第52卷第D1期

2024年1月5日

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国际标准编号0305-1048

EISSN 1362-4962号

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第52卷，第D1期，2024年1月5日

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2024年核酸研究数据库问题与在线分子生物学数据库采集

丹尼尔·里格登和克塞姆·费尔南德斯

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1-D9页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1173

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主要多数据库资源

2023年欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）

马修·塔库尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D10-D17页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1088

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2024年中国国家生物信息中心国家基因组数据中心数据库资源

CNCB-NGDC成员和合作伙伴

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D18–D32页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1078

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国家生物技术信息中心的数据库资源

埃里克·塞耶斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D33–D43页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1044

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SIB瑞士生物信息学研究所数据语义网

SIB瑞士生物信息研究所RDF小组成员

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D44–D51页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad902

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核酸序列、结构与调控

circAtlas 3.0：基于标准命名方案的300万种脊椎动物圆形RNA的门户

吴婉英和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D52–D60页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad770

Cistrome数据浏览器：染色质数据的集成搜索、分析和可视化

Len Taing先生和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D61–D66页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1069

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2023年DDBJ更新：代谢组学数据和相关元数据的MetaboBank

武士阿拉和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D67–D71页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1046

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EndoQuad：一个全面的全基因组实验验证的内源性G-四联体数据库

盛胡倩和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D72–D80页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad966

eRNAbase：用于解码人类和小鼠中的调节性eRNA的综合数据库

赵松和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D81–D91页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad925

2023年欧洲核苷酸档案

大卫·袁和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D92–D97页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1067

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EVLncRNAs 3.0：一个更新的综合数据库，用于人工筛选功能性长非编码RNA，并通过低吞吐量实验验证

周百灵和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D98–D106页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1057

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Expression Atlas更新：从批量和单细胞水平测序数据中获得的见解

南希·乔治和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D107–D114页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1021

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FL-circAS：一种整合的资源和分析，用于全长序列和环状RNA的选择性剪接，并带有纳米孔测序

蒋太伟和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D115–D123页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad829

FLIBase：人类癌症和组织全长亚型的综合库

七里石和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D124–D133页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad745

GenBank 2024更新

埃里克·塞耶斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D134–D137页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad903网址

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NCBI GEO：基因表达和表观基因组数据集存档：23年更新

艾米莉·克劳夫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D138–D144页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad965

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HHCDB：人类异染色质区域数据库

王宏利和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D145–D153页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad954

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HOCOMOCO于2024年：重建人类和小鼠转录因子结合模型精选集

伊利亚·沃龙佐夫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D154–D163页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1077

IMG/PR：包含丰富注释和元数据的基因组和宏基因组质粒数据库

安东尼奥·佩德罗·卡马戈和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D164–D173页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad964

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JASPAR 2024：转录因子结合谱开放存取数据库20周年

伊瓦·劳卢塞维丘特和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D174–D182页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1059

KnockTF 2.0：一个综合的基因表达谱数据库，包含多种物种中转录（协同）因子的敲除/敲除

冯晨晨和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D183–D193页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1016

米⁶A-Atlas v2.0：最新资源N个⁶-甲基腺苷（m⁶A）多物种间的上转录组

梁占民和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D194–D202页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad691

m7GHub V2.0：用于解码N7-甲基鸟苷（m）的更新数据库⁷G）上转录体

王宣和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D203–D212页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad789

MAJIQlopedia：人类组织和癌症中RNA剪接变异的百科全书

马修·奎斯内尔·瓦利埃和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D213-D221页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1043

方法主题。Org 2024：整合上下文特异性转录因子结合基序和DNA甲基化模式的数据库

马修戴尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D222–D228页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad894

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MINRbase：核和线粒体核糖体RNA衍生片段（rRFs）的综合数据库

威尼斯Pliatsika和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D229–D238页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad833

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MODOMICS：RNA修饰和相关信息的数据库。2023年更新

安德烈亚·卡帕尼尼和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D239–D244页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1083

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核酸知识库：核酸三维结构信息的新门户

凯瑟琳·劳森和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D245–D254页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad957

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RegulonDB v12.0：转录调控的综合资源大肠杆菌K-12公司

赫拉迪亚·萨尔加多和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D255–D264页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1072

Ribocentre-switch：核糖开关数据库

范布和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D265–D272页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad891

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RMBase v3.0：解码RNA修饰的景观、机制和功能

嘉嘉轩和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D273–D284页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1070

scATAC-Ref:在多个物种中具有已知细胞标记的scATAC-seq的参考

冯翠倩和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D285–D292页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad924（网址：https://doi.org/10.1093/nar/gkad924）

scGRN：人鼠单细胞基因调控综合网络平台

黄雪梅和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D293–D303页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad885

TarBase-v9.0将实验支持的miRNA-基因相互作用扩展到细胞类型和病毒编码的miRNAs

乔戈斯·斯科福斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D304–D310页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1071

TeloBase：生命树中端粒序列的社区管理数据库

马丁·利奇卡和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D311-D321页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad672

TE-TSS：人和小鼠转座因子（TE）衍生转录起始位点（TSS）的集成数据源

顾晓兵和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D322-D333页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1048

TFCheckpoint数据库更新，人类、小鼠和大鼠转录因子的交叉参考系统

Marcio L Acencio公司和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D334-D344页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1030

tRFtarget 2.0：扩大转移RNA衍生片段的靶点范围

宁陕李和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D345–D350页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad815

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UTexas适配子数据库：适配子序列信息的收集和长期保存

阿里·阿斯卡里和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D351–D359页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad959

蛋白质序列和结构、基序和结构域

A3D模型生物数据库（A3D-MODB）：模型生物蛋白质组聚集预测数据库

Aleksandra E Badaczewska-Dawid先生和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D360–D367页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad942

2024年AlphaFold蛋白质结构数据库：提供超过2.14亿个蛋白质序列的结构覆盖率

米哈利·瓦拉迪和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D368–D375页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1011

ASD2023：走向变构知识库的整合景观

何继孝和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D376–D383页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad915

ATLAS：来自原子分子动力学模拟的蛋白质柔性描述

Yann Vander Meersche公司和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D384-D392页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1084

分子动力学数据库的一个新范例：COVID-19数据库，一个巨大的社区努力的遗产

丹尼尔·贝尔特兰和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D393–D403页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad991（网址：https://doi.org/10.1093/nar/gkad991）

BioLiP2：生物相关配体-蛋白质相互作用的更新结构数据库

张成欣和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D404-D412页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad630

ChannelsDB 2.0：AlphaFold时代蛋白质通道和孔的综合数据库

安娜·什帕奇科娃和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D413–D418页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1012

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dbAPIS：数据库一反兴奋剂-对原核生物的我公社秒系统基因

于晨燕和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D419-D425页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad932

描述2023年的PROT：更多、更高质量和实验性注释以及改进的数据下载选项

苏什米塔·巴苏和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D426–D433页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad985

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2024年的DisProt：改进固有无序蛋白质的功能注释

玛丽亚·克里斯蒂娜·阿斯普罗蒙特和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D434–D441页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad928

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ELM-真核线性母题资源-2024更新

曼吉特·库马尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D442–D455页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1058

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EMDB-电子显微镜数据库

wwPDB联盟

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D456–D465页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1019

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2024年GproteinDb：新型G蛋白-GPCR偶联、AlphaFold2多聚体模型和界面相互作用

加斯帕尔·潘迪·塞克雷斯（Gásparár Pándy-Szekeres）和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D466–D475页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1089

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iNClusive：一个数据库，收集非标准氨基酸的有用信息，并将其并入蛋白质中，以便于遗传代码扩展的实施

利昂·萨缪尔结冰和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D476–D482页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1090

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MESPEUS：蛋白质中金属配位基团的数据库

耿玉林和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D483–D493页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1009

MultifacetedProtDB：具有多种功能的人类蛋白质数据库

伊丽莎·贝尔托里尼和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D494–D501页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad783

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NMPFamsDB：微生物宏基因组和超转录组新蛋白家族数据库

Fotis A Baltoumas公司和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D502–D512页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad800

2024年的OMA正畸学：原核生物覆盖率提高、祖先和现存GO富集、更新的合成查看器以及OMA生态系统中的更多内容

阿德里安·阿尔登霍夫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D513–D521页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1020

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OpenProt 2.0为替代蛋白质的功能表征开辟了一条道路

塞巴斯蒂安·勒布朗和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D522-D528页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1050

OrthoMaM v12：用于研究哺乳动物进化基因组的精选单拷贝直系同源序列和树数据库

雷米·阿利奥和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D529–D535页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad834

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2024年的PED：改善内在无序蛋白质结构集合的群落沉积

哈米德雷扎·加福里和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D536–D544页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad947

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专利和文献抗体数据库（PLAbDab）：功能多样、文献注释抗体序列和结构的进化参考集

布伦南·阿巴纳德斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D545-D551页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1056

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SingPro：提供单细胞蛋白质组数据的知识库

西辰连和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D552–D561页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad830

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SPDB：单细胞分辨率蛋白质组数据的综合资源和知识库

王芳（Fang Wang）和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D562-D571页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1018

UniTmp：跨膜蛋白的统一资源

拉兹洛·多布森和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D572-D578页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad897

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代谢和信号途径、酶

ABC-HuMi：人类微生物组中生物合成基因簇图谱

帕斯卡·赫施和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D579–D585页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1086

antiSMASH数据库版本4：附加基因组和BGC、新的基于序列的搜索等

凯·布林和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D586–D589页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad984

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CasPEDIA数据库：2类CRISPR-Cas酶的功能分类系统

本杰明·阿德勒和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D590-D596页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad890

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CellCommuNet：正常和疾病状态下人类和小鼠组织的单细胞RNA测序的细胞-细胞通信网络图谱

马钦峰和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D597–D606页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad906

cfOmics：用于疾病的无细胞多Omics数据库

李明阳和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D607–D621页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad777网址

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jMorp:2023年日本Multi-Omics Reference Panel更新报告

舒·塔达卡和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D622–D632页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad978

MACC：代谢相关细胞通讯的可视化交互式知识库

高健和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D633–D639页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad914

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MetaboLights:代谢组学的开放数据存储库

奥兹古尔·尤雷克滕和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D640-D646页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1045

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MiST 4.0：微生物信号转导数据库的新版本，现在包含宏基因组成分

瓦迪姆·古默洛夫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D647–D653页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad847

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PathBank 2.0——模型生物代谢组学的途径数据库

大卫·S·威斯哈特和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D654–D662页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1041

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PathDIP 5：提高覆盖率并使富集分析更有生物学意义

希亚拉·帕斯特雷洛和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D663–D671页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1027

Reactome Pathway知识库2024

玛丽亚·米拉西奇和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D672-D678页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1025

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WikiPathways 2024：下一代路径数据库

阿尤希·阿格拉瓦尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D679–D689页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad960

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病毒、细菌、原生动物和真菌

动物MetaOmics：用于探索动物微生物基因组和微生物组的多组学数据资源

胡瑞瑞和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D690–D700页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad931

COV2Var，SARS-CoV-2基因变异的功能注释数据库

玉州峰和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D701–D713页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad958

gcPathogen：人类公共卫生病原体的综合基因组资源

郭崇业和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D714–D723页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad875

GDPF：全球生物圈原核蛋白家族分布的数据资源

卓潘和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D724–D731页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad869

ICEberg 3.0：细菌中整合和结合元素的功能分类和分析

孟旺（Meng Wang）和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D732–D737页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad935

MAMI：母婴微生物群和益生菌资源的综合数据库

田洲和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D738–D746页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad813网址

P10K数据库：原生生物10000基因组项目的数据门户

鑫鑫高和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D747–D755页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad992

噬菌体示波器：一个注释完善的噬菌体数据库，具有自动分析和可视化功能

王若翰和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，D756–D761页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad979

RefSeq和宏基因组时代的原核基因组注释管道

丹尼尔·H·哈夫特和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D762–D769页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad988

RVdb：鼻病毒研究的综合资源和分析平台

彭昭和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D770–D776页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad937网址

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SPIRE：一种可搜索的、行星级的微生物资源

托马斯·S·B·施密特和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D777–D783页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad943

TADB 3.0：细菌毒素-抗毒素基因座和相关流动基因元件的更新数据库

贾浩关和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D784–D790页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad962

真菌和其他真核生物分子鉴定和分类交流的UNITE数据库：重新考虑的序列、分类群和分类

凯西·阿巴伦科夫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D791–D797页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1039

VarEPS-Influ：流感病毒基因组发生和虚拟变异的风险评估系统

常舒和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D798–D807页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad912

VEuPathDB：2023年真核病原体、载体和宿主生物信息学资源中心

豪尔赫·阿尔瓦雷斯-贾勒塔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D808–D816页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1003

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ViralZone 2024提供高分辨率图像和高级病毒专用资源

爱德华·德卡斯特罗和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D817–D821页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad946

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人类基因组，模式生物，比较基因组学

AgeAnnoMO：动物衰老的多组学注释知识库

黄可欣和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D822–D834页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad884

AGIDB：跨物种基因型插补和变异解码的通用数据库

张凯丽和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D835–D849页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad913网址

国家发改委隐杆线虫自然多样性资源

蒂莫西·A·克朗比和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D850–D858页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad887

CellSTAR：单细胞转录组注释的综合资源

张颖（音）和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D859–D870页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad874

COLOCdb：复杂性状多模型共定位的综合资源

潘思玉和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D871–D881页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad939

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CROST：空间转录组学的综合知识库

王国良和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D882–D890页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad782

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合奏2024

彼得·哈里森和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D891–D899页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1049

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人类老龄化基因组资源：老龄化研究关键数据库的更新

若昂·佩德罗·德·马加尔昂斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D900–D908页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad927

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HALL：人类衰老和长寿研究的综合数据库

郝丽和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D909–D918页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad880

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LncSEA 2.0：长非编码RNA相关集合和富集分析的更新平台

张国瑞和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D919–D928页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1008

mHapBrowser：一个用于DNA甲基化单倍型可视化和分析的综合数据库

余阳红和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D929–D937页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad881

2024年的君主倡议：一个整合表型、基因和跨物种疾病的分析平台

蒂姆·E·普特曼和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D938–D949页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1082

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开放基因——与衰老和长寿相关的人类基因的新综合数据库

叶卡捷琳娜·拉菲科娃和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D950–D962页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad712

PGS Depot：一种基于汇总统计方法构建的多基因评分综合资源

陈曹和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D963–D971页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1029

PharmGWAS：基于GWAS的药物再利用知识库

洪恩康和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D972–D979页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad832

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猪生物库：了解猪各种复杂性状的遗传和生物学机制的宝贵资源

曾浩南和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D980–D989页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1080

RAVAR：罕见变异-特征关联的精心策划的存储库

陈曹和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D990-D997页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad876

SCAN：神经细胞时空云图

邓玉山和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D998–D1009页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad895

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scQTLbase：一个集成的人类单细胞eQTL数据库

丁若凡和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1010–D1017页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad781

scTEA-db：从人类单细胞转录体中鉴定的新型末端外显子亚型的综合数据库

米盖尔·巴金和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1018–D1023页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad878

SilkMeta：共享和开发泛基因组和多基因组家蚕数据的综合平台

陆坤鹏和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1024–D1032页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad956

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STAB2：更新的人类和小鼠大脑时空细胞图谱

禹城T杨和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1033–D1041页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad955

StemDriver：用于确定造血干细胞命运的基因功能知识库

罗阳阳和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1042–D1052页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1063

STOmicsDB：用于空间转录组学数据共享、分析和可视化的综合数据库

徐志成和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1053–D1061页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad933网址

SysteMHC Atlas v2.0，基于质谱的免疫消化学的更新资源

黄晓翔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1062–D1071页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1068

TargetGene：基因变异的细胞型特异性靶基因的综合数据库

林士奇和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1072–D1081页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad901

UCSC基因组浏览器数据库：2024更新

布莱恩·雷尼和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1082–D1088页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad987

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ZEBRA：鼠脑和人脑在单细胞分辨率下的分层整合基因表达图谱

马提亚斯·弗洛托和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1089–D1096页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad990

基因变异、疾病和药物

ADCdb：抗体-药物偶联物数据库

李登深和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1097–D1109页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad831

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BATMAN-TCM 2.0：中药成分与靶蛋白之间已知和预测相互作用的增强型综合数据库

香港祥仁和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1110–D1120页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad926

BioKA：动物生物标志物管理和集成知识库

王一波和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1121–D1130页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad873

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BloodChIP-Xtra：健康人类干细胞/祖细胞亚群和白血病细胞全基因组转录因子结合和基因表达谱的扩展数据库

朱莉A I汤姆斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1131–D1137页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad918

BloodSpot 3.0：正常和恶性造血的基因和蛋白表达数据数据库

马格努斯·希斯拉森和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1138–D1142页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad993

CADD v1.7：使用蛋白质语言模型、调节性CNN和其他核苷酸水平评分改善全基因组变异预测

马克斯·舒巴赫和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1143–D1154页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad989

癌症蛋白质组：功能性解读癌症蛋白质组景观的资源

吕德忠和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1155–D1162页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad824

CDS-DB，癌症治疗诱导的患者衍生基因表达特征的总称

刘忠阳和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1163–D1179页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad888

2023年的ChEMBL数据库：跨越多种生物活性数据类型和时间段的药物发现平台

芭芭拉·兹德拉齐尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1180–D1192页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1004

circRNADise v2.0：高质量实验支持的circRNA-disease关联的更新资源

孙志燕和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1193–D1200页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad949

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ClinicalOmicsDB:探索临床试验中肿瘤药物反应的分子关联

月亮里的变化和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1201–D1209页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad871（网址：https://doi.org/10.1093/nar/gkad871）

COSMIC：癌症体细胞变异和临床数据的精选数据库

兹比斯拉夫·索恩卡和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1210–D1217页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad986

DNA损伤图谱：DNA损伤与修复图谱

于亮和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1218–D1226页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad845

DGIdb 5.0：为精准医学和药物发现平台重建药物-基因交互数据库

马修·坎农和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1227–D1235页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1040

DiSignAtlas：基于体细胞和单细胞转录组学的人类和小鼠疾病特征图谱

翟兆玉和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1236–D1245页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad961

DriverDBv4：用于癌症驱动基因研究的多组学集成数据库

刘嘉欣和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1246–D1252页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1060

DRMref：人类癌症耐药机制综合参考图

刘晓娜和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1253–D1264页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1087

DrugBank 6.0：2024年Drug银行知识库

克雷格·诺克斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1265–D1275页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad976

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融合新抗原：融合基因特异性新抗原的来源

希曼苏·库马尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1276–D1288页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad922

FusionPDB：人类融合蛋白的知识库

希曼苏·库马尔和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1289–D1304页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad920

DO-KB知识库：开发疾病开放科学生态系统的20年历程

J艾伦·拜伦和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1305–D1314页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1051

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HervD Atlas：人类内源性逆转录病毒与疾病关联的精选知识库

李翠丹和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1315–D1326页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad904

HMDD v4.0：实验支持的人类microRNA-disease关联数据库

崔春梅和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1327–D1332页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad717

2024年人类表型本体论：世界各地的表型

迈克尔·加加诺和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1333–D1346页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1005

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IMP：弥合药用植物基因组学的差距

童晨和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1347–D1354页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad898

INTEDE 2.0：药物代谢路线图

杨章和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1355–D1364页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad1013

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LncRNADisease v3.0：长时间非编码RNA相关疾病的更新数据库

小林和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1365–D1369页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad828

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M2OR：用于理解嗅觉分子机制的嗅觉受体-气味对数据库

马克森·拉利斯和其他

核酸研究，第52卷，第D1期，2024年1月5日，第D1370–D1379页，https://doi.org/10.1093/nar/gkad886

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