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通过利用序列重复加快HMM解码和训练。 (英语) Zbl 1138.68420号

马斌(编辑)等,组合模式匹配。2007年7月9日至11日在加拿大伦敦举行的CPM 2007第18届年度研讨会。诉讼程序。柏林:施普林格出版社(ISBN 978-3-540-73436-9/pbk)。计算机科学课堂讲稿4580,4-15(2007)。
摘要:我们提出了一种方法来加速用于解决离散时间无关HMM的HMM解码和训练问题的动态程序算法。我们讨论了我们的方法在维特比解码和训练算法以及前向-后向和Baum-Welch算法中的应用。我们的方法是基于识别观察到的输入序列中的重复子串。我们描述了三种基于字节对编码(BPE)、游程编码(RLE)和Lempel-Ziv(LZ78)解析的算法。与Viterbi算法相比,我们使用BPE实现了\(\Omega(r)\)的加速比,使用RLE实现了~(\Omega(\frac{r}{\logr}))的加速比及使用LZ78实现了\是其压缩比(在每个压缩方案下)。我们的实验结果表明,我们的新算法在实践中确实更快。此外,与维特比算法不同,我们的算法具有高度的并行性。
关于整个系列,请参见[Zbl 1136.68008号].

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68页30 编码和信息理论(压缩、压缩、通信模型、编码方案等)(计算机科学方面)
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