格拉科布 swMATH ID: 29971 软件作者： Alzahrani，M。；Kuwahara，H。；Wang，W。；高，X。 描述： Gracob：一种新的基于图形的恒列双聚类方法，用于挖掘生长表型数据。动机：应激条件下全基因组基因缺失菌株的生长表型分析可以清楚地说明基因的重要性取决于环境条件。从这些高通量数据中系统地识别在各种环境条件下具有相似条件重要性和可有可无模式的基因组，可以阐明生长表型的遗传相互作用是如何根据环境进行调节的。结果：我们首先证明，在双聚类（即恒柱双聚类）中，检测这样的“共存”基因组可能是一个研究较少的问题。尽管双聚类技术取得了显著进步，但很少设计用于挖掘生长表型数据。在这里，我们提出了Gracob，这是一种新的、高效的基于图的方法，它将恒列双聚类问题转换为多部分图中的最大团查找问题并加以解决。我们将Gracob与大量广泛使用的双聚类方法进行了比较，这些方法涵盖了用于检测不同类型双聚类的不同类型算法。与所有现有方法相比，Gracob在寻找合用基因方面表现出了优异的性能，包括在各种设置的合成数据集上，以及在大肠杆菌、蛋白杆菌和酵母的三个真实生长表型数据集上。可用性和实施：我们的程序可在以下网站免费下载：http://sfb.kaust.edu.sa/Pages/Software.aspx。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5870648/ 相关软件： FABIA公司;BicPAMS公司;BicNET公司;BiC2PAM公司;BicSPAM公司;Bsig公司;比克帕姆;BicAT公司 引用于： 1文件 2位作者引用 1 鲁伊·恩里克 1 萨拉·马德拉。 连载1篇 1 数据挖掘与知识发现 在1个字段中引用 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文