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i增强-EL

swMATH ID: 27668
软件作者: 刘,B。;李凯。;黄,D.-S。;周,K.-C。
描述: iEnhancer-EL:使用集成学习方法确定增强剂及其强度。动机:鉴定增强子及其强度很重要,因为它们在控制基因表达中起着关键作用。虽然开发了一些生物信息学工具,但它们仅限于区分增强子和非增强子。最近,开发了一种称为“iEnhancer-2L”的双层预测仪,也可用于预测增强剂的强度。然而,其预测质量需要进一步提高,以提高实际应用价值。结果:提出了一种新的预测器“iEnhancer-EL”,该预测器包含两层预测器:第一层(用于识别增强子)由六个关键个体分类器的数组融合而成,第二层(用于强度)由十个关键个体分类器的数组融合形成。所有这些关键分类器分别从基于kmer、子序列轮廓和PseKNC(伪K元组核苷酸合成)的SVM(支持向量机)形成的171个基本分类器中选择。严格的交叉验证表明,在该领域,所提出的预测值明显优于现有的最先进的预测值。可用性和实现:iEnhancer-EL的web服务器已在http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iEnhancer-EL/用户无需仔细阅读数学细节即可轻松获得所需结果。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29878118
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引用于: 11文件

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