u00e1ll”,“年份”:“2015”},{“密钥”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0250”,“doi断言者”:“crossref”,“第一页”:“4934”,“doi”:“10.1016\/j.jcp.2008.01.023“,”article-title“:”GSHMC:一种有效的分子模拟方法“,”volume“:”227“,”author“:”Akhmatskaya“,”year“:”2008“,”journal-title”:“j.Compute。物理学。“},{”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0260“,”unstructured“:”E.Akhmatskaya,S.Reich,R.Nobes,《分子模拟的方法、仪器和计算机程序》,美国专利(授予)US0079081292011年。“}分子动力学积分器中常见的、可避免的错误来源”,“卷”:“126”,“作者”:“利珀特”,“年份”:“2007年”,“期刊标题”:“化学杂志”。物理学。“},{”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0360“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”doi“:”101063\/1.2408420“,”article-title“:”通过速度缩放的标准采样“,”volume“:“126”,“author”:“Bussi”,“year”:“2007”,“journal-title”:“j.Chem.Phys.”},“key”:“10.1016\/jcp.2016.035_br0290”,“serial-title es-title“:“SICE-ICASE国际联合会议”首页“:”2868“,”article-title“:”golden-section search-driven particle swarm optimization的开发及其应用“,”author“:”Oh“,”year“:”2006“},{“issue”:“16”,“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0300”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“first-page:”6015“,”doi“:”10.1021\/bi0477034“,”article-titel“:”KvAP钾通道抑制剂VSTx1的溶液结构和脂质膜分配”,“卷”:“44”,“作者”:“Jung”,“年份”:“2005年”,“期刊标题”:“生物化学杂志”。“},{”issue“:”14“,”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0310“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“4986”,”doi“:”101073\/pnas.85.14.4986“,”article-title“:”Villin sequence and peptide map identified sive homo同源域“,”volume“:},{“问题”:“4”,“密钥”:10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0320“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”180“,”doi“:”10.1038\/nsb0397-180“,”article-title“:”35-残基villin头片子域的核磁共振结构“,”volume“:“4”,”author“:”McKnight“,”year“:”1997“,”journal-title”:“Nat.Struct。Biol.“},{“issue”:“7”,“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0330”,“doi-asserted-by”:“crossref”,“首页”:“1923”,“doi”:“101021\/nl070602h”,“article-title”:“碳纳米管通过粗颗粒分子动力学与洗涤剂的相互作用”,“volume”:”7“author”:“Wallace”,“year”:“2007”,“journal-title“:”Nano-Lett.“}”,{:“8”,“键”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0340“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”3674“,”doi“:”10.1021\/jp0550816“,”article-title“:”粗粒蛋白质\u2013脂质模型与脂蛋白颗粒的应用“,”volume“:“110”,“author”:“Shih”,“year”:“2006”,“journal-title”:“j.Phys。化学。B”},{“issue”:“40”,“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0350”,“doi asserted by”:“crossref”,“首页”:“11178”,“doi”:“10.1021\/jp034108n”,“文章标题”:“绒毛蛋白头部的Brute力分子动力学模拟:与NMR参数的比较”,“volume”:“107”,“author”:“van der Spoel”,“year”:“2003”,“journal title”:“j.Phys.Chem.B”},{“issue”:“5A“,”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0370“,”doi-asserted-by“:”crossref“,“first page”:“1501”,”doi“:”10.3150\/12-BEJ414“,”article-title“:”Monte Carlo混合算法的优化调整“,”volume“:“19”,“author”:“Beskos”,“year”:“2013”,“journal-title”:“Bernoulli”},{“issue”:“18”,“key”:”10.116\/j.jcp.2016.09.035_br0380“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”5710“,”DOI“:”10.1021\/jp076712u“,”article-title“:”界面膜蛋白模拟的改进采样:“广义阴影杂交蒙特卡罗在肽毒素双层系统中的应用”,“volume”:“112”,“author”:“Wee”,“year”:“2008”,“journal-title”:“J.Phys。化学。B“},{“key”:“10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0390”,“author”:“Bou-Rabee”},“key“:”10.1016\/j.jcp.2016.009.035_br0400“,“series-title”:“Computer Simulation of Liquids”,“author”:“Allen”,“year”:“1989”}、{“issue”:“4”,“key”:”10.116\/jcp.2016.09.035_br 0410“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”首页“:”473“,”doi“:”10.1214\/ss\/117701137“,”文章标题“:”《实用马尔可夫链蒙特卡罗》,“卷”:“7”,“作者”:“盖尔”,“年份”:“1992年”,“新闻标题”:“统计科学”。“},{”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0420“,”系列标题“:”分子间作用力“,”第一页“:”331“,”文章标题“:”水与蛋白质水合作用的相互作用模型“,”卷“:”第14卷“,”作者“:”Berendsen“,”年份“:”1981“},{”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0430“,”doi断言“:”crossref“,”第一页“:”1990“,”doi“:”10.1063\/1.463137“,”article-title“:”可逆多时间尺度分子动力学“,”volume“:”97“,”author“:”Tuckerman“,”year“:”1992“,”journal-title”:“J.Chem。物理学。“},{”issue“:”1“,”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0440“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:“1”,”doi“:”101016\/j.jcp.2014.08.052“,”article-title“:”Multiple-stepping generalized hybrid Monte Carlo methods“,”volume“:“:”22\u201323“,”键“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0450“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”first page“:”3579“,”doi“:”10.1080\/00268976.2013.844369“,”article-title“:”具有非常大时间步长的分子动力学的随机、无共振多时间步长算法“,”volume“:“111”,“author”:“Leimkuhler”,“year”:“2013”,“journal-title”:“Mol.Phys。“},{”key“:”10.1016\/j.jcp.2016.09.035_br0460“,”unstructured“:”M.Fern\u00e1ndez-Pend\u00e 1s,E.Akhmatskaya,j.M.Sanz-Serna,分子动力学和混合蒙特卡罗自适应两级积分器的多时间步算法,准备中。“}],”container-title“:[”计算物理杂志“],”original-tittle“:[],”language“:”en“,”link“:[{”URL“:”https:\/\/api.elsevier.com/content\/article\/PII:S0021999116304569?httpAccept=text\/xml“,”content-type“:”text\/xml“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”text-mining“},{”URL:“https:\//api.elsevier.com/content\/aarticle\/PII:S002199116304559?httpAccess=text\/plain“,”内容类型“:”文本\/plaine“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”text-mining“}],”deposed“:{”date-parts“:[[2019,11,1]],”date-time“:”2019-11-01T09:16:50Z“,”timestamp“:1572599810000},”score“:1,”resource“:{primary”:{“URL”:“https:\/\/linkinghub.elsevier.com\/retrieve\/pii\/S0021999116304569”},“subtitle”:[],“shorttitle”:[],“issued”:{”date-ports“:[[2016,12]]},“参考人数”:46,“alternative-id“:[”S0021999116304569“],“URL”:“http://\/dx.doi.org\/10.1016\/j.jcp.2016.09.035”,“关系”:{},“ISSN”:[“0021-9991”],“ISSN-type”:[{“值”:“0021-999”,“类型”:“打印”}],“主题”:[],“发布”:{“日期段”:[2016,12]]},“name”:“publisher”,“label”:“本文由”},{“value”:“维护分子模拟中优化能量守恒的自适应多级积分器”,“name”:“articletitle”,“label”:“Article Title”},{“value”:“Journal of Computational Physics”,“name:”journaltitle“,”label“:”Journal Title“},”{“value”:“https:\\/doi.org\/101016\/j.jcp.2016.09.035”,“name”:“rticlelink”,“标签”:“CrossRef DOI链接到出版商维护的版本“},{“value”:“article”,“name”:“content_type”,“label”:“content-type”},}“values”:“\u00a9 2016 Elsevier Inc.保留所有权利。”,“名称”:“版权”,“标签”:“copyright”}]}