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假结RNA的组合设计。 (英语) Zbl 1156.92018号

摘要:我们列举了具有给定最小堆叠长度(sigma)的非交叉RNA假结结构。本文的一个主要结果是其数量的渐近公式:
\[T_{k,\sigma}(n)\simn^{-((k-1)^2+(k-1”/2)}\gamma^{-n}_{k,\西格玛},\]
其中\(\kappa{k,\sigma}\)显式已知。我们的结果表明,没有孤立碱基对的(k)-非交叉结构的数目明显小于所有(k)–非交叉结构。特别地,我们证明,对于大的(n),具有堆栈长度(geq 2)的3-和4-非交叉RNA结构的数量由下式给出
\[311.2470(4!/(n(n-1)\cdots(n-4))2.5881^n\]
和(1.217\cdot 10^7n^{-21/2},3.0382^n)。我们的结果对预测算法具有重要意义,并为RNA假结结构的中性网络的存在提供了证据。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
2016年1月5日 渐进枚举
92-08 生物学问题的计算方法
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全文: 内政部

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