出版：2024年9月20日
图2。基因周围和内部平均重组率（ρ/kb）的变化。a） 基因和基因间区域的重组率不同。为了消除基因附近5′和3′调控区的影响，通过排除3kb侧翼来定义缓冲基因间区域
出版：2024年9月20日
图3。基因重组梯度主要围绕TSS和TTS。a、 b）在200 bp的窗口中估计中位重组率（ρ/kb），作为到ATG起始密码子（ATG密码子，第一个CDS的起始）或TTS的距离的函数，并在内含子和外显子之间取平均值。垂直虚线
出版：2024年9月20日
图4。作为外显子/内含子等级的函数的沿着基因的重组梯度（中位数ρ/kb）。a） 将独立梯度作为外显子秩的函数（CDS部分）与由外显子数量汇集的基因进行比较。黑线是平均梯度（所有基因集合）。b） 平均复原坡度
出版：2024年9月20日
图6。植物物种间重组梯度的多样性。在外显子（CDS部分）中估计重组率（中值ρ/kb），作为其等级的函数，并根据外显子的数量对基因进行分组。黑线是平均梯度（所有基因集合）。三个参考物种已经
出版：2024年9月20日
图1。重组的分布在精细尺度上是异质的，并且集中在重组热点内。a） 重组率（ρ/kb）是基因组到CO热点中心（kb）距离的函数，采用三种不同的过滤策略。软筛选删除了较大的热点
出版：2024年9月20日
图5。重组梯度对多态性水平的变化具有鲁棒性，并与Rowan等人（2019年）估计的CO比率相关。a） SNP密度（SNP/kb）沿基因的梯度作为CDS等级的函数。估计每个CDS部分的SNP密度，并计算平均SNP密度
出版：2024年9月20日
图7。模型对重组梯度的拟合。a） 重组梯度的概念模型改编自Choi和Henderson（2015）。重组率在TSS和TTS周围呈指数衰减。这种衰减可能是由于TSS和/或TTS中的热点，或编码序列中的重组丢失所致
出版：2024年9月12日
图2。英格兰罗马时期遗址与欧洲古代和现代人口的遗传亲缘关系。A-B：艾伦古代DNA资源v54中个体与古代基因组群的亲缘关系（Mathieson等人2018；Antonio等人2019；Fernandes等人2020；Marcus等人2020；Patterson
出版：2024年9月12日
图3。群体间LSAI共享的可能性。连续群体中的个体与各列群体中的个人共享至少一个LSAI片段>4 cM的概率热图。英国生物银行（Biobank）目前的人口数据显示，古老的估算基因组包括晚期铁银
出版：2024年9月12日
图4。古代铁器时代/罗马基因组之间的关系。用KIN估计关联度、关系类型和标准化常染色体错配概率（Popli等人，2023年）。图上显示的每个点代表一对古代基因组，评估它们的平均成对差异
