{“状态”:“确定”,“消息类型”:“工作”,“信息版本”:“1.0.0”,“邮件”:{“索引”:{“日期部分”:[[2023,6,16]],“日期时间”:“2023-06-16T16:18:19Z”,“时间戳”:1686932299664},“出版商位置”:“查姆”,“参考计数”:28,“出版者”:“斯普林格国际出版”,“isbn-type”:[{“值”:“9783030792893”,“类型”:”打印},{“值”:“9783030792909”,“type”:“electronic”}],“license”:[{“start”:{“date-parts”:[2021,1,1]],“date-time”:“2021-01-01T00:00:00Z”,“timestamp”:1609459200000},“content-version”:“tdm”,“delay-in-days”:0,“URL”:“https:\/\/www.springer.com\/tdm”},{“开始”:{“date-ports”:[2021,1,1],“日期-时间”:“2041-01-01T 00:00Z”,“timestamp”:1609459200000},“content-version”:“vor”,“延迟天数”:0,“URL”:“https://www.springer.com\/tdm”}],“内容域”:{“域”:[“link.springer.com”],“交叉标记限制”:false},“短容器标题”:[],“已发布的印刷品”:{“日期部分”:[[2021]},“DOI”:“10.1007\/978-3-030-79290-9_2”,“类型”:“书籍章节”,“创建”:{“日期部分”:[[2021,7,2]],“日期时间”:“2021-07-02T14:03:32Z”,“时间戳”:1625234612000},“页面”:“15-25”,“更新策略”:“http://\/dx.doi.org\/10.1007\/springer_crossmark_policy”,“源”:“Crossref”,”is-referenced-by-count“:2,”title“:[”MetaProb 2:使用Minimizers通过高效读取汇编改进无监督元基因组装箱“],”prefix“:”10.1007“,”author“:[{”given“:”F.“,“family”:“Andreace”,“sequence”:“first”,“affiliation”:[]},{“given”:“C.”,“family”:“Pizzi”,“segment”:“additional”,“filiation“:[]{”given“:”M.“,”family“:”Comin“,”sequence“:”additional“,”affiliation:[]}],“member”:“297”,“published-on-line”:{“date-parts”:[2021,7,3]}“reference”:[{“issue”:“01”,“key”:”2_ CR1“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:”334“,”doi“:“10.1109”,“TCBB.2018.2875479”,“volume”:“17”,“author”:“A Bayat”,“year”:“2020”,“unstructured”:“Bayat,A.,Deshpande,N.P.,Wilkins,M.R.,Parameswaran,S.:使用重叠-优化一致性方法的快速短读de-novo汇编。IEEE \/ACM Trans.Compute.Biol.Bioninform.17(01),334\u2013338(2020)。https:\\/doi.org/10.109 \/TCB.2018.2845479”,“journal-title”:“IEEE\/ACM Trans.Comput.Biol.Bioninform.”},{“issue”:“10”,“key”:“2_CR2”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:”P10008“,“doi”:“10.1088\/1742-5468\/2008\/10\/P10008”,“volume”:《2008》,“author”:“VD Blondel”,“year”:“2008”,“unstructured”:“Blondel,V.D.,Guillaume,J.L.,Lambiotte,R.,Lefebvre,E.:大型网络中社区的快速发展。J.Stat.Mech.Theory Experiment 2008(10),P10008(2008)。https:\\/doi.org\/10.1088\/1742-5468\/2008\/100\/P10008”,“journal-title”:“J.Stat.Mech.理论实验”},{“key”:“2_CR3”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:”88“,“doi”:“10.1093”,“bib\/bbaa121”,“volume”:“22”,“author”:“M Comin”,“year”:“2020”,“unstructured”:“Comin,M.,Di.Camillo,B.,Pizzi,C.,Vandin,F.:微生物群样本的比较:方法和计算挑战。Briefings Bioninform.22,88(2020)。https:\/\/doi.org\/10.10093”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:“e82”,“doi”:“10.1371 \/journal.pbio.0050082”,《volume》:“5”,“author”:“JA Eisen”,“year”:“2007”,“unstructured”:“Eisen,J.A.:环境猎枪测序在研究微生物隐藏世界方面的潜力和挑战。PLoS Biol.5,e82(2007)”,“journal-title”:“PLoS Biol.”},{“issue”:“4”,“key”:“2_CR5”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:“501”,”doi“:”10.18388\/abp.2012_2084“,”volume“:”59“,”author“:”A Felczykowska“,”year“:”2012“,”unstructured“:“Felczykowska,A.,Bloch,S.K.,Nejman-Fale\u0144czyk,B.,Bara\u0144 ska,S.:海洋环境中新生物活性化合物研究中的元基因组方法。生物化学学报59(4),501\u2013505(2012)”,“期刊标题”:“生物化学学报”},{“issue”:“10”,“key”:“2_CR6”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“首页”:“917”,“DOI”:“10.1186\/s12864-017-4273-6”,“volume”:“18”,“author”:“S Girotto”,“year”:“2017”,“unstructured”:“Girotta,S.,Comin,M.,Pizzi,C.:利用重叠阅读提高元基因组序列分类的召回率。BMC Genomics 18(10),917(2017)”,“journal-title”:“BMC Genomecs”},{“key”:《2_CR7》,“DOI-asserted-by”:“publisher”,“非结构化”:“Girotto,S.,Comin,M.,Pizzi,C.:Metagenomic读取带间隔种子的binning。摘自:大数据时代的理论计算机科学、算法、字符串和理论方法(纪念Raffaele Giancarlo教授60岁生日),第698卷,第88\u201399页(2017年)。https:\//doi.org\/10.1016\/j.tcs.2017.05.023”,“doi”:“10.1016\/j.tcs.2017.05.023”},{“issue”:“17”,“key”:“2_CR8”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first-page”:“i567”,“doi”:“10.1093\/btw466”,“volume”:”32“,“author”:“S Girotto”,“year”:“2016”,“unstructured”:“Girotto,S.,Pizzi,C.,Comin,M.:Metaprob:基于概率序列签名的准确元基因组读取binning。生物信息学32(17),i567\u2013i575(2016)。https:\//doi.org\/10.1093\/生物信息学\/btw466”,“journal-title”:“生物信息学”},{“key”:“2_CR9”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first-page”:“e1165”,“doi”:“10.7717\/peerj.1165”,“volume”:“3”,“author”:“DD Kang”,“year”:“2015”,“unstructured”:“Kang,D.D.,Froula,J.,Egan,R.,Wang,Z.:MetaBAT:一种从复杂微生物群落中准确重建单个基因组的有效工具。peerj 3,e1165(2015)。https:\/\/doi.org\/10.7717\/peer J.1165“,”journal-title“:”peerj“},{“issue”:“14”,“key”:“2_CR10”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:“2103”,“doi”:“10.1093\/生物信息学\/btw152”,”volume“:”32“,”author“:”H Li“,”year“:”2016“,”unstructured“:”Li,H.:Minimap and miniasm:噪声长序列的快速映射和从头组装。生物信息学32(14),2103\u20132110,“期刊标题”:“生物信息学”},{“问题”:“18”,“关键”:“2_CR11”,“出版商断言的doi”,“第一页”:“3094”,“doi”:“10.1093\/生物信息学\/bty191”,“卷”:“34”,“作者”:“H Li”,“年份”:“2018”,“非结构化”:“Li,H.:Minimap2:核苷酸序列的成对比对。生物信息学34(18),3094\u20133100(2018).https:\/\/doi.org\/10.1093\/生物信息学\/bty191“,”journal-title“:”生物信息学“},{“key”:“2_CR12”,“volume-title”:“元基因组分析工具的准确性和速度评估”,“author”:“S Lindgreen”,“year”:“2015”,“unstructured”:“Lindgreen,S.、Adair,K.、Gardner,P.:元基因组分析工具的准确性和速度评估。Cold Spring Harbor Laboratory Press,Woodburry(2015)“},{“issue”:“11”,“key”:“2_CR13”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first-page”:“3307”,“doi”:“10.1093\/生物信息学\/btaa180”,“volume”:《36》,“author”:“V Mallawaarachi”,“year”:“2020”,“unstructured”:“Mallawarachchi,V.,Wickramarachhi,A.,Lin,Y.:GraphBin:使用组装图对宏基因组连接体进行精细的装箱。生物信息学36(11),3307\u20133313(2020)“,“期刊标题”:“生物信息学”},{“问题”:“6”,“关键”:“2_CR14”,“doi-asserted-by”:“出版商”,“首页”:“669”,“doi”:“10.1093\/bib\/bbs054”,“卷”:“13”,“作者”:“SS Mande”,“年份”:“2012”,“非结构化”:“Mande,S.S.、Mohammed,M.H.、Ghosh,T.S.:宏基因组序列的分类:方法和挑战。生物信息简报。13(6),669\u2013681(2012)。https:\/\/doi.org\/10.1093\/bib\/bbs054“,”journal-title“:”简报Bioninform。“},{”key“:”2_CR15“,”doi-asserted-by“:”crossref“,”unstructured“:”Marchiori,D.,Comin,M.:SKraken:基于过滤无信息k-mers的短元基因组读取的快速敏感分类。摘自:BIOINFORMATICS 2017\u20138国际生物信息学模型、方法和算法会议论文集;第十届国际生物医学工程系统与技术联合会议部分,BIOSTEC 2017,第3卷,第59\u201367页(2017年)Ounit,R.,Wanamaker,S.,Close,T.J.,Lonardi,S.:CLARK:使用区分性k-mers快速准确地分类宏基因组和基因组序列。BMC Genomics 16(1),1\u201313(2015)“,“journal-title”:“BMC Genomecs”},{“issue”:“367”,“key”:“2_CR17”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first-pages”:“1”,“doi”:“10.1186\/s12859-019-2904-4”,“volume”:Qian,J.,Comin,M.:MetaCon:利用概率k-mers统计和覆盖率对元基因组重叠进行无监督聚类。BMC生物信息。20(367),2013年1月12日(2019)。https:\/\/doi.org\/10.1186\/s12859-019-2904-4“,”journal-title“:”BMC生物信息。“},{”key“:”2_CR18“,”series title“:”计算机与信息科学中的通信“,”doi断言“:”publisher“,”首页“:”212“,”doi“:”10.1007\/978-3-319-94806-5_12“,”volume title“:”生物医学工程系统与技术“,”作者“:”J Qian“,”年份“:”2018“,”非结构化“:”Qian,J.,Marchiori,D.,Comin,M.:用SKraken对短的宏基因组读取进行快速而敏感的分类。收件人:Peixoto,N.、Silveira,M.、Ali,H.H.、Maciel,C.、van den Broek,E.L.(编辑)《生物科技2017》。CCIS,第881卷,第212\u2013226页。查姆施普林格(2018)。https:\/\/doi.org\/10007\/978-3-319-94806-5_12“},{”key“:”2_CR19“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:“e3373”,”doi“:”10.1371\/journal.pone.0003373“,”volume“:Richter,D.,Ott,F.,Auch,A.,Schmid,R.,Huson,D.:MetaSim——基因组学和宏基因组学的测序模拟器。《公共科学图书馆·综合》3,e3373(2008)。https:\/\/doi.org\/10.1371 \/journal.pone.0003373“,”journal-title“:”PloS-One“},{“key”:“2_CR20”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:”1063“,“doi”:“10.1038 \/nmeth.4458”,“volume”::“14”,“author”:“A Sczyrba”,“year”:“2017”,“unstructured”:“Sczyrba,A.、Hofmann,P.、McHardy,A.C.:宏基因组解释的关键评估\u2013a宏基因组学软件的基准。Nat.Methods 14,1063\u20131071(2017)“,”journal-title“:”Nat.Met方法“},{”key“:”2_CR21“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:“811”,”doi“:”10.1038\/nmeth.2066“,”volume“:‘9’,”author“:”N Segata“,”year“:”2012“,”unstructured“:”Segata,N.、Waldron,L.、Ballarini,A.、Narasimhan,V.、Jousson,O.、Huttenhower,C.:使用独特的分支特异性标记基因的元基因组微生物群落分析。Nat.Methods 9,811(2012)“,“journal-title”:“Nat.Methads”},{“issue”:“1”,“key”:“2_CR22”,“doi-asserted-by”:“publisher”,“first page”:”321“,“doi”:“10.1146\/annurev.mi.39.100185.001541”,”volume“:”39“,”author“:”JT Staley“,”year“:”1985“,”unstructured“:”Staley,J.T.,Konopka,A.:水生和陆地生境中非光合作用微生物原位活性的测量。微生物年鉴。39(1),321\u2013346(1985)。https:\/\/doi.org\/10.1146\/annurev.mi.39.100185.001541。pMID:3904603“,”杂志标题“:”微生物年鉴。“},{”key“:”2_CR23“,”series-title“:”计算机科学课堂讲稿“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:“68”,”doi“:”10.1007\/978-3-030-57821-3_7“,”volume-title“:“生物信息学研究与应用”,”author“:”D Storato“,”year“:”2020“,”unstructured“:”Storato,D.,Comin,M.:使用测序数据中的区分性k-mers改进宏基因组分类。收录人:Cai,Z.,Mandoiu,I.,Narasimhan,G.,Skums,P.,Guo,X.(编辑)ISBRA 2020。LNCS,第12304卷,第68页\u201381。施普林格,查姆(2020)。https:\/\/doi.org\/10.1007\/978-3-030-57821-3_7“},{“问题”:“1”,“密钥”:“2_CR24”,“doi-asserted-by”:“出版商”,“首页”:“一”,“doi”:“10.1186\/s13015-014-0030-4”,“卷”:“10”,“作者”:“LV Vinh”,“年份”:“2015”,“非结构化”:“Winh,L.V.,Lang,T.V.,Binh,L.T.,Hoai,T.V.:在非重叠读取组上使用L-mer频率的两阶段装箱算法。算法分子生物学。10(1),2013年1月12日(2015年)。https:\/\/doi.org\/10.1186\/s13015-014-0030-4“,”journal-title“:”Algorithms Mol.Biol。“},{”key“:”2_CR25“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”unstructured“:”Wang,Y.,Leung,H.C.,Yiu,S.M.,Chin,F.Y.:MetaCluster 5.0:噪音样本中低丰度物种的元基因组数据的两轮装箱方法。Bioninform.28,i356(2012)。https:\/\/doi.org\/10.1093\/生物信息学\/bts397“,”doi“:”10.1093\/生物资讯学\/bts397“}”,{“key“:”2_CR26“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first-page“:”1“,”doi“:”10.1186\/gb-2014-15-3-r46“,”volume“:“15”,”author“:”D Wood“,”year“:”2014“,”unstructured“:”Wood,D.,Salzberg,S.:Kraken:使用精确比对进行超快速元基因组序列分类。基因组生物学。15,1\u201312(2014)“,“杂志标题”:“基因组生物学”。“},{”key“:”2_CR27“,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:“523”,”doi“:”10.1089 \/cmb.2010.0245“,”volume“::”18“,”author“:”YW Wu“,”year“:”2011“,”unstructured“:”Wu,Y.W.,Ye,Y.:一种新的基于丰度的算法,用于使用l-tuples将元基因组序列装箱。J.Compute.Biol.18,523(2011)。https:\\/doi.org \/101089 \/cmb.2010.0245“,”journal-title“:《计算杂志》。Biol.“},{”issue“:“1”,”key“:“2_CR28”,”doi-asserted-by“:”publisher“,”first page“:”144“,“doi”:“10.1186\/s13059-019-1755-7”,“volume”:“20”,“author”:“A Zielizinski”,“year”:“2019”,“unstructured”:“Zielizenski,A.,Girgis,H.,Bernard,G.,et al.:无比对序列比较方法的基准。Genome Biol.20(1),144(2019)”,“日志标题“:”基因组生物学。“}],”container-title“:[”生物和医学科学的计算进展“,”计算机科学的课堂讲稿“],”original-title”:[],”link“:[{”URL“:”https:\/\/link.springer.com/content\/pdf\/10.1007\/978-3030-79290-9_2“,”content-type“:”unspecified“,”content-version“:”vor“,”intended-application“:”similarity-checking“}]“,”deposed“:{”date-parts“:[[2021,7,2],”date-time“:”2021-07-02T14:03:47Z“,”timestamp“:1625234627000},”score“:1,”resource“:{”primary“:”URL“:”https:\/\/link.springer.com\/10.1007\/978-3-030-79290-9_2“},“subtitle”:[],“shorttitle”:[],“issued”:{“date-part”:[2021]]},《ISBN》:[“9783030792893”,“9783030792909”],“references-count”:28,“URL”:“http:\/\/dx.doi.org\/10.1007\/978-3-030-79290-9_2“,”关系“:{},”ISSN“:[”0302-9743“,”1611-3349“],”ISSN-type“:[{”value“:”0302-7743“”,“type”:“print”},{”value“:“1611-3399”,“类型”:“electronic”}],“subject”:[],“published”:{“date-parts”:[2021]},“assertion”:[{“value”:”3 2021年7月“,”订单“:1,”名称“:”first_online“,”标签“:”first online“,“group”:{“name”:“ChapterHistory“,”label“:”Chapter History”}},{“value”:“ICCABS”,“order”:1,“name”:“conference_acrombior”,“label”:“conference缩写”,“group”:{“name”:“ConferenceInfo”,“标签”:“会议信息”}}}group“:{”name“:”ConferenceInfo“,”label“:”会议信息“}},{”value“:”2020“,”order“:5,”name“:”Conference_year“,”tabel“:“会议年份”,“group”:{“name”:“ConferenceInformo”,“label”:“会议信息”},“value”:“2020年12月10日”,“order”:7,“name“,”label“:”Conference Information“}},{“value”:“2020年12月12日”,“order”:8,“name”:“Conference_end_date”,“label”:“ConferenceEnd date”,“group”:{“name”:“ConferenceInfo”,”label“:”Conferency Information“{},”value“:”10“,”order“:9,”name“:”Conference_number“,”label:“Conversation number”,”group“:{”name“ConfernceInfo”“,”标签“:”会议信息“}}}”,{value”:“iccabs2020”,“order”:10,“name”:“conference_id”,“label”:“ConferenceID”,“group”:{“name”:“ConferenceInfo”,“label”:“ConferenceInformation”}},{“value”:“https:\/\/iccabs.engr.uconn.edu\/”,“order”:11,“name”:“conferenceurl”,“label”:“ConferenceURL”,“group”:{“name”:“ConferenceInfo”,“label”:“ConferenceInformation”}]}