迪亚斯·马林（Díaz-Marín），霍梅罗·G。;奥斯瓦尔多·奥苏纳;盖瑟，维拉维森西奥·普利多 全局稳定蛋白质转录动力学的振荡模型。 （英语） Zbl 07779463号 生物学杂志。系统。 31,3号，833-847（2023）. 小结：振荡出现在生物组织的各个层次。振荡现象并不总是具有简单的周期性。在这项工作中，我们分析了一个基因转录网络，其中我们假设一个几乎周期性的输入来调节基因。我们使用概周期输入（k（t）），因为周期输入具有很大的限制性。我们证明了所提出的概周期模型具有唯一的概周期吸引子。数值模拟表明，在与下游系统互连的上游系统中使用概周期输入时，追溯性受到很大影响。通过比较模型的解，我们可以得出结论：当结合到启动子上的蛋白质量由周期函数或概周期函数建模时，蛋白质浓度（X）的量可能被低估或高估，这取决于if（k（t）\)由周期或概周期函数建模。这些估计误差可能导致追溯性量化错误，进而改变上游系统和下游系统之间的协调。 MSC公司： 92C40型 生物化学、分子生物学 92B25型 生物节律和同步 34C27型 常微分方程的概周期解和伪最周期解 关键词：概周期函数;合作系统 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{H.G.Díaz-Marín}等人，J.Biol。系统。31，编号3833--847（2023；Zbl 07779463） 全文： 内政部 参考文献： [1] 爱泼斯坦，IR，波杰曼，JA，《非线性化学动力学导论：振荡、波、模式和混沌》，牛津大学出版社，1998年。 [2] Lotka，AJ，从质量作用定律导出的无阻尼振荡，美国化学学会杂志42:15951920。 [3] Hodgkin，AL，Huxley，AF，《膜电流的定量描述及其在神经传导和兴奋中的应用》，《生理学杂志》（伦敦）117:500-5441952年。 [4] Prigogine，I，Belascu，R，《不可逆过程热力学中的周期现象》，布尔Cl科学院R贝尔格42:256-2651956年·Zbl 0073.43403号 [5] Lefever，R，Nicolis，G，Prigogine，I，《关于远离平衡的化学反应系统中稳态附近振荡的发生》，化学物理杂志47:1045-10471967。 [6] Tyson，JJ，《化学系统非线性振荡的进一步研究》，化学物理杂志58:3919-39301973年。 [7] Goldbeter，A，《生物化学振荡和细胞节律》，剑桥大学出版社，1996年·Zbl 0837.92009号 [8] Atkinson，M，Savageau，M，Myers，J，Ninfa，A，《大肠杆菌中显示拨动开关或振荡行为的基因电路的开发》，Cell113:597-6072003年。 [9] Chen，S，Duan，J，Li，J，Tyson-Hong-Thron-Novak昼夜节律振荡器模型的动力学，物理学D420:1328692021·Zbl 1494.34122号 [10] Hartwell，L，Hopfield，J，Leiblerand，S，Murray，A，《从分子到模块化细胞生物学》，自然402:47-521999。 [11] Lauffenburger，DA，作为控制模块的细胞信号通路：简单的复杂性？美国国家科学院院刊97:5031-50332000。 [12] Kirschner，MW，Gerhart，JC，《生命的合理性：解决达尔文的困境》，纽黑文和伦敦：耶鲁大学出版社，2005年。 [13] Jacob，F，《进化与修补》，《科学》196:116161977年。 [14] 阿隆，U，《生物网络：作为工程师的修补匠》，科学301:1866-18672003。 [15] Polderman，JW，Willems，JC，《数学系统理论导论》。行为方法，第2版。，Springer-Verlag，纽约，2007年·Zbl 0940.93002号 [16] Willems，J，《行为、潜在变量和互连》，系统控制信息43:453-4641999年。 [17] Lin，G，Jiao，F，Sun，Q，Tang，M，Yu，J，Zhou，Z，将激活信号的动力学复杂性与转录反应联系起来，R Soc开放科学6:1902862019。 [18] Chen，L，Lin，G，Jiao，F，使用平均转录水平了解随机基因激活的调控，R Soc开放科学：2117572022。 [19] 乔，L，张，ZB，赵，W，魏，P，张，L，生物噪声鲁棒振荡行为的网络设计原则，eLife11:e761882022。 [20] Jiao，F，Zhu，C，竞争性交叉谈话途径对基因激活的调节，生物物理J119:1204-12142020。 [21] Del Vecchio，D，Ninfa，A，Sontag，E，《模块化细胞生物学：追溯性和绝缘性》，分子系统生物学4（161）：1-62008。 [22] Feinberg，M，一类化学反应网络稳态的存在性和唯一性，Arch Ration Mech Anal132:371-4061995·Zbl 0853.92025号 [23] Díaz-Marín，H，López Hernández，F，Osuna，O，具有几乎周期振荡输入的酶催化模型溶液的全局动力学，数学化学杂志60（10）：1921-19292022·Zbl 1506.34064号 [24] Bouiteu，A，Goldbeter，A，Hess，B，通过随机、周期和稳定的底物来源控制酵母的糖酵解振荡：模型和实验研究，美国国家科学院院刊72（10）：3829-38331975。 [25] Díaz Marín，H，Lara Aguilar，B，Osuna，O，具有广义质量作用定律的催化模型的周期解，Biomatemática29:59-682019。 [26] Katriel，G，周期性底物输入下酶催化反应周期解的存在性，离散Contin Dyn系统2007:551-5572007·Zbl 1163.34351号 [27] Krupska，A，振荡酶活性对反应动力学的影响：数学模型，《计算生物学杂志》24:1-62017年。 [28] Stoleriu，I，Davidson，F，Liu，J，《周期性输入对酶催化反应准静态假设的影响》，《数学生物学》50:115-1322005年·Zbl 1083.92017年 [29] Díaz-Marín，H，López-Hernández，F，Osuna，O，季节合作系统的概周期解，Ann Pol Math128（1）：1-142022·Zbl 1498.34123号 [30] Korman，P，《细胞体积动力学的周期模型》，Ann Pol Math116:243-2492016年·Zbl 1358.34052号 [31] 玻尔，H，《概周期函数》，切尔西出版公司，纽约，1947年·Zbl 0005.20303号 [32] Cordunenu，C，《概周期函数》，第2版。，切尔西出版公司，纽约，1989年·Zbl 0672.42008号 [33] Hirsch，M，竞争或合作微分方程组：I.极限集，SIAM数学分析杂志13（2）：167-1791982·Zbl 0494.34017号 [34] Smith，H，《单调动力系统：竞争与合作系统理论导论》，第41卷，AMS，1995年·Zbl 0821.34003号 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。