谢恩·詹森(Shane T.Jensen)。;杰瑞德·帕克;亚历山大·布劳恩斯坦(Alexander F.Braunstein)。;乔恩·麦考利夫 HIV对治疗的进化反应的贝叶斯层次模型。 (英语) Zbl 1288.62160号 美国统计协会。 108,第504号,1230-1242(2013). 综述:治疗人类免疫缺陷病毒(HIV)感染的一个主要挑战是开发耐治疗菌株。我们提出了一个统计模型,该模型量化了接触特定疗法时HIV人群的演变。分层贝叶斯方法用于估计治疗组和对照组序列之间核苷酸变化率的差异。每个组的发病率可以随HIV基因组的空间变化而变化。我们采用合并结构来处理治疗和控制HIV人群中的序列多样性。我们在模拟中评估了该模型,并估计了HIV在两种不同应用中的进化:传统药物治疗和反义基因治疗。在这两项研究中,我们都发现了HIV人群中进化逃避反应的证据。 引用于1文件 MSC公司: 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析 2015年1月62日 贝叶斯推断 92 C50 医疗应用(通用) 关键词:成膜助剂;MCMC公司;PAC可能性;病毒进化 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.T.Jensen}等人,《美国统计协会期刊》第108卷,第504期,第1230--1242页(2013年;Zbl 1288.62160) 全文: 内政部 参考文献: [1] Bass B.L.,《生物化学年鉴》71,第817页–(2002年)·doi:10.146/annrev.biochem.71.1106001.135501 [2] Chipman H.,《应用统计年鉴》,第4页,第266页——(2008年)·Zbl 1189.62066号 ·doi:10.1214/09-AOAS285 [3] Fearnhead P.,《遗传学》159第1299页–(2001年) [4] Felsenstein J.,《分子生物学与进化》,第13页,93–(1996)·doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025575 [5] Geman S.,IEEE模式分析和机器智能事务6 pp 721–(1984)·Zbl 0573.62030号 ·doi:10.1109/TPAMI.1984.4767596 [6] Green P.J.,《生物统计学》82第711页–(1995年)·Zbl 0861.62023号 ·doi:10.1093/biomet/82.4.711 [7] Griffiths R.,《计算生物学杂志》3第479页–(1996)·doi:10.1089/cmb.1996.3.479 [8] Hastings W.,《生物统计学》57第97页–(1970)·Zbl 0219.65008号 ·doi:10.1093/生物技术/57.197 [9] Hein J.,《基因系谱、变异和进化:凝聚理论入门》(2005) [10] Hudson R.,《理论种群生物学》,第23页,183–(1983)·Zbl 0505.62090号 ·doi:10.1016/0040-5809(83)90013-8 [11] --,《生物信息学》,第18页,第337页–(2002年)·Zbl 1153.92001年 ·doi:10.1093/bioinformatics/18.2.337 [12] 金曼J.,《随机过程及其应用》,第13页,235–(1982)·Zbl 0491.60076号 ·doi:10.1016/0304-4149(82)90011-4 [13] 李娜,《遗传学》165页2213–(2003) [14] 卢欣,《病毒学杂志》78页7079–(2004)·doi:10.1128/JVI.78.13.7079-7088.2004 [15] McGuire G.,《分子生物学与进化》,第18页,481页–(2001年)·doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a003827 [16] Mukherjee R.,《分子疗法》第18卷第803页-(2010)·doi:10.1038/mt.2009.316 [17] Nishikura K.,《生物化学年鉴》79,第321页–(2010年)·doi:10.1146/annurev-biochem-060208-105251 [18] Rabiner L.R.,IEEE 77会议录,第257页–(1989)·数字对象标识代码:10.1109/5.18626 [19] Rambaut A.,《计算机在生物科学中的应用》,第13页,第235页–(1997年) [20] Ray N.,《病毒学杂志》81第3240页–(2007年)·doi:10.1128/JVI.02413-06 [21] Robertson D.L.,《自然》374页,第124页–(1995年)·数字对象标识代码:10.1038/374124b0 [22] Schierup M.H.,《遗传学》156第879页–(2000年) [23] 艾滋病规划署,《艾滋病流行最新情况:艾滋病毒/艾滋病特别报告》,联合国艾滋病毒/艾滋病联合规划署(2006年) [24] Wild C.,《艾滋病研究与人类逆转录病毒》9,第1051页–(1993年)·doi:10.1089/aid.1993.9.1051 [25] Wilson D.J.,《遗传学》172第1411页–(2006年)·doi:10.1534/genetics.105.044917 [26] Wulff B.-E.,《自然评论》12,第81页–(2011年)·doi:10.1038/nrg2915 [27] Wyatt R.,《病毒学杂志》69,第5723页–(1995) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。