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考夫曼括号多项式的推广,用于确定和分析RNA二级结构中的结构元素。 (英语) Zbl 1520.57001号

RNA二级结构的测定是RNA生物学领域的重要问题之一。本文作者建立了RNA的数学模型,并构造了纽结理论中经典考夫曼括号多项式的一种新的推广形式,称为(mathcal{RKB})多项式,它被证明是一个拓扑不变量“,允许确定形成RNA二级结构的标准结构元素的类型、数量和特征。为了定义多项式,除了使用考夫曼括号多项式的已知骨架关系外,作者还介绍了“光滑氢键的新骨架关系和核苷酸着色的新技术”。作者还编写了一个Mathematica程序,该程序通过给定的RNA二级结构的点框表示法计算(mathcal{RKB})多项式,并使用该程序“分析bpRNA-1m数据库中的一些RNA二级构造。结果与实际数据相符。”

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57 K10 结理论
57Z10号 流形和细胞复合体与生物学的关系
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