马努埃拉Geiß;查韦斯，埃德加;马科斯·冈萨雷斯·拉菲特;阿利泽尔·洛佩斯·桑切斯;Bärbel M.R.斯塔德勒。;杜尔塞·瓦尔迪维亚。;马克·赫尔穆特;玛丽贝尔·埃尔南德斯·罗萨莱斯;彼得·斯塔德勒（Peter F.Stadler）。 最佳匹配图。 （英语） Zbl 1415.92133号 J.数学。生物。 78，编号7，2015-2057（2019）; 更正同上，第82号，第6号，第47号文件，第9页（2021年）。 摘要：最佳匹配图作为正形检测算法中的第一个处理中间体自然出现。设（T）是一个系统发育（基因）树（T），（sigma）是（T）的叶子对物种的分配。如果基因\（x\）和\（y\）位于不同的物种中，并且\（y\）与物种\（西格玛（y）\）中包含的所有其他基因相比，可能是\（x\）的许多（进化）近亲之一，则最佳匹配图\（G，\西格玛）\）是一个包含从\（x\）到\（y\）的弧的有向图。这里，我们刻画了最佳匹配图，并证明了它可以在三次时间和二次空间中决定（G，sigma）是否以这种方式从树中导出。如果答案是肯定的，则有一个唯一的最小可分辨树来解释\（G，\ sigma）\，它也可以用立方时间构造。 引用于1审查引用于14文件 MSC公司： 92D15型 与进化有关的问题 92天10分 遗传学和表观遗传学 05C90年 图论的应用 关键词：系统发育组合学;彩色有向图;可达集;等级制度;哈斯图;根三元组;超级树 软件：四重奏;OrthoGNC公司;OMA公司;蛋白质原 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Geiß}等人，《数学杂志》。生物学78，第7期，2015--2057（2019；Zbl 1415.92133） 全文： 内政部 arXiv公司 OA许可证 参考文献： [1] Aho A，Sagiv Y，Szymanski T，Ullman J（1981）用关系表达式优化应用程序从最低共同祖先推断树。SIAM J计算10:405-421·Zbl 0462.68086号 ·数字对象标识代码：10.1137/021030 [2] Aho AV，Garey MR，Ullman JD（1972）有向图的传递约简。SIAM J计算1:131-137·Zbl 0247.05128号 ·数字对象标识代码：10.1137/021008 [3] 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