iHyd-PseCp公司 swMATH ID: 23952 软件作者: 邱,W.R。;Sun,B.Q。;X.肖。 描述: iHyd-PseCp:通过将序列偶联效应纳入一般PseAAC,识别蛋白质中的羟脯氨酸和羟赖氨酸。蛋白质羟基化是一种翻译后修饰(PTM),其中Pro(P)或Lys(K)残基中的CH基团被转化为COH基团,或羟基(-OH)被转化为有机化合物。这种PTM与细胞信号活动密切相关,也与一些主要疾病有关,如胃癌和肺癌。因此,从基础研究和药物开发的角度来看,我们面临着一个具有挑战性的问题:对于一个含有许多P或K残基的无特征蛋白质序列,哪些可以羟基化,哪些不能?随着蛋白质序列在后基因组时代的爆炸性增长,这个问题变得更加紧迫。为了解决这一问题,我们开发了一个名为iHyd-PseCp的预测器,将序列耦合信息合并到通用伪氨基酸组成(PseAAC)中,并引入“随机森林”算法进行计算。严格的折刀试验表明,在相同的目的下,新的预测值显著优于现有的最先进的预测方法。为了方便大多数实验科学家,已在http://www.jci-bioinfo.cn/iHyd-PseCp,用户可以很容易地获得他们想要的结果,而不需要经过复杂的数学方程。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27322424 相关软件: iCar-PseCp公司;iPTM-mLys公司;pSuc-Lys公司;iPhos-PseEn公司;pSumo光盘;iRSpot-PseDNC公司;iSuc-选择权;国际RNA-AI;普南-PC;iRNA-PseU基因;iRSpot-EL接口;国际有色人种协进会;iPPI-Esml接口;pLoc-mEuk公司;pLoc-动物;iRNA心理健康;2L小核糖核酸;iKcr-PseEns公司;pLoc-mGneg公司;iPromoter-2L型 引用于: 15文件 全部的 前5名49位作者引用 三 周国成 2 马苏德·海亚特 2 肖宣 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 安纪勇 1 穆罕默德·阿里夫 1 卞永涛 1 曹天杰 1 陈晓文 1 程翔 1 Chong,Kil To村 1 蒂塔拉吉·达什 1 de Galan,巴斯蒂安E。 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅毅 1 西蒙·戈德。 1 瓦卡尔侯赛因 1 Jan,扎胡尔 1 季金超 1 贾建华 1 谢尔·阿夫扎尔汗 1 亚瑟·达尼亚尔·汗 1 Melvin Khee-Shing Leow先生 1 李晓燕 1 吕英丽 1 梅,胡安 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆亚双 1 宁,乔 1 Pai,Priyadarshini P。 1 邱、王仁 1 努曼·拉苏尔 1 Ehsan Saghapour 1 穆罕默德·塞哈蒂 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 希拉·塔亚拉 1 王丽东 1 王世元 1 杨磊 1 尹明浩 1 翟景轩 1 张宏瑞 1 张瑞军 1 张,叶 1 赵,季 1 赵晓伟 1 周,孟 1 左永春 连载1篇 15 理论生物学杂志 在5个字段中引用 15 生物学和其他自然科学(92-XX) 7 统计学(62-XX) 6 计算机科学(68至XX) 1 组合数学(05-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文