圣埃芬尼港 的动力学在体外中间纤维长度分布。 (英语) Zbl 1330.92047号 J.西奥。生物。 332, 20-29 (2013)。 摘要:考虑使用关联速率常数显式表达式的聚合模型进行研究在体外III型中间纤维长度分布动力学。考虑了对纤维特性和聚集概率的不同假设,得出了四种模型。通过将模型响应与实验数据进行拟合,可以确定最合适的模型来表示装配的每个时间点。模型的组合允许构建一个混合模型,该模型很好地代表了完整的组装动力学:研究发现,当聚集涉及至少一个短纤维时,速率常数相对于纤维尺寸减小,而对于较长的纤维,速率常数几乎与尺寸无关。因此,纤丝的柔性在中间纤丝的组装中非常重要。 引用于4文件 MSC公司: 92C40型 生物化学、分子生物学 92C45型 生化问题中的动力学(药代动力学、酶动力学等) 关键词:长度分布;聚合;装配动力学;中间纤维 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Portet},J.Theor。生物.332,20--29(2013;Zbl 1330.92047) 全文: 内政部 参考文献: [1] 巴伯勒,M.U。;Morbidelli,M.,聚集-碎裂种群平衡方程的分析及其在凝血中的应用,胶体界面科学杂志。,316, 428-441 (2007) [2] O.G.Berg。;von Hippel,P.H.,《扩散控制的大分子相互作用》,年。生物物理学评论。生物物理学。化学。,131-168年(1985年) [3] 科拉科格鲁,G。;Brown,A.,《中间纤维通过端到端退火沿其长度交换亚单位并伸长》,《细胞生物学杂志》。,185, 769-777 (2009) [4] Doi,M。;Edwards,S.F.,《聚合物动力学理论》。聚合物动力学理论,国际物理学专著系列,第73卷(1986),牛津科学出版社 [5] 多尔西,R。;Mayer,W.,《多最优、不可微和其他不规则特征估计问题的遗传算法》,J.Bus。经济。统计,13,53-66(1995) [6] Edelstein-Keshet,L。;Ermentrout,G.B.,肌动蛋白丝长度分布模型。简单聚合和断裂,Bull。数学。生物学,6444-475(1998)·Zbl 1053.92503号 [7] Garcia de la Torre,J。;Lopez Martinez,M.,从平移和旋转扩散系数得出的短棒状大分子的尺寸。革兰菌素二聚体的研究,生物聚合物,23611-615(1984) [8] 哈诺,L。;温克勒,R。;Reineker,P.,《稀溶液中半柔性大分子的动态结构因子》,J.Chem。物理。,104, 6355-6368 (1996) [9] Herrmann,H。;Aebi,U.,《中间丝状分子结构、组装机制和整合成功能不同的细胞内支架》,Annu。生物化学评论。,73, 749-789 (2004) [10] Herrmann,H。;Bär,H。;Kreplak,L。;斯特雷尔科夫,S.V。;Aebi,U.,《从细胞结构到纳米力学的中间丝状物》,《分子细胞生物学》。,8, 1-12 (2007) [11] Hill,T.L.,平衡线性聚集体端到端关联和解离的速率常数的长度依赖性,生物物理。J.,44,282-288(1983) [12] 胡,J。;Matzavinos,A。;Othmer,H.G.,《肌动蛋白丝动力学的理论方法》,J.Stat.Phys。,128, 111-138 (2007) ·兹比尔1118.92005 [13] 胡,J。;Othmer,H.G.,《肌动蛋白和其他聚合物中纤维长度波动的理论分析》,J.Math。生物学,631001-1049(2011)·Zbl 1234.92013年 [14] Kirmse,R。;波特,S。;穆克,R。;Aebi,美国。;Herrmann,H。;Langowski,J.,《四聚体波形蛋白中间丝体外组装的定量动力学模型》,J.Biol。化学。,282, 18563-18572 (2007) [15] 穆克,N。;Kreplak,L。;Kirmse,R。;韦迪格,T。;Herrmann,H。;Langowski,J.,《用原子力显微镜评估中间纤维的柔韧性》,J.Mol.Biol。,335, 1241-1250 (2004) [16] Pallitto先生。;Murphy,R.,变性状态下纤维生长动力学的数学模型,Biophys。J.,81,1805-1822(2001) [17] 波普,D。;新南威尔士州政府。;M.Iwasa。;Maeda,Y.,短程力对纤维细胞骨架蛋白长度分布的影响,生物聚合物,89,711-721(2008) [18] 波特,S。;穆克,N。;Kirmse,R。;Langowski,J。;贝尔,M。;Herrmann,H.,组装过程中纤维长度分布的体外测量和数学建模中的Vimentin中间纤维形成,Langmuir,258817-8823(2009) [19] 秦,Z。;Kreplak,L。;Buehler,M.,《层次结构控制波形蛋白中间丝的纳米机械性能》,《PLoSOne》,4,e7294(2009) [20] Sihag,R.K。;稻垣祯一,M。;山口,T。;Shea,T.B。;Pant,H.C.,磷酸化对III型和IV型中间丝结构动力学和功能的作用,实验细胞研究,3132098-2109(2007) [21] Steinert,P.M。;Marekov,L.N。;Parry,D.A.,《中间纤维结构的多样性》。有证据表明,波形蛋白中线圈分子的排列与角蛋白中间丝中的不同,J.Biol。化学。,26824916-24925(1993年) [22] 冯·希佩尔,P.H。;Berg,O.G.,《促进生物系统中的目标定位》,J.Biol。化学。,264, 675-678 (1989) [23] 温海姆,S。;希尔布,A.R。;西尔伯曼,M。;苏尔曼,E.-M。;韦迪格,T。;Herrmann,H。;Langowski,J。;Mücke,N.,通过全内反射荧光显微镜(TIRFM)解构波形蛋白组装的晚期,PLoS One,6,e19202(2011) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。