达尔菲亚纳·努尔;大卫·阿林厄姆;朱迪斯·卢梭;蒙格森，克里·L。;麦克维尼什，罗斯 DNA序列分割的贝叶斯隐马尔可夫模型：先验灵敏度分析。 （英语） Zbl 1453.62168号 计算。统计数据分析。 第5期第53页，1873-1882页（2009年）. 小结：考虑了描述DNA序列同质片段的隐马尔可夫模型对先验规范的敏感性。分析了黑猩猩甲胎蛋白基因的一个内含子，该内含子在哺乳动物胚胎发育中起着重要作用。本文考虑了三个主要目标：（i）评估DNA序列分割的贝叶斯隐马尔可夫模型对先验规范的敏感性；（ii）检查将标准Dirichlet previor替换为Dirichle previor混合物的影响；以及（iii）提出并说明使用重要性抽样进行敏感性分析的更全面方法。研究表明：（i）在贝叶斯隐马尔可夫模型下获得的后验估计对先验分布的规格说明确实敏感；（ii）与标准Dirichlet先验相比，混合Dirichle先验更灵活，对超参数的选择不太敏感，分析中的约束更少，从而改进了后验估计；（iii）重要性抽样在计算上是可行的，快速有效的，可以进行更丰富的敏感性分析。 引用于5文件 MSC公司： 62-08 统计问题的计算方法 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 2015年1月62日 贝叶斯推断 2005年6月2日 马尔可夫过程：估计；隐马尔可夫模型 92D20型 蛋白质序列，DNA序列 软件：WinBUGS公司;贝叶斯DA PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{D.Nur}等人，《计算》。统计数据分析。53，第5号，1873--1882（2009；Zbl 1453.62168） 全文： 内政部 哈尔 参考文献： [1] 贝萨格，J。；绿色，P。；希格顿，D。；Mengersen，K.，贝叶斯计算和随机系统，统计。科学。，10, 3-66 (1995) ·Zbl 0955.6252号 [2] 男孩，R.J。；Henderson，D.A.，DNA序列分割的贝叶斯方法，生物计量学，60573-588（2004）·Zbl 1274.62728号 [3] 男孩，R.J。；亨德森，D.A。；Wilkinson，D.J.，使用隐马尔可夫模型检测DNA序列中的同质片段，应用。统计，49，269-285（2000）·Zbl 0944.62108号 [4] Braun，J.V。；Müller，H.-G.，DNA序列分割的统计方法，统计学。科学。，13, 142-162 (1998) ·Zbl 0960.62121号 [5] 布朗，M.P。；Hughey，R。；克罗，A。；米安，I.S。；Sjölander，K。；Haussler，D.，使用狄利克雷混合先验推导蛋白质家族的隐马尔可夫模型，（Hunter，L.；Searls，D.；Shavlik，J.，《第一届分子生物学智能系统国际会议论文集》（ISMB-93）（1993），AAAI/MIT Press:AAAI/MIT Press Menlo Park，CA），47-55 [6] Churchill，G.A.，异质DNA序列的随机模型，B.Math。《生物学》，51，79-94（1989）·Zbl 0662.92012号 [7] 德方佐，V。；Aluffi-Pentini，F。；Parisi，V.，《生物信息学中的隐马尔可夫模型》，Curr。生物信息学，249-61（2007） [8] 杜宾，R。；Eddy，S.R。；Krogh，A。；Mitchison，G.，《生物序列分析》（1998），剑桥大学出版社：剑桥大学出版社·Zbl 0929.92010号 [9] Gelman，A。；卡林，J.B。；斯特恩，H.S。；鲁宾，D.B.，贝叶斯数据分析（1995），查普曼和霍尔：查普曼与霍尔伦敦 [10] Geyer，C.，实用马尔可夫链蒙特卡罗，统计科学，7473-483（1992），（含讨论） [11] 刘，J.S。；Logvinenko，T.，《生物序列分析中的贝叶斯方法》（Bayesian methods in biology sequence analysis）（Balding，D.J.；Bishop，M.；Cannings，C.，《统计遗传学手册》（Handbook of Statistical Genetics）（2003），John Wiley&Sons:John Willey&Sons Chichester），66-93 [12] Lunn，D.J。；托马斯。；贝斯特，N。；Spiegelhalter，D.，WinBUGS-A Bayesian建模框架：概念、结构和可扩展性，统计计算。，10, 325-337 (2000) [13] 麦克唐纳，I.L。；Zucchini，W.，《离散值时间序列的隐马尔可夫和其他模型》（1997），查普曼和霍尔：查普曼与霍尔伦敦·Zbl 0868.60036号 [14] McVinish，R.，Mengersen，K.L.，Nur，D.，Rousseau，J.，Guihenneuc-Jouyaux，C.，《重复MCMC重要性抽样的使用》。昆士兰理工大学数学科学学院，2008年；McVinish，R.，Mengersen，K.L.，Nur，D.，Rousseau，J.，Guihenneuc-Jouyaux，C.，《重复MCMC重要性抽样的使用》。昆士兰理工大学数学科学学院，2008年·Zbl 1329.62129号 [15] Mengersen，K.L。；罗伯特·C·P。；Guihenneuc-Jouyaux，C.，MCMC收敛诊断：综述，（Berger，J.；Bernardo，J.，Dawid，A.P.；Smith，A.F.M.，Bayesian Statistics 6（1999），牛津科学出版社），415-440·Zbl 0957.62019号 [16] Meyn，S.P。；Tweedie，R.L.，《马尔可夫链与随机稳定性》（1993），《施普林格-弗拉格：施普林格伦敦》·兹比尔0925.60001 [17] 西雄，H。；吉布斯，体育硕士；明赫蒂，P.P。；齐林斯基，R。；Dugaiczyk，A.，黑猩猩甲胎蛋白编码基因与大猩猩的结构相似，但与人类的结构不同，gene，162，213-220（1995） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。