×

生活条件下的一般酶速率方程。 (英语) Zbl 1402.92223号

小结:基于我们在耦合多代谢途径动力学建模方面的经验,我们提出了一个用于代谢动力学动力学建模的通用速率方程。它的对称形式使动力学参数(或函数)易于与数据库中的值关联并在计算中使用。此外,这种形式适用于任意数量的底物和具有不同化学计量比的产品。我们明确地说明了如何精确地获得各种结合机制的速率方程。因此,所提出的速率方程在形式上是严格的。讨论了这种通用速率方程的各种特征。对于不可逆反应,酶反应直接产生的产物抑制以自然方式消除。我们还讨论了如何包括修饰语和协同作用的影响。

MSC公司:

92C45型 生化问题中的动力学(药代动力学、酶动力学等)
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用

参考文献:

[1] DOI:10.1016/S0047-6374(02)00164-1·doi:10.1016/S0047-6374(02)00164-1
[2] DOI:10.1007/978-1-59745-531-2·doi:10.1007/978-1-59745-531-2
[3] Yang K.,公共科学图书馆计算。生物3第523页–
[4] DOI:10.1126/科学.1132067·doi:10.1126/科学.1132067
[5] Stephanopulos G.N.,《代谢工程:原理和方法》(1998年)
[6] 内政部:10.1142/9789812388773·电话:10.1142/9789812388773
[7] 内政部:10.1016/S0006-3495(02)75150-3·doi:10.1016/S0006-3495(02)75150-3
[8] Kholodenko B.N.,《后基因组时代的代谢工程》(2004)
[9] DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2004.03.002·doi:10.1016/j.pbiomolbio.2004.03.002
[10] DOI:10.1016/j.bpc.2004.12.001·doi:10.1016/j.bpc.2004.12.001
[11] DOI:10.1017/CBO9780511790515·doi:10.1017/CBO9780511790515
[12] Bruggeman F.J.,计算系统生物学(2006)
[13] Cha S.,J.生物。化学。第820页,共243页
[14] Segel H.,酶动力学。快速平衡和稳态酶系统的行为与分析(1975)
[15] 内政部:10.1016/j.compchemeng.2005.007·doi:10.1016/j.compchemeng.2005.0007
[16] 朱晓明,Funct。集成。基因组学4第188页–
[17] Kim K.Y.,公共科学图书馆计算。生物3第565页–
[18] 内政部:10.1093/nar/30.1.47·doi:10.1093/nar/30.1.47
[19] 内政部:10.1093/nar/gkh081·doi:10.1093/nar/gkh081
[20] 内政部:10.1093/nar/gkj102·doi:10.1093/nar/gkj102
[21] 内政部:10.1093/nar/gkh100·doi:10.1093/nar/gkh100
[22] 内政部:10.1093/nar/gkj128·doi:10.1093/nar/gkj128
[23] 研讨会,硅生物学-补充7(德国海德堡,2007)pp。01–10.
[24] DOI:10.1049/ip-syb:20060012·doi:10.1049/ip-syb:20060012
[25] Michaelis L.,《生物化学》。Z.49第333页-
[26] 内政部:10.1038/nchembio759·doi:10.1038/nchembio759文件
[27] 数字对象标识码:10.1042/bj0190338·doi:10.1042/bj0190338
[28] Ciliberto A.,公共科学图书馆计算。生物3第463页–
[29] DOI:10.1049/ip-syb:20060026·doi:10.1049/ip-syb:20060026
[30] 内政部:10.1080/14756360600829381·doi:10.1080/14756360600829381
[31] Cornish-Bowden A.,《生物化学家》。第27页,第11页
[32] Morowitz H.J.,《细胞生命的开始:代谢概述生物发生》(1992年)
[33] Cornish-Bowden A.,《酶动力学基础》(2004)
[34] Schenll S.,评论Theor。生物8第169页–
[35] Leskovac V.,《综合酶动力学》(2003)
[36] DOI:10.1002/位21316·doi:10.1002/位21316
[37] Hill A.V.,《生理学杂志》。伦敦。40页iv–
[38] Cornish-Bowden A.公司。申请。Biosci公司。第13页,第377页
[39] DOI:10.1002/位20558·doi:10.1002/bit.20558
[40] DOI:10.1016/j.bej.2006.11.002·doi:10.1016/j.bej.2006.11.002
[41] DOI:10.128/JB.185.110.2980-2987.2003·doi:10.1128/JB.185.10.2980-2987.2003
[42] 数字对象标识码:10.1002/位10200·doi:10.1002/bit.10200
[43] 数字对象标识码:10.1002/位10745·doi:10.1002/位10745
[44] DOI:10.1146/anurev.micro.60.080805.142308·doi:10.1146/annurev.micro.60.080805.142308
[45] Nobuyoshi I.,代谢组学1,第29页-
[46] DOI:10.1016/j.tibs.2004.11.002·doi:10.1016/j.tibs.2004.11.002
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。