iRNA-PseU基因 swMATH ID: 27659 软件作者: Chen,W。;Tang,H。;Ye,J。;Lin,H。;周,K.-C。 描述: iRNA-PseU:识别RNA假尿苷位点。作为最丰富的RNA修饰,假尿苷在许多生物过程中发挥着重要作用。这种修饰发生在尿苷位点,由假尿苷合成酶催化,几乎在所有种类的RNA中都观察到,包括转移RNA、信使RNA、小核仁或核仁RNA以及核糖体RNA。因此,它对基础研究和药物开发的重要性不言而喻。尽管已经开发了一些检测假尿苷位点的实验技术,但它们既耗时又昂贵。面对后基因组时代RNA序列的爆炸性增长,我们面临着通过计算方法解决这个问题的挑战:对于一个未经特征化的RNA序列,我们能否预测其尿苷位点中哪些可以被修饰为假尿苷,哪些不能?这里,通过将核苷酸的化学性质及其出现频率密度分布纳入伪核苷酸组成(PseKNC)的一般形式,提出了一种称为“iRNA-PseU”的预测因子。通过严格的折刀测试、独立数据集测试和实际的全基因组分析证明,所提出的预测因子显著优于其对应物。为了方便大多数实验科学家,iRNA-PseU的网络服务器建立在http://lin.uestc.edu.cn/server/iRNA-PseU用户无需仔细阅读数学细节即可轻松获得所需结果。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5330936/ 相关软件: iRNA心理健康;iRNAm5C-PseDNC;pLoc-mEuk公司;iDNA6mA-PseKNC公司;iRSpot-EL接口;pSuc-Lys公司;iPTM-mLys公司;2L小核糖核酸;pLoc-动物;iPromoter-2L型;国际RNA-AI;pLoc-工厂;pLoc-mGneg公司;iEnhancer-2L型;iRNA-3类型A;pLoc-mHum(位置-湿度);综合布线;普南-PC;iSuc-选择权;pLoc-m病毒 引用于: 20文件 全部的 前5名69位作者引用 5 周国成 2 马苏德·海亚特 2 瓦卡尔侯赛因 2 季金超 2 谢尔·阿夫扎尔汗 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 努曼·拉苏尔 2 肖宣 1 贾马尔·艾哈迈德 1 沙希德·阿克巴 1 陈晓文 1 陈一平菲比 1 陈永兵 1 程翔 1 Chiu、Jimmy Ka Ho 1 Chong,Kil To村 1 崔晓文 1 狄龙,Tharam Singh 1 杜俊伟 1 傅毅 1 高彦欣 1 韩,叶 1 他,费 1 他,林 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 梅伦·贾米勒 1 贾建华 1 朱哲 1 穆赫塔吉·汗 1 可汗,穆斯林 1 拉文德拉·库马尔 1 李珊 1 李晓燕 1 林,英 1 刘波 1 卢福华 1 吕英丽 1 拉贾尼·坎塔·马哈帕特拉 1 马库布尔,H.F。 1 梅,胡安 1 穆亚双 1 宁,乔 1 彭彦军 1 邱、王仁 1 邱文英 1 Route、Subhashree 1 萨布,M.法兹利 1 Ehsan Saghapour 1 穆罕默德·塞哈蒂 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 孙平平 1 希拉·塔亚拉 1 王丽东 1 王明辉 1 王世元 1 王世云 1 杨磊 1 尹明浩 1 于斌 1 于兆敏 1 张宏瑞 1 张瑞军 1 张,叶 1 赵,季 1 赵晓伟 1 钟洪斌 1 周,孟 1 朱茂树 1 左永春 2篇连载文章中引用 19 理论生物学杂志 1 数学生物科学与工程 在5个字段中引用 20 生物学和其他自然科学(92-XX) 11 计算机科学(68至XX) 6 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文