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thaliana)是植物分子生物学、遗传学、表观遗传学和基因组学中一个重要且长期存在的模式物种。然而,最新版本的参考基因组仍然包含大量缺失片段。在这里,我们通过结合牛津纳米孔技术公司的超长读取、太平洋生物科学公司的高保真长读取和Hi-C数据,报告了一个具有两个缺口的高质量且几乎完整的Col-0基因组组装(称为Col-XJTU)。总基因组组装大小为133725193\u00a0bp,与TAIR10.1参考基因组相比引入了14.6\u00a 0Mb的新序列。Col-XJTU组合的所有五条染色体均高度准确,一致质量(QV)得分\u00a0&gt;\u00a060(范围从62到68),高于TAIR10.1参考值(范围从45到52)。我们以端粒对端粒的方式完全解析了染色体(Chr)3和Chr5。除了包含长的重复DNA片段的核仁组织区域外,Chr4被完全分解。据报道,Chr1着丝粒(CEN1)的长度约为9\u00a0Mb,由于存在数万个CEN180卫星重复序列,组装起来尤其困难。利用尖端测序数据和新的计算方法,我们组装了一个\u00a03.8-Mb长的CEN1和一个3.5-Mb长CEN2。我们还研究了着丝粒的结构和表观遗传学。检测到四簇CEN180单体,着丝粒特异性组蛋白H3样蛋白(CENH3)对CEN180簇3表现出强烈的偏好性。此外,我们在CENH3富集区观察到低甲基化模式。我们相信,这种高质量的基因组组装,Col-XJTU,将为更好地了解全球着丝粒多态性模式以及植物的遗传和表观遗传特征提供有价值的参考<\/jats:p>“,”DOI“:”10.1016\/j.gpb.2021.08.003“,”type“:”journal-article“,”created“:{”date-parts“:[2021,9,3]],”date-time“:”2021-09-03T15:45:50Z“,”timestamp“:1630683950000},”page“:“4-13”,”update-policy“:nced-by-count“:92,”title“:[”高质量拟南芥Nanopore和HiFi Long 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