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pLoc-mEuk公司

swMATH ID: 24440
软件作者: Cheng,X。;X.肖。
描述: pLoc-mEuk:通过将关键GO信息提取到通用PseAAC中,预测多标签真核蛋白的亚细胞定位。人们在预测真核蛋白质的亚细胞定位方面做了很多努力,但现有的大多数方法都有以下两个局限性:(1)它们的覆盖范围小于10个位置,因此真核细胞中的许多细胞器无法覆盖;(2)它们只能用于处理单个标记系统,其中每个组成蛋白质都有且只有一个位置。事实上,具有多个位置的蛋白质特别有趣,因为它们可能具有一些特殊的功能,对于深入了解细胞内的生物过程以及选择药物靶点非常重要。虽然一些预测因子(如“Euk-mPLoc”、“Euk-PLoc 2.0”和“iLoc-Euk”)可以覆盖多达22个不同的位置位点,并且它们还具有处理多标记蛋白质的功能,但仍需进一步提高其预测质量,特别是在提高绝对正确率和降低绝对错误率方面。在这里,我们通过将关键GO(基因本体)信息提取到一般PseAAC(伪氨基酸组成)中,提出了一种新的预测因子“pLoc-mEuk”。在高质量和严格的基准数据集上进行的严格交叉验证表明,所提出的pLoc-mEuk预测因子显著优于iLoc-Euk,iLoc-Euk是上述三个预测因子中最好的。为了最大限度地方便大多数实验科学家,在http://www.jci-bioinfo.cn/pLoc-mEuk/用户无需经过复杂的数学运算即可轻松获得所需的结果。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/提交/28818512
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