iProt-Sub（iProt-Sub） swMATH ID: 27604 软件作者： Song J、Wang Y、Li F、Akutsu T、Rowlings ND、Webb GI、Chou KC 描述： iProt-Sub：用于准确绘制和预测蛋白酶特异性底物和裂解位点的综合软件包。蛋白水解的调节在许多重要的细胞过程中起着至关重要的作用。更好地理解控制这一过程的机制的关键是识别每个蛋白酶所针对的特定底物。为了解决这个问题，我们开发了iProt-Sub，这是一个强大的生物信息学工具，用于准确预测蛋白酶特异性底物及其裂解位点。重要的是，iProt-Sub代表了其成功前身PROSPER的一个显著高级版本。它为更多种特异性蛋白酶（4个主要蛋白酶家族和38种不同蛋白酶）提供了优化的切割位点预测模型，具有更好的预测性能和覆盖率。iProt-Sub集成了异质序列和结构特征，并使用两步特征选择程序进一步删除冗余和无关特征，以提高解理位点预测的准确性。iProt-Sub使用的特征由11种不同的序列编码方案编码，包括局部氨基酸序列剖面、二级结构、溶剂可及性和天然无序性，这将使大约38种蛋白酶的蛋白酶特异性得到更准确的表示，并训练预测模型。使用交叉验证和独立测试的基准测试表明，iProt-Sub能够实现比几种现有通用工具更好的性能。我们预计iProt-Sub将成为蛋白质组范围内预测蛋白酶特异性底物及其切割位点的有力工具，并将促进假设驱动的蛋白酶特异性基质切割和蛋白水解事件的功能查询。 主页： https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bby028/4979587 相关软件： iPromoter-2L型;iRNA心理健康;综合布线;pLoc-动物;2L小核糖核酸;iRSpot-EL接口;iRSpot-PseDNC公司;pLoc-mEuk公司;iPTM-mLys公司;iDNA6mA-PseKNC公司;iRNAm5C-PseDNC;pSuc-Lys公司;pLoc-mGneg公司;pLoc-m病毒;pLoc-工厂;iPro54-PseKNC;iEnhancer-2L型;iKcr-PseEns公司;国际RNA-AI;iRNA-PseU基因 引用于： 14文件 全部的 前5名40位作者引用 4 周国成 2 瓦卡尔侯赛因 2 谢尔·阿夫扎尔汗 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 努曼·拉苏尔 2 肖宣 1 贾马尔·艾哈迈德 1 曹，伙计 1 陈国栋 1 程翔 1 Chong，Kil To村 1 埃内斯托·孔特拉斯·托雷斯 1 傅毅 1 郭新云 1 马苏德·海亚特 1 梅伦·贾米勒 1 贾建华 1 拉文德拉·库马尔 1 李晓燕 1 梁云云 1 陆千子 1 马尼梅加莱，D。 1 梅，胡安 1 穆亚双 1 潘，易 1 邱、王仁 1 E.Siva桑卡里 1 史少平 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 希拉·塔亚拉 1 王丽东 1 王世元 1 杨磊 1 于佳林 1 张琪 1 张瑞军 1 张胜利 1 赵，季 1 左永春 连载1篇 14 理论生物学杂志 在3个字段中引用 14 生物学和其他自然科学（92-XX） 9 计算机科学（68至XX） 6 统计学（62-XX） 按年份列出的引文