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马格努斯伯德威奇;查尔斯·森普尔

计算一致进化历史中杂交事件的最小数量。 （英语） Zbl 1111.92041号

离散应用程序。数学。 155，第8期，914-928（2007）.
摘要：现在有充分的证据表明，一组现代物种之间的进化关系结构不一定是树状的。这是因为网状事件，如杂交，意味着物种是来自不同祖先的基因的混合物。由于此类事件相对罕见，生物学家的一个基本问题是确定解释单一（杂交）系统发育中给定（输入）数据集所需的杂交事件的最小数量。
本文的主要结果表明，计算这个最小数是APX-hard，因此NP-hard，在输入是当前物种集合上的系统发育树集合的情况下。这回答了最近在一次会议上提出的一个问题[系统发生组合学和应用，乌普萨拉大学（2004）]。由于这些结果，我们还更正了之前发布的NP-hardness证明[L·王等，《计算杂志》。生物8，69–78（2001）]在这种情况下，输入是二进制序列的集合，其中每个序列代表一个特定现代物种的属性。这些问题的APX硬度意味着不太可能有一种有效的算法来精确计算结果或将其近似到任意精度。

引用于30文件

理学硕士：

92D15型 与进化有关的问题
05二氧化碳 树
65年20月 数值算法的复杂性和性能
05C90年 图论的应用

关键词：

根系统发育树;网状进化;杂交系统发育;系统发育网络;协议森林;有根子树的修剪与再生
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Bordenwich}和\textit{C.Semple}，离散应用程序。数学。155，编号8，914-928（2007年；兹bl 1111.92041）
全文： 内政部

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