Bryan S.埃尔南德斯。;凯特琳·迪恩·E·布恩迪乔。 幂律动力学系统正稳态的基于网络的参数化。 （英语） Zbl 1522.92023号 数学杂志。化学。 61，第10号，2105-2122（2023）. 小结：稳态通常用于描述化学反应网络（CRN）的长期行为。在2019年，Johnston等人。通过找到与原始CRN等效的动态广义化学反应网络（GCRN），发展了一种参数化CRN正稳态的方法。这些GCRN有两个子结构：化学计量网络和运动序网络。如果每个缺陷（即网络中反应的线性相关性的测量）这两个子结构为零，并且它们都是弱可逆的（即，每个反应都属于一个有向循环），那么正稳态具有已知的参数化。在2023年，Hernandez等人。建议在应用Johnston等人的参数化之前先将CRN分解为独立的子网络，因为较小的子网络比整个网络更容易处理。尽管这些方法可以更广泛地应用，但它们都将大规模作用系统作为示例。然而，在这项工作中，我们说明了这两种方法在涉及幂律动力学的更一般系统中的有用性。特别是，我们将这些方法应用于地球的前工业碳循环模型。更具体地说，我们象征性地求解了其正稳态，这使得我们可以很容易地确定系统集中鲁棒性的一般性。 理学硕士： 92C40型 生物化学、分子生物学 92立方厘米 系统生物学、网络 92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等） 关键词：化学反应网络;幂律动力学;广义化学反应网络;网络翻译;正稳态;正平衡;碳循环模型;绝对集中鲁棒性 软件：github;托瓦兹 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{B.S.Hernandez}和\textit{K.D.E.Buendicho}，J.Math。化学。61，第10号，2105--2122（2023；Zbl 1522.92023） 全文： 内政部 参考文献： [1] Anderies，J。；Carpenter，S。；斯特芬，W。；Rockström，J.，非线性全球碳动力学的拓扑结构：从临界点到行星边界，环境。雷斯莱特。，8, 044-048 (2013) ·doi:10.1088/1748-9326/8/4/044048 [2] 阿西奥，C。；Jose，E。；老挝，A。；Mendoza，E.，生物化学系统的反应网络和动力学，数学。生物科学。，56, 283, 13-29 (2017) ·Zbl 1366.92054号 ·doi:10.1016/j.mbs.2016.10.004 [3] M.Feinberg，化学反应网络讲座（1979年）。威斯康星大学麦迪逊分校数学研究中心的书面讲座。https://crnt.osu.edu/讲座OnReactionNetworks [4] Feinberg，M.，《复杂等温反应器的化学反应网络结构和稳定性I：亏零和亏一定理》，化学。工程科学。，42, 2229-2268 (1987) ·doi:10.1016/0009-2509（87）80099-4 [5] Feinberg，M.，《化学反应网络理论基础》（2019），查姆：斯普林格，查姆·Zbl 1420.92001年 ·doi:10.1007/978-3-030-03858-8 [6] Fortun，N。；Mendoza，E.，通过动力学表示对碳循环模型的比较分析，数学杂志。化学。，61, 896-932 (2023) ·Zbl 1516.92136号 ·doi:10.1007/s10910-022-01442-8 [7] Fortun，N。；门多萨，E。；拉森，L。；Lao，A.，具有反应物决定相互作用的幂律动力学系统的缺陷一算法，J.Math。化学。，56, 2929-2962 (2018) ·Zbl 1406.92800号 ·doi:10.1007/s10910-018-0925-2 [8] N.Fortun，E.Mendoza，L.Razon，A.Lao，《具有反应物决定相互作用的幂律动力学系统的鲁棒性》，《2018年日本几何、图形和运动会会议记录》，J.Akiyama，R.Marcelo，M.Ruiz，Y.E.Uno编辑。计算机科学讲义，第13034卷（Springer，Cham，2021），第106-121页·Zbl 07670962号 [9] 埃尔南德斯，B。；De la Cruz，R.，化学反应网络的独立分解，布尔。数学。生物学，83，7，76（2021）·兹比尔1467.92256 ·doi:10.1007/s11538-021-00906-3 [10] B.Hernandez，D.Amistas，R.De la Cruz，L.Fontanil，A.De los Reyes，E.Mendoza，化学反应网络的独立、关联无关和弱可逆分解。匹配Commun。数学。计算。化学。87(2), 367-396 (2022) ·兹比尔1505.92312 [11] 埃尔南德斯，B。；卢贝尼亚，P。；约翰斯顿，M。；Kim，JK，《推导生化反应网络分析稳态的框架》，《公共科学图书馆·计算》。生物学，19（2023）·doi:10.1371/journal.pcbi.1011039 [12] B.Hernandez，E.Mendoza，A.de los Reyes，幂律动力学系统多稳态的计算方法。数学杂志。化学。58, 56-87 (2020) ·Zbl 1432.92044号 [13] B.Hernandez，E.Mendoza，A.de los Reyes，幂律动力学系统的基本分解和多稳态。匹配Commun。数学。计算。化学。83, 403-434 (2020) ·Zbl 1472.92355号 [14] Hong，H。；埃尔南德斯，B。；Kim，J。；Kim，JK，计算翻译框架确定了具有特殊拓扑结构及其长期动力学的生化反应网络，SIAM J.Appl。数学。，83, 1025-1048 (2023) ·Zbl 1518.92065号 ·数字对象标识码：10.1137/22M150469X [15] Johnston，医学博士，化学反应网络翻译，Bull。数学。生物学，761081-1116（2014）·Zbl 1297.92096号 ·doi:10.1007/s11538-014-9947-5 [16] 约翰斯顿，M。；Burton，E.，使用基本通量模式计算弱可逆缺陷零网络转换，Bull。数学。生物学，81，1613-1644（2019）·Zbl 1415.92085号 ·doi:10.1007/s11538-019-00579-z [17] Johnston，医学博士；缪勒，S。；Pantea，C.，《基于缺陷的生化反应系统正平衡参数化方法》，布尔。数学。生物学，811143-1172（2019）·Zbl 1415.92086号 ·doi:10.1007/s11538-018-00562-0 [18] P.Lubenia，INDECS：网络的非依赖分解。https://github.com/pvnlubenia/INDECS [19] 缪勒，S。；Regensburger，G.，《广义质量作用系统：化学计量和运动序子空间的复杂平衡平衡和符号向量》，SIAM J.Appl。数学。，72, 1926-1947 (2012) ·Zbl 1261.92063号 ·doi:10.1137/110847056 [20] S.Müller，G.Regensburger，《广义质量作用系统和具有实指数和符号指数的多项式方程的正解》（特邀演讲），载于《科学计算中的计算机代数》（CASC 2014），编辑：V.P.Gerdt，W.Koepf，W.M.Seiler，E.V.Vorozhtsov。计算机科学课堂讲稿，第8660卷（Springer，Cham，2014），第302-323页·兹比尔1421.92043 [21] Shinar，G。；Feinberg，M.，《生化反应网络稳健性的结构来源》，《科学》，3271389-1391（2010）·doi:10.1126/科学.1183372 [22] 希纳，G。；Feinberg，M.，《稳健生化反应网络的设计原则：什么有效，什么无效，什么可能有效》，数学。生物科学。，231, 1, 39-48 (2011) ·Zbl 1214.92037号 ·doi:10.1016/j.mbs.2011.02.012 [23] Voit，E.，《生物化学系统的计算分析：生物化学家和分子生物学家实用指南》（2000），剑桥：剑桥大学出版社，剑桥 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。