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空间相关生化网络的线性噪声近似。 (英语) Zbl 1422.92071号

摘要:开发并测试了一种计算反应扩散主方程(RDME)的线性噪声近似(LNA)的算法。RDME通常用作生化反应网络的模型。LNA是针对问题的空间域的一般离散化而导出的。如果\(M)是网络中化学物种的数量,\(N)是空间离散化中的节点数量,那么在简单的实现中,确定概率分布的平均值和协方差的近似值的计算工作与\(M^2N^2)成正比。在我们的LNA算法中,功与(M^2N)成正比。由于\(N\)通常大于\(M,\),这是一个显著的减少。该算法中近似值的精度通过解析估计和数值实验进行评估。

理学硕士:

92C45型 生化问题中的动力学(药代动力学、酶动力学等)
92立方厘米 系统生物学、网络
65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法
第68季度25 算法和问题复杂性分析
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全文: 内政部

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