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Kim，Haejin先生;文恩忠;月亮，宋丘;Ho-Jin Jung;杨利奥;永勋公园;你好，穆扬;Cheon，Mookyung公司;张一洙;Han，Dong Soo（韩东秀）

基于氨基酸序列评估蛋白质相对热稳定性的新方法：TargetStar。 （英文） Zbl 1417.92046号

国际期刊修订版。物理学。C类 18，第10号，1513-1526（2007）.
摘要：已经发展了几种计算方法来解决蛋白质热稳定化问题。它们的一个共同缺点是，它们必须具有蛋白质骨架结构的信息，才能生成适当的氨基酸序列。在本文中，我们结合计算生物学和统计物理，提出了一种称为TargetStar的新方法，其中，使用近似配分函数和比热计算蛋白质的折叠转变温度，然后仅基于氨基酸序列预测给定蛋白质的相对热稳定性。为了评估TargetStar的预测准确性，我们使用该方法计算了289个同源蛋白对的折叠转变温度，其中每个蛋白对包含一个高温蛋白和一个中温蛋白。根据我们的评估，高温和中温蛋白质在相对热稳定性方面相互区别，预测准确率为77%。因此，TargetStar可以作为一种有效的方法，在进行昂贵且耗时的诱变实验之前，设计具有所需热稳定性的目标蛋白质的氨基酸序列。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92D20型 蛋白质序列，DNA序列
80A99型 热力学和传热

关键词：

氨基酸序列;蛋白质热稳定化;蛋白质能量功能;极端嗜热;嗜中温的;折叠展开转换
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{H.Kim}等人，国际期刊Mod。物理学。C 18，第10号，1513--1526（2007；Zbl 1417.92046）
全文： DOI程序

参考文献：

[1] 数字对象标识码：10.1111/j.1432-1033.1991.tb16426.x·文件编号：10.1111/j.1432-1033.1991.tb16426.x
[2] DOI:10.1016/S0959-440X（98）80094-8·doi:10.1016/S0959-440X（98）80094-8
[3] 内政部：10.1006/jmbi.1997.1042·doi:10.1006/jmbi.1997.1042
[4] 内政部：10.1073/第952.11.12300号·doi:10.1073/pnas.95.21.12300
[5] 数字对象标识码：10.1073/pnas.96.7.3578·doi:10.1073/pnas.96.7.3578
[6] DOI:10.1074/jbc。C000497200号·doi:10.1074/jbc。C000497200号
[7] 内政部：10.1006/jmbi.1999.2889·文件编号：10.1006/jmbi.1999.2889
[8] DOI:10.1016/S0969-2126（00）00133-7·doi:10.1016/S0969-2126（00）00133-7
[9] 内政部：10.1016/S0958-1669（99）80070-6·doi:10.1016/S0958-1669（99）80070-6
[10] 数字对象标识码：10.1110/ps.4580102·doi:10.1110页/第4580102页
[11] DOI:10.1038/nsb0698-470·doi:10.1038/nsb0698-470
[12] DOI:10.1016/S0022-2836（03）00888-X·doi:10.1016/S0022-2836（03）00888-X
[13] DOI:10.1126/科学.1107387·doi:10.1126/science.1107387
[14] 数字对象标识码：10.1002/pro.55600511·doi:10.1002/pro.5560050511
[15] DOI:10.1073/pnas.97.19.10383·doi:10.1073/pnas.97.19.10383
[16] 内政部：10.1073/pnas.241133698·doi:10.1073/pnas.241133698
[17] Cheon M.，J.韩国物理学。Soc.45第550页
[18] Reichl L.E.，统计物理现代课程（1980）·Zbl 0913.00015号
[19] DOI:10.1103/PhysRevE.72.011906·doi:10.1103/PhysRevE.72.011906
[20] 内政部：10.1038/358086a0·数字对象标识代码：10.1038/358086a0
[21] 内政部：10.1038/357543a0·数字对象标识代码：10.1038/357543a0
[22] 贝叶斯T.，M.D.计算。第8页157–
[23] 内政部：10.1093/nar/25.17.3389·doi:10.1093/nar/25.17.3389
[24] Bohman K.，分子遗传学。76第53页–
[25] De Farias S.T.，《基因组生物学》。三
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