×

AD模型生成器:使用自动微分对高度参数化的复杂非线性模型进行统计推断。 (英语) Zbl 1242.90230号

摘要:统计参数估计的许多标准,如最大似然,都被公式化为一个非线性优化问题。自动微分模型生成器(ADMB)是一种基于自动微分的编程框架,针对具有大量参数的高度非线性模型。使用AD的好处是计算效率和高数值精度,这两者在许多实际问题中都至关重要。我们描述了ADMB的基本组件和基本原理,重点介绍了其他统计软件中没有的功能。这种特性的一个例子是用于潜在变量模型的高维积分的拉普拉斯近似的通用实现。我们还回顾了使用ADMB的文献,并讨论了ADMB作为开源项目的未来发展。总的来说,ADMB的主要优点是灵活性、速度、精度、稳定性和量化不确定性的内置方法。

MSC公司:

90立方 非线性规划
90 C90 数学规划的应用
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部 链接

参考文献:

[1] ADMB项目。2008年,“用于非线性建模和统计的AD模型生成器简介”。檀香山,HI 9.0.0版,ADMB基金会
[2] ADMB项目。2008.“AUTODIF:一种用于非线性建模和统计的具有自动微分功能的C++数组语言扩展”。檀香山HI ADMB基金会
[3] AD Model Builder:ADMB-RE用户指南(2009)中的随机效果
[4] 数字对象标识码:10.1139/F09-142·doi:10.1139/F09-142
[5] DOI:10.1016/S0096-3003(99)00230-1·Zbl 1024.65010号 ·doi:10.1016/S0096-3003(99)00230-1
[6] Bischof C.,科学。程序。第1页-(1992年)
[7] 内政部:10.1111/j.1748-7692.2004.tb01190.x·doi:10.1111/j.1748-7692.2004.tb01190.x
[8] 内政部:10.1139/f03-046·doi:10.1139/f03-046
[9] DOI:10.193/2008-469·doi:10.2193/2008-469
[10] Carlin B.P.,数据分析的贝叶斯和经验贝叶斯方法(1996)·兹比尔0871.62012
[11] Cui G.,J.鲸类资源管理。第4页123–(2002)
[12] DOI:10.1098/rspb.2009.1106·doi:10.1098/rspb.2009.1106
[13] 内政部:10.1111/j.1467-8276.2007.01025.x·文件编号:10.1111/j.1467-8276.2007.01025.x
[14] DOI:10.1371/journal.pone.0012114·doi:10.1371/journal.pone.0012114
[15] 内政部:10.1139/f87-051·doi:10.1139/f87-051
[16] 内政部:10.1139/f89-130·数字对象标识代码:10.1139/f89-130
[17] 内政部:10.1139/f98-100·doi:10.1139/f98-100
[18] 内政部:10.1139/f90-032·doi:10.1139/f90-032
[19] Gay,D.M.,1996。非线性AMPL模型的更多AD:计算Hessian信息和利用部分可分性,在计算微分:技术、应用和工具中,编辑:Berz,M.,Bischof,C.,Corliss,G.和Griewank,A.173–184。宾夕法尼亚州费城:SIAM·Zbl 0866.65018号
[20] Gelman A.,贝叶斯数据分析(1995)
[21] Griewank A.,评估导数:算法微分的原理和技术(2000)·Zbl 0958.65028号
[22] Griewank A.,《算法的自动区分:理论、实现和应用》(1992年)
[23] 内政部:10.1145/229473.229474·Zbl 0884.65015号 ·数字对象标识代码:10.1145/229473.229474
[24] DOI:10.1071/MF01049·doi:10.1071/MF01049
[25] Hascoöt L.,TAPENADE 2.1用户指南(2004)
[26] Hilborn,R.、Maunder,M.、Parma,A.、Ernst,B.、Payne,J.和Starr,P.,2003年。”科尔林:广义年龄结构股票评估模型”。西雅图:华盛顿大学。版本2.0,代表SAFS-UW-0116
[27] 内政部:10.1038/358410a0·doi:10.1038/358410a0
[28] DOI:10.4319/lo.2010.55.3.1047·doi:10.4319/lo.2010.55.3.1047
[29] 霍伊尔博士,阿尼姆。生物制品。欺骗。第27页第247页–(2004年)
[30] Kim S.W.,通过MTDg与交互作用对四种桉树的开花建模,第2625页–(2009)
[31] DOI:10.1534/genetics.106.055350·doi:10.1534/genetics.106.055350
[32] 内政部:10.1016/j.tpb.2009.12.003·doi:10.1016/j.tpb.2009.12.003
[33] 内政部:10.1666/08080.1·doi:10.1666/08080.1
[34] 内政部:10.1093/aje/kwk107·doi:10.1093/aje/kwk107
[35] Magnusson A.,ADMB基金会新闻。1(3)第1页–(2009)
[36] 内政部:10.1111/j.1467-2979.2007.00258.x·doi:10.1111/j.1467-2979.2007.00258.x
[37] Martin,J.L.,Prager,M.H.和Stephens,A.,2006年。”ADMB2R用户指南:一组与R统计语言兼容的AD模型生成器输出例程”。佛罗里达州迈阿密:NOAA。技术备忘录。NMFS-SEFSC-546型
[38] 内政部:10.1139/f01-029·doi:10.1139/f01-029
[39] Maunder M.N.,ADMB基金会新闻。2(1)第3页–(2010年)
[40] Maunder M.N.,跨大西洋特罗普。金枪鱼公牛。第22页,433页–(2003年)
[41] Maunder M.N.,公牛。3月科学。79页545–(2006)
[42] Maunder M.N.,渔业人口动态中的计算机,收录于《渔业研究中的计算机》第337页–(2009年)·doi:10.1007/978-1-4020-8636-6_11
[43] Maunder,M.N.、Skaug,H.J.、Fournier,D.A.和Hoyle,S.D.,2009年。标记再捕获模型估计量的比较:随机效应、分层贝叶斯和AD模型构建器,在标记人群中建模人口统计过程,编辑:Thomson,D.L.、Cooch,E.G.和Conroy,M.J.917–948。纽约:斯普林格。
[44] Methot,R.D.Jr.,2009。《种群评估:支持渔业管理的操作模型》,载于《北美渔业科学的未来》,编辑:Beamish,R.J.和Rothschild,B.J.137–165。纽约:斯普林格。
[45] 数字对象标识码:10.1111/1368-423X.t01-1-00116·兹比尔1065.91533 ·doi:10.1111/1368-423X.t01-1-00116
[46] 内政部:10.1006/jcph.1994.1054·Zbl 0797.65115号 ·doi:10.1006/jcph.1994.1054
[47] 内政部:10.1139/f07-064·doi:10.1139/f07-064
[48] DOI:10.1016/j.biocon.2009.03.024·doi:10.1016/j.biocon.2009.03.024
[49] Parma,A.M.,2002。《贝叶斯方法在太平洋比目鱼种群评估中的不确定性分析》,《将不确定性纳入渔业模型》,编辑:Berkson,J.M.、Kline,L.L.和Orth,D.J.113–136。马里兰州贝塞斯达:美国渔业协会。
[50] DOI:10.1016/j.insmatheco.2008.03.010·Zbl 1140.91426号 ·doi:10.1016/j.insmateco.2008.03.010
[51] Punt A.E.,渔业贝叶斯种群评估方法:用户手册12(2001)
[52] 内政部:10.1006/jmsc.1999.0538·doi:10.1006/jmsc.1999.0538
[53] DOI:10.1071/MF01008·doi:10.1071/MF01008
[54] Schnute J.,ICES J.Mar.科学。第64页,第1077页–(2007年)
[55] Schnute,J.T.、Richards,L.J.和Olsen,N.1998。渔业种群评估模型中的统计、软件和鱼类种群评估。编辑:Funk,F.、Quinn Ii,T.J.、Heifetz,J.、Ianelli,J.N.、Powers,J.E.、Schweigert,J.F.、Sullivan,P.J.和Zhang,C.I.171-184。费尔班克斯海洋补助计划
[56] DOI:10.1016/j.pocean.2008.06.003·doi:10.1016/j.pocean.2008.06.003
[57] 内政部:10.1139/f99-017·数字对象标识代码:10.1139/f99-017
[58] 内政部:10.1080/10618600.1995.10474671·doi:10.1080/10618600.1995.10474671
[59] DOI:10.1016/j.csda.2006.03.005·Zbl 1157.65317号 ·doi:10.1016/j.csda.2006.03.005
[60] DOI:10.1093/icesjms/fsm118·doi:10.1093/icesjms/fsm118
[61] DOI:10.1139/f04-020·文件编号:10.1139/f04-020
[62] DOI:10.1016/j.icesjms.2005.05.010·doi:10.1016/j.icesjms.2005.05.010
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。