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植物生长的非线性混合效应模型,并通过EM算法的随机变量进行估计。 (英语) Zbl 1341.62310号

小结:植物之间,甚至同一品种之间,都有很强的遗传变异性,再加上某一特定领域中局部变化的环境条件,可能导致相邻植物之间差异很大。这就是为什么基于种群的植物生长建模方法非常有趣的原因之一。GreenLab是一个功能结构的植物生长模型,已经证明它能够成功地主要在个体水平描述植物生长动态。在本研究中,我们将其公式扩展到人口水平。为了对一些固定但未知的重要生物物理和遗传参数的偏差进行建模,我们引入了随机效应。由此产生的模型可以转换为非线性混合模型的框架,可以看作是不完全数据模型的特定类型。通常需要EM型算法的随机变量(期望最大化)来对这类模型进行最大似然估计。在某些假设下,完全数据分布属于指数分布族的一个子类,其中M步可以显式求解。在这种情况下,人们的兴趣集中在通过相互竞争的模拟方法来最佳逼近E步。在这个方向上,我们建议比较两种常用的随机算法:蒙特卡罗EM(MCEM)和SAEM算法。在模拟数据上比较了这两种算法的性能,并给出了在甜菜植株实际数据上的应用。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
65二氧化碳 蒙特卡罗方法
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全文: 内政部 哈尔

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