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M.M.Ellabaan。;S.D.Handoko。;Ong，Y.S。;郭，C.K。;南卡罗来纳州巴纳西。;F.M.埃拉萨维。;马，H.Y。

一种用于优化环缺陷分子的树结构共价键驱动分子模因算法。 （英语） Zbl 1268.90144号

计算。数学。应用。 64，第12号，3792-3804（2012）.
摘要：随着科学和工程领域的巨大成功，进化计算的最新进展，尤其是模因计算，正在分子优化界引起越来越多的关注。在这篇论文中，我们的兴趣是介绍一种模因计算方法，用于发现共价键合分子的低能稳定构象（也称为立体异构体），因为此类分子在自然界中的丰富性及其在生物和化学中的重要性。对于优化算法来说，在搜索立体异构体的过程中保持同一组键是一个很大的挑战。避免空间效应，即防止原子相互重叠或过于靠近，是分子优化的另一个挑战。针对这些挑战，本文首先介绍了三种新颖的基于自然启发的树进化算子。然后提出了一种树结构共价键驱动的分子模因算法（TCM-MA），该算法使用三种新的进化算子专门处理涉及共价键但不包含环状结构的分子，用于高效搜索环缺陷共价键分子的立体异构体。通过使用谷氨酸作为感兴趣的样本分子进行的实证研究，我们发现，与其他两种最先进的算法相比，拟议的TCM-MA在几乎五倍的计算预算内发现了多达十六倍的立体异构体。

理学硕士：

90 C59 数学规划中的近似方法和启发式
92E10型 分子结构（图形理论方法、微分拓扑方法等）

关键词：

进化优化;分子优化;Memetic算法;神经科学;谷氨酸;立体异构体

软件：

药物数据库;ChEMBL公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.M.Ellabaan}等人，计算。数学。申请。64，第12号，3792--3804（2012；Zbl 1268.90144）
全文： 内政部

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