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使用非参数二次推理函数测试时间进程微阵列数据中细胞周期模式的重要性。 (英语) Zbl 1452.62854号

摘要:我们开发了一种方法来分析在多个时间点从单个样本获得的时间进程微阵列数据,并确定哪些基因受细胞周期调控。由于一些基因具有相似的基因表达模式,为了减少假设检验的数量,我们首先进行聚类分析,将基因分为具有相似细胞周期模式的类别,包括完全没有细胞周期现象的类别。然后我们建立了一个统计模型和一个推断函数,假设一个聚类中的基因共享相同的平均模型。为了更灵活地拟合时间历程数据,采用了变系数非参数方法。为了合并纵向测量值的相关性,应用二次推理函数方法获得更有效的估计值和更强大的测试。此外,这种方法允许我们进行二次方检验,以确定某些基因是否受细胞周期调控。对细胞周期微阵列数据的数据示例以及模拟进行了说明。

MSC公司:

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62-08 统计问题的计算方法
92C40型 生物化学、分子生物学
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全文: 内政部

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