出版：2024年9月20日
图1。重组的分布在精细尺度上是异质的，并且集中在重组热点内。a） 重组率（ρ/kb）是基因组到CO热点中心（kb）距离的函数，采用三种不同的过滤策略。软筛选删除了较大的热点
出版：2024年9月20日
图5。重组梯度对多态性水平的变化具有鲁棒性，并与Rowan等人（2019年）估计的CO比率相关。a） SNP密度（SNP/kb）沿基因的梯度作为CDS等级的函数。估计每个CDS部分的SNP密度，并计算平均SNP密度
出版：2024年9月20日
图2。基因周围和内部平均重组率（ρ/kb）的变化。a） 基因和基因间区域的重组率不同。为了消除基因附近5′和3′调控区的影响，通过排除3kb侧翼来定义缓冲基因间区域
出版：2024年9月20日
图3。基因重组梯度主要围绕TSS和TTS。a、 b）在200 bp的窗口中估计中位重组率（ρ/kb），作为到ATG起始密码子（ATG密码子，第一个CDS的起始）或TTS的距离的函数，并在内含子和外显子之间取平均值。垂直虚线
出版：2024年9月20日
图4。基因重组梯度（中位数ρ/kb）作为外显子/内含子等级的函数。a） 作为外显子等级函数的独立梯度（CDS部分）与按外显子数量合并的基因的比较。黑线是平均梯度（所有基因集合）。b） recombi平均坡度
出版：2024年9月20日
图6。植物物种间重组梯度的多样性。在外显子（CDS部分）中估计重组率（中值ρ/kb），作为其等级的函数，并根据外显子的数量对基因进行分组。黑线是平均梯度（所有基因集合）。三个参考物种
出版：2024年9月20日
图7。模型对重组梯度的拟合。a） 重组梯度的概念模型改编自Choi和Henderson（2015）。在TSS和TTS周围，重组率呈指数衰减。这种衰减可能是由于TSS和/或TTS中的热点，或编码序列中的重组丢失所致
出版：2024年9月12日
图4。古代铁器时代/罗马基因组之间的关系。用KIN估计关联度、关系类型和标准化常染色体错配概率（Popli等人，2023年）。图上显示的每个点代表一对古代基因组，评估它们的平均成对差异
出版：2024年9月12日
图5。Duxford、Vicar农场和Knobb农场的δ18 O CO3值的雨云图，显示了数据的概率分布、中位数、四分位范围（IQR）、离群值和散布，以及单个骨架数。有关ID对照，请参阅补充数据S1a，在线补充材料。
出版：2024年9月12日
图2。英格兰罗马时期遗址与欧洲古代和现代人口的遗传亲缘关系。A-B：艾伦古代DNA资源v54中个体与古代基因组群的亲缘关系（Mathieson等人2018；Antonio等人2019；Fernandes等人2020；Marcus等人2020；Patterson
